לפי הדוגמה המרכזית, RNA שליח (mRNA) הוא הגשר להעברת חומר גנטי מ-DNA לחלבונים.
mRNA ממלא תפקיד ביולוגי על ידי קידוד חלבונים in vivo, ו-mRNA בוגר באורגניזמים אוקריוטיים מורכב מחמישה מרכיבים: 5' Cap (מבנה כובע), 5' UTR (אזור לא מקודד), ORF (מסגרת קריאה פתוחה), 3' UTR , וזנב polyA 3' (זנב פוליאדנילט).
התַהֲלִיך | שירות אופציונלי | פרטי השירות | תקופת אספקה (יום) |
עיצוב ואופטימיזציה של רצף mRNA | עיצוב ואופטימיזציה של רצפי קידוד | יישור רצף CDS אופטימיזציה של קודון CDS | 1 |
עיצוב ואופטימיזציה של רצפים שאינם מקודדים | עיצוב ואופטימיזציה של רצף UTR 5' עיצוב ואופטימיזציה של רצף UTR 3' עיצוב ואופטימיזציה של רצף polyA | 1-2 |
5' UTR/3' UTR |
|
זנב 3' PolyA |
|
רכיבי mRNA | פונקציות ביולוגיות | אסטרטגיות אופטימיזציה |
כובע 5' | הגן על mRNA מפני פירוק על ידי אקסונוקלאזות ופעל בשיתוף פעולה עם זנב ה-polyA בקצה ה-3', חלבון קושר ל-polyA וחלבון תחילת התרגום כדי ליזום תרגום חלבון. | המבנה הטבעי של Cap1 נמנע מקולטני זיהוי דפוסים ובכך מפחית את התגובה החיסונית הטבעית, שניתן להשיג על ידי כיסוי קו-תעתוקתי של צעד אחד או מכסה אנזימטי דו-שלבי [ראה מכסת mRNA אנזימטית ומכסה משעתק משותפת לפרטים]. |
5' UTR | ניתן לזהות את ה-5' UTR על ידי ריבוזומים, לווסת את התרגום של mRNA ולהשפיע על יציבות ה-mRNA. | מכילים רצפים של קוזאק ללא מבנה משני מאוד יציב. UTRs טבעיים של גנים בעלי ביטוי גבוה עדיפים עבור mRNAs לתעתוק מבחנה (IVT) כגון α-globin ו-β-globin. |
CDS | אזורים מקודדי חלבון ורצפי קידוד לאנטיגנים, נוגדנים או חלבונים פונקציונליים אחרים. | אופטימיזציה של קודונים מגבירה את רמת התרגום, ומציינת שקודונים מסוימים שאינם אופטימליים עשויים למלא תפקיד בקיפול חלבון. |
3' UTR | לווסת תרגום ויציבות mRNA. | UTRs טבעיים של גנים בעלי ביטוי גבוה מועדפים עבור IVT mRNAs כגון α-globin ו-β- globin. |
זנב polyA 3' | לווסת את ביטוי החלבון ולהגן על מבנה המכסה מפני השפלה. | נדרש אורך הולם (100-150 bp); קידוד זנב polyA על פלסמיד תבנית השעתוק מבטיח אורך זנב polyA מוגדר יותר. |
מקורות מרובים של ספריות UTR טבעיות ומותאמות מאוד; אסטרטגיית שינוי UTR בוגרת;
שיתוף פעולה עם צוות אלגוריתמים מקצועי של AI כדי להשלים את האופטימיזציה של קודונים.
הוסף רצפי polyA לפי תבניות DNA כדי לשלוט באורך mRNA בצורה מדויקת יותר.
השג ביטוי יעיל של mRNA עם אימונוגניות נמוכה.
עיצוב רצף של mRNA דו-מדווח: mCherry-eGFP mRNA
שירות ה-mRNA של Yaohai Bio-Pharma ממשיך להשתדרג עם תכנון ואופטימיזציה של רצף טנדם גן כפול, המשיג ביטוי משותף של גנים כפולים.
באמצעות מגיב טרנספקציה קונבנציונלי, רצף הגנים הכפולים mCherry-eGFP mRNA עובר תאי 293T, ושני אותות ניאון של mCherry (אדום) וחלבון פלואורסצנטי ירוק משופר (eGFP) מזוהים בביטוי סימולטני לאחר 48 שעות, והערימה הגרף מסומן בצהוב.
ביטוי של mRNA mCherry-eGFP בתא 293T