W porównaniu z dwuetapowym enzymatycznym zamykaniem, jednoetapowa metoda kotranskrypcji może znacznie zmniejszyć przebieg procesu. Metoda jest zorientowana na wyniki i obejmuje dodanie analogów kapu do reakcji transkrypcji in vitro (IVT). Analogi czapeczki można wprowadzić na początku transkrypcji, a mRNA ze strukturą czapeczki można otrzymać po zakończeniu transkrypcji. Obecne analogi czapeczki trzeciej generacji mogą uniknąć odwrotnego cappingu i bezpośrednio dodawać strukturę Cap 1 do produktu transkrypcji.
Ze względu na immunogenność i skuteczność translacji mRNA in vivo w procesie IVT często przyjmuje się pewne rodzaje zmodyfikowanych NTP, a powszechnymi modyfikowanymi nukleotydami są pseudourydyna (Ψ), N1-metylopseudourydyna (N1Ψ) i 5-metylocytozyna (5mC) .
Rysunek: Schemat reakcji kotranskrypcji i reakcji cappingu mRNA
Usługi | Szczegóły usługi | Okres dostawy (dzień roboczy) |
Capping kotranskrypcyjny | Odpowiedź transkrypcyjna in vitro (analog Clean Cap) | 1-2 |
Modyfikacje nukleotydów (Ψ/N1Ψ/5mC) | ||
Usuwanie matrycy DNA (DNaza I) | ||
Optymalizacja stanu IVT – opcjonalna | Projektowanie i optymalizacja elementów reakcji | 3-7 |
Wiele opcjonalnych strategii modyfikacji nukleotydów może poprawić ekspresję białka.
Osiągnij wysoki współczynnik transkrypcji i wysoką wydajność zamykania.
Osiągnij poziom ograniczenia powyżej 95%.
Skutecznie zapobiegaj degradacji mRNA poprzez ścisłą kontrolę RNazy w środowisku eksperymentalnym i materiałach eksploatacyjnych.
Firma Yaohai Bio-Pharma zbudowała dojrzałą platformę procesu kotranskrypcyjnego zamykania, wykorzystując analogi czystej czapeczki do bezpośredniego dodawania struktury Cap1, unikając jednocześnie odwrotnego zamykania. Po standaryzowanej obróbce wstępnej próbki i wykryciu metodą elektroforezy kapilarnej (CE), stopień zamykania mRNA o wzmocnionym białku zielonej fluorescencji (eGFP) może osiągnąć ponad 95%.
Skuteczność zamykania mRNA eGFP powyżej 95%
mRNA eGFP i mRNA mCherry przygotowane przez czapeczkę kotranskrypcyjną transfekuje się odpowiednio do komórek 293T, a po 48 godzinach obserwuje się silny sygnał fluorescencyjny, co sugeruje, że mRNA ulega skutecznej ekspresji w komórkach 293T.
Ekspresja mRNA eGFP i mRNA mCherry w komórce 293T