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Progettazione di sequenze di mRNA

Progettazione di sequenze di mRNA

Secondo il dogma centrale, l'RNA messaggero (mRNA) è il ponte per la trasmissione del materiale genetico dal DNA alle proteine.

L'mRNA svolge un ruolo biologico codificando proteine ​​in vivo e l'mRNA maturo negli organismi eucariotici è costituito da cinque componenti: 5' Cap (struttura del cappuccio), 5' UTR (regione non codificante), ORF (open reading frame), 3' UTR e coda 3' poliA (coda di poliadenilato).

indefinito

Dettagli sui servizi
ProcessoServizio opzionalei dettagli del servizioPeriodo di consegna (giorno)
Progettazione e ottimizzazione di sequenze di mRNAProgettazione e ottimizzazione di sequenze di codifica

Allineamento della sequenza CDS

Ottimizzazione del codone CDS

1
Progettazione e ottimizzazione di sequenze non codificanti

Progettazione e ottimizzazione della sequenza UTR 5'

Progettazione e ottimizzazione della sequenza UTR 3'

Progettazione e ottimizzazione della sequenza polyA

1-2
Opzioni personalizzabili
5' UTR/3' UTR
  • Sequenza UTR della natura
  • Sequenza UTR mutante/ingegnerizzata
Coda PolyA da 3'
  • 100A ~120A Coda (consigliato)
  • Coda poliA segmentata
  • Altra coda personalizzata
Strategie comuni per la progettazione di sequenze di mRNA
Componenti dell'mRNAFunzioni biologicheStrategie di ottimizzazione
Cap. 5'Proteggono l'mRNA dalla degradazione da parte delle esonucleasi e agiscono di concerto con la coda poliA all'estremità 3', la proteina legante poliA e la proteina del fattore di inizio della traduzione per avviare la traduzione della proteina.La struttura naturale Cap1 evita i recettori di riconoscimento del pattern e quindi riduce la risposta immunitaria naturale, che può essere ottenuta mediante capping co-trascrizionale in una fase o capping enzimatico in due fasi [vedere capping enzimatico dell'mRNA e capping co-trascrizionale per i dettagli].
5' UTIl 5'UTR può essere riconosciuto dai ribosomi, regolare la traduzione dell'mRNA e influenzare la stabilità dell'mRNA.Contengono sequenze Kozak senza una struttura secondaria molto stabile. Gli UTR naturali di geni altamente espressi sono preferiti per gli mRNA di trascrizione in vitro (IVT) come α-globina e β-globina.
CDSRegioni codificanti proteine ​​e sequenze codificanti per antigeni, anticorpi o altre proteine ​​funzionali.L'ottimizzazione dei codoni aumenta il livello di traduzione, notando che alcuni codoni non ottimali possono svolgere un ruolo nel ripiegamento delle proteine.
3' UTRegolare la traduzione e la stabilità dell'mRNA.Gli UTR naturali di geni altamente espressi sono preferiti per gli mRNA dell'IVT come l'α-globina e la β-globina.
Coda poliA da 3'Regolano l'espressione proteica e proteggono la struttura del cappuccio dalla degradazione.È richiesta una lunghezza adeguata (100-150 bp); la codifica della coda polyA sul plasmide modello di trascrizione garantisce una lunghezza della coda polyA più definita.
Le nostre caratteristiche
  • Selezione diversificata della fonte UTR

Fonti multiple di librerie UTR naturali e modificate altamente espresse; strategia matura di modifica dell'UTR;

  • Team di ottimizzazione CDS all'avanguardia

Collabora con un team di algoritmi AI professionale per completare l'ottimizzazione dei codoni.

  • Anche la distribuzione della coda polyA

Aggiungere sequenze di poliA secondo i modelli di DNA per controllare la lunghezza dell'mRNA in modo più preciso.

  • Combinazioni di ottimizzazione diversificate

Ottenere un'espressione efficiente dell'mRNA con bassa immunogenicità.

Caso di studio

Progettazione della sequenza di un mRNA a doppio reporter: mRNA mCherry-eGFP

Il servizio mRNA di Yaohai Bio-Pharma continua a essere aggiornato con la progettazione e l'ottimizzazione di una sequenza tandem di geni reporter doppi, che raggiunge la coespressione di geni doppi.

Utilizzando un reagente di trasfezione convenzionale, l'mRNA della sequenza tandem del doppio gene mCherry-eGFP viene trasfettato in cellule 293T e due segnali fluorescenti di mCherry (rosso) e della proteina fluorescente verde potenziata (eGFP) vengono rilevati con espressione simultanea dopo 48 ore e l'mRNA impilato il grafico è evidenziato in giallo.

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Espressione dell'mRNA di mCherry-eGFP nella cellula 293T

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