У звязку з масавым вытворам mRNA, транскрыпцыя in vitro (IVT) яляецца больш афіцыйным і даскональным спосабам. У IVT-рэакцыі выкарыстоўваецца лінейны плазмідная DNA, якая ўключае проматар T7, як шаблон, і mRNA сінтэтыруецца з нуклеазідных трифосфатоў (NTPs) як субстратаў у наяўнасці полімеразы RNA T7.
Мадыфікацыя нуклеатыдаў яляецца перамогай ў даследванні mRNA, дзе немадыфікаваныя молекулы mRNA распаўнічаюцца клеткавымі сенсарамі RNA для актывізацыі уладжанай імуннасці. Дзеля разгледжання імунагеннай адмоўнасці mRNA ў живой сістэме і эфектыўнасці транслатацыі, процес IVT звычайна выкарыстоўвае пэўныя тыпы мадыфікаваных NTPs, і часта мадыфікаваныя нуклеатыды — гэта псевдуюрыдыны (Ψ), N1-метыл-псевдуюрыдына (N1Ψ) і 5-метылцытозін (5mC).
Дыяграма реакцыі вітрынальнай транскрыпцыі (IVT)
Апцыянальная служба |
Дэталі сервісу |
Тэрмін выканання (робальны дзень) |
Транскрыпцыя вонкаштоўна (IVT) |
IVT, Вітрынальная транскрыпцыя | 1 |
Модыфікацыі нуклеатадаў (Ψ/Н1Ψ/5мC і т.д.) | ||
Выдаленне ДНК-шаблона (ДНаза I) | ||
Аптымізацыя умоваў IVT - неабходна |
Прынцыпы і аптымізацыя дэзайн компанентаў реакцыі IVT | 2-5 |
Павышэнне стаяласці mRNA і экспрэсіі белка ў живым організме.
магчымая падготовка фрагмента mRNA да 10kb.
За счёт аптымізацыі ўмоваў реакцыі IVT, швиддасьць транскрыпцыі дасягае 1:200.
Строгае кантроліраванне RNase праз експерыментальную сяродовіну і патрыбныя вешчыцы можа эфектыўна спарыць дэградацыю mRNA.
Бягучая система реакцыі IVT у агульным лічыцца аптымізаванай для сінтэтычных сістэм з даўжынёй прымята 100 нт, не для mRNA адвольнай даўжыні. Чым дылшэйшая mRNA-послядоўнасць, тым складзейшая яе транскрыпцыя і чым большая ў яе выразнасць дэградацыі.
Для падготовкі замавных mRNA-послядоўнасцей з даўжынёй прымята 10 кб, Yaohai Bio-Pharma паспяхова падгатавала выхавалыя пробы з высокаю транскрыпцыйнай адносінай 1:135 і атрымала 135 μg початкова ачысценых mRNA-вырабоў пасля транскрыпцыі 1 μg лінейнага плазмыда ў vitro праз строгую експерыментальнай дэзайн, непрыстанную аптымізацыю умоваў реакцыі і строгае кантроліраванне RNase.
аднаходзіць mRNA (Агаравая гелевая электрафарэз)