Jeśli chodzi o masową produkcję mRNA, transkrypcja in vitro (IVT) jest bardziej wydajną i dojrzałą metodą. W reakcji IVT jako matrycę wykorzystuje się linearyzowany plazmidowy DNA zawierający promotor T7, a mRNA syntetyzuje się z trifosforanami nukleozydów (NTP) jako substratami w obecności polimerazy RNA T7.
Modyfikacja nukleotydów stanowi przełom w eksploracji mRNA, gdzie niezmodyfikowane cząsteczki mRNA są rozpoznawane przez wewnątrzkomórkowe czujniki RNA w celu aktywacji wrodzonej odporności. Ze względu na immunogenność i skuteczność translacji mRNA in vivo w procesie IVT zwykle wykorzystuje się pewne rodzaje zmodyfikowanych NTP, a powszechnie stosowanymi modyfikowanymi nukleotydami są pseudourydyna (Ψ), N1-metylopseudourydyna (N1Ψ) i 5-metylocytozyna (5mC).
Schemat reakcji transkrypcji in vitro (IVT).
Usługa opcjonalna | Szczegóły usługi | Okres dostawy (dzień roboczy) |
Transkrypcja in vitro (IVT) | IVT, transkrypcja in vitro | 1 |
Modyfikacje nukleotydów (Ψ/N1Ψ/5mC itp.) | ||
Usuwanie matrycy DNA (DNaza I) | ||
Optymalizacja stanu IVT – opcjonalna | Projektowanie i optymalizacja komponentów reakcji IVT | 2-5 |
Popraw stabilność mRNA i ekspresję białka in vivo.
Można uzyskać fragment mRNA o wielkości do 10 kb.
Optymalizując warunki reakcji IVT, szybkość transkrypcji wynosi do 1:200.
Ścisła kontrola RNazy za pomocą środowiska eksperymentalnego i materiałów eksploatacyjnych może skutecznie zapobiegać degradacji mRNA.
Obecny system reakcji IVT jest z grubsza zoptymalizowany dla układów syntetycznych o długości około 100 nt, a nie dla mRNA o dowolnej długości. Im dłuższa sekwencja mRNA, tym trudniejsza do transkrypcji i tym bardziej podatna na degradację.
W celu przygotowania spersonalizowanych sekwencji mRNA o długości około 10 kb, Yaohai Bio-Pharma z sukcesem przygotowała wysokiej jakości próbki o wysokim współczynniku transkrypcji 1:135 i uzyskała 135 µg wstępnie oczyszczonych produktów mRNA po 1 µg linearyzowanego plazmidu transkrybowano in vitro poprzez rygorystyczny projekt eksperymentalny, ciągłą optymalizację warunków reakcji i ścisłą kontrolę RNazy.
Identyfikacja mRNA (elektroforeza w żelu agarozowym)