Што тычыцца масавай вытворчасці мРНК, транскрыпцыя in vitro (IVT) з'яўляецца больш эфектыўным і сталым метадам. Рэакцыя IVT прымае лінеарызаваную плазмідную ДНК, якая змяшчае промотор Т7, у якасці матрыцы, і мРНК сінтэзуецца з нуклеозидтрифосфатами (NTP) у якасці субстратаў у прысутнасці РНК-палімеразы Т7.
Нуклеатыдная мадыфікацыя - гэта прарыў у вывучэнні мРНК, дзе немадыфікаваныя малекулы мРНК распазнаюцца ўнутрыклеткавымі датчыкамі РНК для актывацыі прыроджанага імунітэту. Для меркаванняў імунагеннасці мРНК in vivo і эфектыўнасці трансляцыі ў працэсе IVT звычайна выкарыстоўваюцца пэўныя тыпы мадыфікаваных NTP, а распаўсюджанымі мадыфікаванымі нуклеатыдамі з'яўляюцца псеўдаурыдын (Ψ), N1-пазначаў-псеўдаурыдын (N1Ψ) і 5-метылцытазін (5mC).
Дыяграма рэакцыі транскрыпцыі in vitro (IVT).
Дадатковая паслуга |
Падрабязнасці аб паслузе |
Перыяд дастаўкі (рабочы дзень) |
Транскрыпцыя in vitro (IVT) |
IVT, транскрыпцыя in vitro | 1 |
Мадыфікацыі нуклеатыдаў (Ψ/N1Ψ/5mC і г.д.) | ||
Выдаленне шаблону ДНК (DNase I) | ||
Аптымізацыя стану IVT - неабавязкова |
Праектаванне і аптымізацыя кампанентаў рэакцыі IVT | 2-5 |
Палепшыць стабільнасць мРНК і экспрэсію бялку in vivo.
Можа быць дасягнута падрыхтоўка фрагмента мРНК памерам да 10 кб.
Дзякуючы аптымізацыі ўмоў рэакцыі IVT хуткасць транскрыпцыі дасягае 1:200.
Строгі кантроль РНКазы з дапамогай эксперыментальнага асяроддзя і расходных матэрыялаў можа эфектыўна прадухіліць дэградацыю мРНК.
Сучасная сістэма рэакцыі IVT прыкладна аптымізавана для сінтэтычных сістэм даўжынёй каля 100 нт, а не для мРНК адвольнай даўжыні. Чым даўжэй паслядоўнасць мРНК, тым цяжэй яе транскрыбаваць і тым больш яна схільная дэградацыі.
Каб падрыхтаваць індывідуальныя паслядоўнасці мРНК даўжынёй каля 10 кб, Yaohai Bio-Pharma паспяхова падрыхтавала высакаякасныя ўзоры з высокім стаўленнем транскрыпцыі 1:135 і атрымала 135 мкг першапачаткова ачышчаных прадуктаў мРНК пасля 1 мкг лінеарызаванай плазміды. быў транскрыбаваны in vitro з дапамогай строгага эксперыментальнага дызайну, пастаяннай аптымізацыі ўмоў рэакцыі і строгага кантролю РНКазы.
Ідэнтыфікацыя мРНК (электрафарэз у агарозным гелі)