לפי העקרון המרכזי, רנ"א מסגרת (mRNA) היא הגשר להעברת החומרה הגנטית מרנ"א לדגנים.
ה-rna המסרוגת מגלמת תפקיד ביולוגי על ידי קידוד חלבונים בגוף, וה-rna המסרוגת הבוגרת באורגניזמים אוקריוטיים מורכבת מחמישה רכיבים: כובע 5' (מבנה כובע), UTR 5' (אזור לא מקודד), ORF (שורה פתוחה לקידוד), UTR 3', וכיבוי.polyA 3'
תַהֲלִיך | שירות אופציונלית | פרטי שירות | תקופת הובלה (יום) |
עיצוב ותאמה של סדרת mRNA | עיצוב ותאמה של סדרות קידודיות |
השוואת סדרת CDS הופטימיזציה של קדון CDS |
1 |
עיצוב ותיכנון של סדרות לא-קודדות |
עיצוב והופטימיזציה של סדרת 5' UTR עיצוב והופטימיזציה של סדרת 3' UTR עיצוב והופטימיזציה של סדרת polyA |
1-2 |
5' UTR/3' UTR |
|
זנב PolyA 3' |
|
מרכיבי mRNA | פונקציות ביולוגיות | אסטרטגיות אופטימיזציה |
5’ Cap | לשמור על mRNA מפני התפרקות על ידי אקסונוקלאזות ולפעול בקונצרט עם זנב polyA בקצה 3', חלבון קשור ל-polyA וחלבון המתחיל את תרגום חלבון כדי להתחיל את תרגום החלבון. | המבנה הטבעי של Cap1 מונע את קבלת דפוסים והופך את התגובה החיסונית הטבעית לקטנה יותר, מה שאפשר להשיג על ידי כיסוי משולב בשני שלבים או בכיסוי משולב אחד [ראה כיסוי משולב של mRNA וכיסוי משולב עבור פרטים נוספים]. |
uTR 5' | ה-UTR של 5' יכול להינכר על ידי ריבוזומים, לשלוט בתרגום של mRNA ולהשפיע על יציבותו של mRNA. | מכילים סדרות קוזאק ללא מבנה משני יציב מאוד. UTRים טבעיים של גנים שבעבורם יש ביטוי גבוה מומלצים למRNA תרמי (IVT) כמו α-גלובין ו-β-גלובין. |
CDS | אזורים המבוקרים בחלבונים וסדרות קודיות עבור אנטיגנים, חלבוני נגינה או חלבונים פונקציונליים אחרים. | הופטימיזציה של קדונים מגבירה את רמת התרגום, עם הערה כי קדונים מסוימים שאינם אופטימליים עשויים לשחק תפקיד בהכפלה של חלבון. |
uTR של 3' | משלטים בתרגום של mRNA ויציבותו. | UTRs טבעיים של גנים עם ביטוי גבוה מומלצים למRNA של IVT כמו α-גלובין ו-β-גלובין. |
זנב polyA 3' | משלטים בביטוי חלבון ומצילים את המבנה הקפתי מפני התפרקות. | אורך מספיק (100-150 בסיסים) נדרשquired; הוספת זנב polyA על פלזמידת ההעתקה מבטיחה אורך יותר מוגדר לזנב polyA. |
מקורות מרובים של ספריות UTR טבעיות ומודיפיקציה שמחוללות ביטוי גבוה; אסטרטגיית מודיפיקציה מתונה של UTR;
שיתוף פעולה עם צוות אלגוריתמים של AI מקצועי כדי להשלים את האופטימיזציה של קדונים.
הוספת סדרות polyA לפי תבניות DNA כדי לשלוט באורך mRNA בצורה מדוייקת יותר.
השגת ביטוי יעיל של mRNA עם חוסר התגנבות נמוך.
עיצוב סדרה של mRNA דו-דוחה: mRNA mCherry-eGFP
שירותהמ GetMessage של יאוהאי ביואו-פארמה ממשיך להשתפר עם תכנון ותירוץ של סדרה כפולה של גן דיווח, שמאפשרת ביטוי משותף של שני גנים.
באמצעות אגנט העברה מסורתי, המ-RNA של הסדרה הכפולה mCherry-eGFP נמסגר לתאים 293T, ושני אותות פלורסצנטיים של mCherry (אדום) וחלבון פלורסצנטי ירוק מודגש (eGFP) נמדדים לאחר 48 שעות עם ביטוי בו-זמני, והגרף הקומבינטורי מודגש בצבע צהוב.
ביטוי של mRNA mCherry-eGFP בתאים 293T