כל הקטגוריות
ENEN
עיצוב רצף circRNA

עיצוב רצף circRNA

עמוד הבית >  IVT RNA  >  סינתזת RNA מותאמת אישית  >  סינתזת circRNA מותאמת אישית  >  עיצוב רצף circRNA

IVT RNA

עיצוב רצף circRNA

Yaohai Bio-Pharma מכינה circRNA על בסיס מערכת PIE (יישור של אקסונים ואינטרונים), המסתמכת על פונקציית השחבור העצמי של אינטרונים מסוג I להשגת מחזור RNA. מבנה PIE מתוכנן באמצעות הגן T4 td או גן מבשר tRNA fishy, ​​והסידור הוא כדלקמן:

אינטררון ה-RNA ושבר האקסון התומך מחולקים לשני חלקים (טרמינל 5' ומסוף 3'), כאשר רצף הטרמינלי 5' מועבר לזנב של רצף המטרה, רצף ה-3 'המסוף מוחדר לקדמת רצף המטרה, ורצף גן המטרה מוחדר באמצע.

לא מוגדר

תחת הקטליזה של GTP, מבנה ה-PIE מוביל למחזוריות של רצפים שאינם אינטרונים. בשילוב עם אסטרטגיית שיפור סבירה של קצב מחזוריות, Yaohai Bio-Pharma יכולה להשיג מחזוריות של רצפים עד 4 kb עם קצב מחזור של יותר מ-80%.

לא מוגדר

איור 1. מחזור במבחנה של circRNA המבוסס על מערכת PIE

פרטי שירותים
התַהֲלִיךשירות אופציונליפרטי השירותתקופת אספקה ​​(יום עבודה)
עיצוב ואופטימיזציה של רצף circRNAעיצוב ואופטימיזציה של רצפי קידוד

יישור רצף CDS

אופטימיזציה של קודון CDS

1
עיצוב ואופטימיזציה של רצפים שאינם מקודדים

עיצוב ואופטימיזציה של רצף אינטרון ואקסון

עיצוב ואופטימיזציה של רצף זרועות הומולוגיות

עיצוב ואופטימיזציה של רצף מרווחים

1-2
אסטרטגיות נפוצות לעיצוב רצף mRNA
רכיבי CircRNAפונקציות ביולוגיותאסטרטגיות אופטימיזציה
רצפי אינטרונים ואקסונים דו-טרמינלייםשחבור עצמי של אינטררון מזורז עם GTP למחזוריות של רצפים מחוץ לאינטרון.עוצב על פי הגן T4 td או גן מבשר tRNA שמן דגים.
סִמוּלIRESאתר זיהוי ריבוזום פנימי המווסת את התרגום של circRNA.סקר של רצפי כניסה לאתר ריבוזום פנימי (IRES) ממקורות ויראליים שונים, למשל מקורות EMCV, CVB3.
CDSאזורים מקודדי חלבון, רצפים המקודדים לאנטיגנים, נוגדנים או חלבונים פונקציונליים אחרים.אופטימיזציה של קודון מגבירה את רמת התרגום; קודונים מסוימים שאינם אופטימליים עשויים למלא תפקיד בקיפול חלבון.
אי קידודרצפים לא מקודדיםמטרת miRNA או חלבונים להפעיל ויסות גנים או חלבונים.מיקוד לאתרי קישור ספציפיים עבור miRNAs או חלבונים יכול לחזור על הרצפים של אתר הקישור.
התכונות שלנו
  • מערכת מחזור אופטימלית PIE שילוב עם אסטרטגיות אופטימיזציה סבירות להשגת שיעור מחזוריות של יותר מ-80%;
  • צוות אופטימיזציית CDS מתקדם שיתוף פעולה עם צוות אלגוריתמי AI מקצועי להשלמת האופטימיזציה של קודונים באזור CDS;
  • ניתן להשיג circRNA בתהליך בוגר ומושלם עם יעילות מחזורית גבוהה, יציבות גבוהה ויעילות תרגום גבוהה.
מקרה לדוגמה

Yaohai Bio-Pharma השיקה את מוצר הבקרה משופר חלבון פלואורסצנטי ירוק (eGFP) circRNA, המבוסס על מערכת PIE להשגת מחזוריות של RNA.

באמצעות מגיב טרנספקציה קונבנציונלי, eGFP circRNA עובר תאי 293T, וניתן לזהות אות ניאון eGFP (ירוק) לאחר 24 שעות, אשר יוגבר לאחר 48 שעות. עדיין ניתן לזהות את האות הפלורסנט ביום ה-7 וביום ה-14 לאחר מכן טרנספקציה.

图片

אימות ביטוי במבחנה של eGFP circRNA

קבל הצעת מחיר חינם

נהיה בקשר