כל הקטגוריות
ENEN
עיצוב סדרה של circRNA

עיצוב סדרה של circRNA

דף הבית >  RNA ITV  >  סינתזה מותאמת של RNA  >  סינתזה מותאמת של circRNA  >  עיצוב סדרה של circRNA

RNA ITV

עיצוב סדרה של circRNA

Yaohai Bio-Pharma מכינה circRNA על בסיס מערכת PIE (העתקה של אקסונים ואינтроны), שמשתמשת בפונקציית ההפרדה העצמית של אינטרונים מסוג I כדי להשיג ציקליזציה של RNA. מבנה PIE מעוצב באמצעות גן T4 td או הגן המקדים של tRNA דג, והסדר הוא כדלקמן:

האינטרון של RNA והחתך האקסוני התומך מחולקים לשני חלקים (קצה 5' וקצה 3'), שבו הסדר של הקצה 5' הועבר לסוף הסדרה המטרה, הסדר של הקצה 3' נסחט לפני הסדרה המטרה, והסדרת הגן המטרה נכנסת באמצע.

undefined

תחת הקטליזה של GTP, המבנה PIE מוביל לציקליזציה של סדרות שאינן אינטרונים. יחד עם אסטרטגיה תקיפה להגברת קצב הציקליזציה, Yaohai Bio-Pharma יכולה להשיג ציקליזציה של סדרות באורך של עד 4 ק"ב עם קצב ציקליזציה של יותר מ-80%.

undefined

תמונה 1. חיקוי מחוץ לגוף של circRNA מבוסס על מערכת PIE

פרטי שירות
תַהֲלִיך שירות אופציונלית פרטי שירות תקופת מסירה (יום עבודה)
עיצוב ותמצית של סדרת circRNA עיצוב ותאמה של סדרות קידודיות

השוואת סדרת CDS

הופטימיזציה של קדון CDS

1
עיצוב ותיכנון של סדרות לא-קודדות

עיצובת וoptimization של סדרות אינטרון ואקסון

DESIGN ו-optimization של סדרת זרוע הומולוגית

DESIGN ו-optimization של סדרה מרווחת

1-2
אסטרטגיות נפוצות לעיצוב סדרת mRNA
רכיבי CircRNA פונקציות ביולוגיות אסטרטגיות אופטימיזציה
סדרות אינטרון ואקסון דו-طرفיות ספlicing עצמי של אינטרון המניע GTP לציקליזציה של הסדרות מחוץ לאינטרון. נוצרו לפי גן T4 td או הגן המקדים ל-tRNA של שמן דגים.
קידוד IRES אתר זיהוי ריבוזום פנימי שמשלט על תרגום circRNA. סינון של סדרות אתר כניסה של ריבוזום פנימי (IRES) ממקורות ויראליים שונים, למשל EMCV, מקורות CVB3.
CDS אזורים המוצגים בחלבונים, סדרות המצגות אנטיגנים, חיסונים או חלבונים פונקציונליים אחרים. הופטימיזציה של קודונים מגבירה את רמת התרגום; קודונים מסוימים שאינם אופטימליים עשויים לשחק תפקיד בהרכבת החלבון.
לא-מוצגים סדרות לא-מוצגות מטרתם של miRNAs או חלבונים היא להפעיל שליטה בגן או בחלבון. הכוונה לאתרים ספציפיים של חיבור ל-miRNAs או חלבונים יכולה לחזור על הסדרות של אתר החיבור.
תכונותינו
  • המערכת של תהליך ציקליזציה PIE מופתית שמשלבת אסטרטגיות אופטימיזציה הגיוניות כדי להשיג שיעור ציקליזציה של יותר מ-80%;
  • שיתוף השותפות עם קבוצת אופטימיזציה מתקדמת של CDS עם צוות אלגוריתמים של AI מקצועי כדי להשלים את האופטימיזציה של הקודונים באזור CDS;
  • תהליך מתוחכם ושלם של circRNA ניתן להשיג עם יעילות ציקליזציה גבוהה, יציבות גבוהה ויעילות תרגום גבוהה.
מחקר מקרה

Yaohai Bio-Pharma הוציאה את המוצר הבסיסי פלורסנט ירוק מוגבר (eGFP) circRNA, שהוא מבוסס על מערכת PIE כדי להשיג את הציקליזציה של RNA.

באמצעות חומר העברה סטנדרטי, circRNA eGFP מועבר לתאים 293T, ואות פלורסנטי של eGFP (ירוק) יכול להיות זוהה לאחר 24 שעות, והוא יגבר לאחר 48 שעות. האות הפלורסנטי עדיין יכול להיות זוהה ביום השביעי והיום הארבעה עשר לאחר ההעברה.

图片

אימות ביטוי in vitro של circRNA eGFP

קבל ציון חינם בחינם

Get in touch