Strategier for kodonoptimering

Der findes 64 genetiske codoner, hvoraf 60 kodere for 20 aminosyrer. Hvert organisme anvendt til proteinudtryk eller produktion (herunder Escherichia coli, gær, pattedyrsceller, Pichia, planteceller og insektsceller) viser en vis grad af forskel eller præference i codonbrugen. De codoner, der bruges hyppigst i en vært, kaldes optimale codoner, mens de, der ikke bruges ofte, kaldes sjældne eller lav-brugs-codonner.

Codonoptimering

Codonoptimering indebærer at ændre en gens sekvens ved at bruge foretrukne codoner og undgå lav-brugs- eller sjældne codoner, og derefter opnå den ændrede gen gennem gensyntese. Denne redesignning af gener kalder sig codonoptimering.

En optimeret genssekvens kan forbedre stabiliteten af mRNA's sekundærstruktur, hvilket forhindre oversættelsesforsinkelser, for tidlig ophør med oversættelse, translational frameshift og aminosyre-mismatch på grund af utilstrækkelige tRNA-pooler.

Optimering er afgørende, fordi det letter den effektive fremskridt af processer såsom genetisk syntese, vektorkonstruktion, transkription og translation.

Optimeringsfaktorer

Balancering af GC-indhold: Dette påvirker bindingsstabilitet, annealing-temperatur og proteinudbytte.

Reduktion af gentagne sekvenser: Dette mindsker vanskeligheden ved gensyntese.

Justering af mRNA's sekundærstruktur: For at undgå hårpindestrukturer, der påvirker translationen.

Fjerne restriktionsenzym-skæresteder : For at beskytte genets integritet.

Præferencen for kodoner: Optimering af donnorgenen i overensstemmelse med værtsorganismen for at maksimere proteinekspression.

Yaohais støtte

For gen-design og -syntese er enkelte faktorer såsom proteinekspression og kodonoptimering ikke tilstrækkelige. Forskellige metoder og programmer kan designe og producere forskellige kodonoptimerede mRNA-sekvenser. Basert på ovennævnte optimeringsfaktorer, kombineret med dens officielle database, og samtidig med at den summerer flere års erfaring inden for gensyntese, har Yaohai Bio-Pharma udviklet sin unikke kodonoptimeringsdatabase. Den kan levere gratis kodonoptimering og design af gensynteseschemat for at maksimere optimeringen af din gensekvens.

Yaohai Bio-Pharma har etableret en kompleks række teknologier til syntese af lineær og cirkulær mRNA for at levere højkvalitets RNA, herunder sekvensdesign og -optimering, gensyntese, IVT, cirkularisering, RNA-rening og LNP-indpakning.

Vi søger også aktivt globale partnere, både institutionelle og individuelle. Vi tilbyder den mest konkurrencedygtige kompensation i branchen. Hvis du har nogen spørgsmål, tøv ikke med at kontakte os: [email protected]

For flere detaljer om Yaohai Bio-Pharma, henvis venligst til vores hjemmeside: www.yaohaibio-pharma.com