усе раздзелы
Дызайн паслядоўнасці circRNA

Дызайн паслядоўнасці circRNA

Yaohai Bio-Pharma рыхтуе circRNA на аснове сістэмы PIE (выраўноўванне экзонаў і інтронаў), якая абапіраецца на функцыю самазрошчвання інтронаў тыпу I для дасягнення цыклізацыі РНК. Структура PIE распрацавана з выкарыстаннем гена T4 td або гена-папярэдніка тРНК, і размяшчэнне наступнае:

Інтрон РНК і апорны фрагмент экзона падзелены на дзве часткі (5'-канцавая і 3'-канцавая), дзе 5'-канцавая паслядоўнасць пераносіцца ў хвост паслядоўнасці-мішэні, а 3'-канцавая паслядоўнасць устаўляецца ў пярэднюю частку мэтавая паслядоўнасць, а паслядоўнасць мэтавага гена ўстаўлена ў сярэдзіну.

нявызначаных

Пры каталізе GTP структура PIE прыводзіць да цыклізацыі паслядоўнасцей, акрамя інтронаў. У спалучэнні з разумнай стратэгіяй павышэння хуткасці цыклізацыі Yaohai Bio-Pharma можа дасягнуць цыклізацыі паслядоўнасцей да 4 кб з хуткасцю цыклізацыі больш за 80%.

нявызначаных

Малюнак 1. Цыркуляцыя circRNA in vitro на аснове сістэмы PIE

Падрабязнасці паслуг
Працэс Дадатковая паслуга Падрабязнасці аб паслузе Тэрмін дастаўкі (працоўны дзень)
праектаванне і аптымізацыя паслядоўнасці circRNA Дызайн і аптымізацыя паслядоўнасцей кадавання

Выраўноўванне паслядоўнасці CDS

Аптымізацыя кодона CDS

1
Дызайн і аптымізацыя некадуючых паслядоўнасцей

Дызайн і аптымізацыя паслядоўнасці інтронаў і экзонаў

Дызайн і аптымізацыя гамалагічнай паслядоўнасці рук

Праектаванне і аптымізацыя паслядоўнасці спейсераў

1-2
Агульныя стратэгіі распрацоўкі паслядоўнасці мРНК
Кампаненты CircRNA Біялагічныя функцыі Стратэгіі аптымізацыі
Двухканцавыя паслядоўнасці інтронаў і экзонаў GTP-катализируемый інтрон самосплайсинг для цыклізацыі паслядоўнасцяў па-за інтрона. Распрацаваны ў адпаведнасці з генам T4 td або генам-папярэднікам тРНК рыбінага тлушчу.
Кадаванне IRES Унутраны сайт распазнання рыбасомы, які рэгулюе трансляцыю circRNA. Скрынінг паслядоўнасцей унутранага сайта ўваходу ў рыбасомы (IRES) з розных вірусных крыніц, напрыклад, крыніц EMCV, CVB3.
CDS Участкі, якія кадуюць вавёркі, паслядоўнасці, якія кадуюць антыгены, антыцелы або іншыя функцыянальныя вавёркі. Аптымізацыя Codon павышае ўзровень трансляцыі; некаторыя неаптымальныя кодоны могуць гуляць пэўную ролю ў згортванні бялку.
Некадзіраванне Некадуючыя паслядоўнасці Нацэліцеся на мікраРНК або вавёркі для рэгуляцыі генаў або бялкоў. Нацэльванне на пэўныя сайты звязвання мікраРНК або бялкоў можа паўтараць паслядоўнасці сайта звязвання.
нашы Асаблівасці
  • Аптымізаваная сістэма цыклізацыі PIE Камбінацыя з разумнымі стратэгіямі аптымізацыі для дасягнення хуткасці цыклізацыі больш за 80%;
  • Перадавая каманда па аптымізацыі CDS Супрацоўніцтва з прафесійнай камандай алгарытмаў штучнага інтэлекту для завяршэння аптымізацыі кодонаў рэгіёнаў CDS;
  • Спелая і ідэальная працэсная circRNA можа быць дасягнута з высокай эфектыўнасцю цыклізацыі, высокай стабільнасцю і высокай эфектыўнасцю трансляцыі.
Кейс

Кампанія Yaohai Bio-Pharma выпусціла кантрольны прадукт, узмоцнены зялёным флуарэсцэнтным бялком (eGFP) circRNA, які заснаваны на сістэме PIE для дасягнення цыклізацыі РНК.

Выкарыстоўваючы звычайны рэагент для трансфекцыі, eGFP circRNA трансфікуецца ў клеткі 293T, і eGFP (зялёны) флуоресцентный сігнал можа быць выяўлены праз 24 гадзіны, які будзе ўзмацняцца праз 48 гадзін. Флуарэсцэнтны сігнал усё яшчэ можа быць выяўлены на 7-ы дзень і на 14-ы дзень пасля трансфекцыя.

图片

In vitro праверка экспрэсіі eGFP circRNA

Атрымаць бясплатную кансультацыю

Звяжыцеся