Codon optimeringsstrategier

Der er 64 genetiske kodoner, hvoraf 60 koder for 20 aminosyrer. Hver organisme, der anvendes til proteinekspression eller produktion (herunder Escherichia coli, gær, pattedyrceller, Pichia, planteceller og insektceller) udviser en vis grad af forskel eller præference i kodonbrug. Kodoner, der oftest anvendes i en vært, kaldes optimale kodoner, mens de, der ikke hyppigt anvendes, kaldes sjældne eller lavt brugs-kodoner.

Codon optimering

Kodonoptimering involverer modifikation af en gensekvens ved at bruge foretrukne kodoner og undgå lav-brug eller sjældne kodoner og derefter opnåelse af det modificerede gen gennem gensyntese. Dette redesign af gener omtales som kodonoptimering.

En optimeret gensekvens kan øge stabiliteten af ​​den sekundære mRNA-struktur, forhindre translationsforsinkelser, for tidlig translationsterminering, translationel frameshifting og aminosyrefejlparring på grund af utilstrækkelige tRNA-puljer.

Optimering er væsentlig, fordi den letter den effektive progression af processer såsom gensyntese, vektorkonstruktion, transkription og translation.

Optimeringsfaktorer

Balancering af GC-indhold: Dette påvirker bindingsstabilitet, annealingstemperatur og proteinudbytte.

Reduktion af gentagne sekvenser: Dette mindsker vanskeligheden ved gensyntese.

Justering af mRNA sekundær struktur: For at undgå hårnålestrukturer, der påvirker oversættelsen.

Eliminering af restriktionsenzym cut-steder: For at beskytte genets integritet.

Kodon præference: Optimering af donorgenet i henhold til værten for at maksimere proteinekspression.

Yaohais støtte

Til gendesign og -syntese er blot proteinekspression og kodonoptimering ikke tilstrækkelig. Forskellige metoder og programmer kan designe og producere forskellige codon-optimerede mRNA-sekvenser. Baseret på ovenstående optimeringsfaktorer, kombineret med dens officielle database og opsummering af mange års erfaring med gensyntese, har Yaohai Bio-Pharma udviklet sin unikke kodonoptimeringsdatabase. Det kan give dig gratis kodonoptimering og gensynteseskemadesign for at maksimere kodonoptimeringen af ​​din gensekvens.

Yaohai Bio-Pharma har etableret et komplet sæt lineære mRNA- og cirkulære mRNA-synteseteknologier for at levere RNA af høj kvalitet, såsom sekvensdesign og optimering, gensyntese, IVT, cirkularisering, RNA-oprensning og LNP-indkapsling.

Vi søger også aktivt institutionelle eller individuelle globale partnere. Vi tilbyder den mest konkurrencedygtige kompensation i branchen. Hvis du har spørgsmål, er du velkommen til at kontakte os: [email protected]

For flere detaljer om Yaohai Bio-Pharma, se venligst vores hjemmeside: www.yaohaibio-pharma.com