לגבי ייצור המוני של mRNA, שעתוק במבחנה (IVT) היא שיטה יעילה ובוגרת יותר. תגובת IVT מאמצת DNA פלסמיד ליניארי המכיל את מקדם T7 כתבנית, ו-mRNA מסונתז עם טריפוספטים של נוקלאוזידים (NTPs) כמצעים בנוכחות T7 RNA פולימראז.
שינוי נוקלאוטידים הוא פריצת דרך בחקירת ה-mRNA, כאשר מולקולות mRNA ללא שינוי מזוהות על ידי חיישני RNA תוך-תאיים כדי להפעיל חסינות מולדת. משיקולים של אימונוגניות mRNA in vivo ויעילות התרגום, תהליך ה-IVT משתמש בדרך כלל בסוגים מסוימים של NTPs שונה, ונוקלאוטידים מתוקנים נפוצים הם פסאודורידין (Ψ), N1-מתיל-פסאודורידין (N1Ψ) ו-5-מתילציטוזין (5mC).
דיאגרמת תגובה של תמלול במבחנה (IVT).
שירות אופציונלי |
פרטי השירות |
תקופת אספקה (יום עבודה) |
תמלול במבחנה (IVT) |
IVT, תמלול במבחנה | 1 |
שינויים בנוקלאוטידים (Ψ/N1Ψ/5mC וכו') | ||
הסרת תבנית DNA (DNase I) | ||
אופטימיזציה של מצב IVT - אופציונלי |
עיצוב ואופטימיזציה של רכיבי תגובה IVT | 2-5 |
שיפור יציבות mRNA וביטוי חלבון in vivo.
ניתן להשיג הכנת שברי mRNA של עד 10kb.
על ידי אופטימיזציה של תנאי התגובה של IVT, קצב השעתוק הוא עד 1:200.
בקרה מחמירה של RNase באמצעות סביבת ניסוי וחומרים מתכלים יכולה למנוע ביעילות פירוק mRNA.
מערכת התגובה הנוכחית של IVT מותאמת באופן גס למערכות סינתטיות באורך של כ-100 nt, לא עבור mRNA באורך שרירותי. ככל שרצף ה-mRNA ארוך יותר, כך קשה יותר לתמלל אותו ונוטה יותר להתדרדרות.
על מנת להכין רצפי mRNA מותאמים אישית באורך של כ-10 kb, Yaohai Bio-Pharma הכינה בהצלחה דגימות באיכות גבוהה עם יחס שעתוק גבוה של 1:135 והשיגה 135 מיקרוגרם של מוצרי mRNA מטוהרים תחילה לאחר 1 מיקרוגרם של פלסמיד ליניאריזציה תומלל במבחנה באמצעות תכנון ניסוי קפדני, אופטימיזציה מתמשכת של תנאי התגובה ובקרה קפדנית על RNase.
mRNA Identify (Agarose Gel Electrophoresis)