W przypadku masowej produkcji mRNA, transkrypcja in vitro (IVT) jest bardziej wydajną i dojrzałą metodą. Reakcja IVT używa liniowego DNA plazmidowego zawierającego promotor T7 jako szablonu, a mRNA syntetyzuje się z nukleotydów tryfosforanowych (NTP) jako substratów w obecności polimerazy RNA T7.
Modyfikacja nukleotydów to przełom w badaniach nad mRNA, gdzie niezmodyfikowane molekuły mRNA są rozpoznawane przez wewnętrznekomórkowe czujniki RNA, aktywując odporność wrodzoną. Ze względu na immunogeniczność mRNA in vivo i efektywność translacji, proces IVT zwykle wykorzystuje pewne rodzaje zmodyfikowanych NTP, a powszechnie stosowane zmodyfikowane nukleotydy to pseudourydyna (Ψ), N1-metyl-pseudourydyna (N1Ψ) i 5-metylcytozyna (5mC).
Schemat reakcji transkrypcji in vitro (IVT)
Opcjonalne Usługi |
Szczegóły usług |
Okres dostawy (dzień roboczy) |
Transkrypcja in vitro (IVT) |
IVT, Transkrypcja in vitro | 1 |
Modyfikacje nukleotydowe (Ψ/N1Ψ/5mC itp.) | ||
Usunięcie szablonu DNA (DNaza I) | ||
Optymalizacja warunków IVT - opcjonalnie |
Projektowanie i optymalizacja składników reakcji IVT | 2-5 |
Poprawa stabilności mRNA i wyrażenia białka in vivo.
przygotowanie fragmentu mRNA o długości do 10kb jest możliwe.
Dzięki optymalizacji warunków reakcji IVT, temp transkrypcji wynosi aż 1:200.
Surowa kontrola RNase za pomocą środowiska laboratoryjnego i zużywalnych materiałów może skutecznie zapobiec degradacji mRNA.
Obecny system reakcji IVT jest w przybliżeniu zoptymalizowany dla systemów syntetycznych o długości około 100 nt, nie dla mRNA o dowolnej długości. Im dłuższy jest ciąg mRNA, tym trudniej go transkrybować i tym bardziej podatny na degradację.
Aby przygotować zindywidualizowane sekwencje mRNA o długości około 10 kb, Yaohai Bio-Pharma pomyślnie przygotowała wysokiej jakości próbki z wysokim współczynnikiem transkrypcji wynoszącym 1:135 i uzyskała 135 μg początkowo oczyśćonych produktów mRNA po transkrypcji in vitro 1 μg plazmy liniowej dzięki ścisłemu projektowi eksperymentalnemu, ciągłej optymalizacji warunków reakcji oraz surowemu kontrolowaniu RNase.
identyfikacja mRNA (elektroforeza w gelu agarowym)