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circRNA 配列設計

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IVT RNA

circRNA 配列設計

Yaohai Bio-Pharma は、PIE システム (エクソンとイントロンのアライメント) に基づいて circRNA を製造します。PIE システムでは、I 型イントロンの自己スプライシング機能を利用して RNA の環化を実現します。PIE 構造は、T4 td 遺伝子または fishy tRNA 前駆体遺伝子を使用して設計され、配置は次のとおりです。

RNAイントロンとそれを支えるエクソン断片は5つの部分（3'末端と5'末端）に分割され、3'末端配列は標的配列の末尾に転送され、XNUMX'末端配列は標的配列の先頭に挿入され、標的遺伝子配列は中間に挿入されます。

未定義

PIE 構造は、GTP の触媒作用により、イントロン以外の配列の環化を引き起こします。合理的な環化率向上戦略と組み合わせることで、Yaohai Bio-Pharma は 4 kb までの配列の環化を 80% を超える環化率で達成できます。

未定義

図1. PIEシステムに基づくcircRNAのin vitro循環

サービス詳細
プロセスオプションサービスサービスの詳細配達期間（営業日）
circRNA配列設計と最適化コード配列の設計と最適化

CDS配列アライメント

CDSコドン最適化

1
非コード配列の設計と最適化

イントロンとエクソンの配列設計と最適化

相同アーム配列の設計と最適化

スペーサー配列の設計と最適化

1-2
mRNA配列設計の一般的な戦略
CircRNA コンポーネント生体機能最適化戦略
2つの末端イントロンとエクソン配列イントロンの外側の配列を環化するための GTP 触媒イントロン自己スプライシング。T4 td 遺伝子または魚油 tRNA 前駆体遺伝子に基づいて設計されています。
コーディングIREScircRNA の翻訳を制御する内部リボソーム認識部位。EMCV、CVB3 ソースなど、さまざまなウイルス ソースからの内部リボソーム エントリ サイト (IRES) 配列のスクリーニング。
CDSタンパク質コード領域、抗原、抗体、またはその他の機能性タンパク質をコードする配列。コドンの最適化により翻訳レベルが向上します。特定の非最適コドンはタンパク質の折り畳みに役割を果たす可能性があります。
非コーディング非コード配列miRNA またはタンパク質をターゲットにして、遺伝子またはタンパク質の調節を実​​行します。miRNA またはタンパク質の特定の結合部位をターゲットにすると、結合部位の配列を繰り返すことができます。
私たちの特徴
  • 最適化された PIE 環化システムと合理的な最適化戦略の組み合わせにより、80% を超える環化率を実現します。
  • 最先端の CDS 最適化チーム プロの AI アルゴリズム チームと協力して、CDS 領域コドンの最適化を完了します。
  • 成熟した完璧なプロセス circRNA は、高い環化効率、高い安定性、高い翻訳効率を実現します。
ケーススタディ

Yaohai Bio-Pharma は、PIE システムに基づいて RNA の環化を実現するコントロール製品である強化緑色蛍光タンパク質 (eGFP) circRNA を発売しました。

従来のトランスフェクション試薬を使用して、eGFP circRNA を 293T 細胞にトランスフェクトすると、24 時間後に eGFP (緑) 蛍光シグナルが検出され、48 時間後には増強されます。トランスフェクション後 7 日目と 14 日目にも蛍光シグナルが検出されます。

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eGFP circRNAのin vitro発現検証

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