Codon-Optimierungsstrategien

Es gibt 64 genetische Codons, von denen 60 für 20 Aminosäuren codieren. Jedes Organismus, der für die Proteinausdrucks- oder -produktion verwendet wird (einschließlich Escherichia coli, Hefen, Säugetierzellen, Pichia, Pflanzenzellen und Insektenzellen), zeigt einen gewissen Grad an Unterschied oder Präferenz in der Codonverwendung. Die am häufigsten verwendeten Codons in einem Wirt werden optimale Codons genannt, während die selten verwendeten als seltene oder wenig genutzte Codons bezeichnet werden.

Codonoptimierung

Codonoptimierung umfasst die Modifikation einer Gensequenz durch die Nutzung bevorzugter Codons und das Vermeiden von wenig genutzten oder seltenen Codons, gefolgt von der Gewinnung der modifizierten Gensequenz durch Gensynthese. Diese Neugestaltung von Genen wird als Codonoptimierung bezeichnet.

Eine optimierte Gensequenz kann die Stabilität der mRNA-Sekundärstruktur verbessern und Übersetzungsverzögerungen, vorzeitige Übersetzungsbeendigung, Translationsframeshifts sowie Aminosäuremissmatches aufgrund unzureichender tRNA-Pools verhindern.

Die Optimierung ist von Bedeutung, da sie die effiziente Förderung von Prozessen wie Genschynthese, Vektoraufbau, Transkription und Translation ermöglicht.

Optimierungsaspekte

Ausgleich des GC-Gehalts: Dies wirkt sich auf die Bindungsstabilität, das Anrempfungstemperatur und den Proteinausbeute aus.

Reduzierung wiederholender Sequenzen: Dies verringert die Schwierigkeit der Genschynthese.

Anpassung der mRNA-Sekundärstruktur: Um Haarpinstrukturen zu vermeiden, die die Translation beeinträchtigen.

Beseitigung von Einschnittstellen für Restriktionsenzyme : Um die Integrität des Gens zu schützen.

Codonpräferenz: Optimieren Sie das Donorgen entsprechend dem Wirt, um die Proteinausdrucksmenge zu maximieren.

Yaohais Unterstützung

Für Genentwurf und -synthese reicht der einfache Proteinausdruck und Codonoptimierung nicht aus. Verschiedene Methoden und Programme können unterschiedliche codon-optimierte mRNA-Sequenzen entwerfen und produzieren. Basierend auf den oben genannten Optimierungsfaktoren, in Kombination mit seiner offiziellen Datenbank und unter Berücksichtigung jahrelanger Erfahrung in der Gensynthese, hat Yaohai Bio-Pharma seine einzigartige Codonoptimierungsdatenbank entwickelt. Sie kann Ihnen kostenlose Codonoptimierung und Entwurf eines Gensynthesekonzepts zur Maximierung der Codonoptimierung Ihrer Gensequenz bieten.

Yaohai Bio-Pharma hat eine vollständige Reihe von Technologien zur Synthese linearer und zirkularer mRNA etabliert, um hochwertige RNA bereitzustellen, wie Sequenzdesign und -optimierung, Gensynthese, IVT, Zirkulierung, RNA-Reinigung und LNP-Verkapselung.

Wir suchen aktiv nach globalen Partnern, sei es Institutionen oder Einzelpersonen. Wir bieten die besten Entschädigungen der Branche. Haben Sie Fragen, zögern Sie nicht, uns zu kontaktieren: [email protected]

Für weitere Details über Yaohai Bio-Pharma besuchen Sie bitte unsere Website: www.yaohaibio-pharma.com