Secondo il dogma centrale, l'RNA messaggero (mRNA) è il ponte per la trasmissione del materiale genetico dal DNA alle proteine.
L'mRNA svolge un ruolo biologico codificando proteine in vivo e l'mRNA maturo negli organismi eucariotici è costituito da cinque componenti: 5' Cap (struttura del cappuccio), 5' UTR (regione non codificante), ORF (open reading frame), 3' UTR e coda 3' poliA (coda di poliadenilato).
Processo | Servizio opzionale | i dettagli del servizio | Periodo di consegna (giorno) |
Progettazione e ottimizzazione di sequenze di mRNA | Progettazione e ottimizzazione di sequenze di codifica | Allineamento della sequenza CDS Ottimizzazione del codone CDS | 1 |
Progettazione e ottimizzazione di sequenze non codificanti | Progettazione e ottimizzazione della sequenza UTR 5' Progettazione e ottimizzazione della sequenza UTR 3' Progettazione e ottimizzazione della sequenza polyA | 1-2 |
5' UTR/3' UTR |
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Coda PolyA da 3' |
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Componenti dell'mRNA | Funzioni biologiche | Strategie di ottimizzazione |
Cap. 5' | Proteggono l'mRNA dalla degradazione da parte delle esonucleasi e agiscono di concerto con la coda poliA all'estremità 3', la proteina legante poliA e la proteina del fattore di inizio della traduzione per avviare la traduzione della proteina. | La struttura naturale Cap1 evita i recettori di riconoscimento del pattern e quindi riduce la risposta immunitaria naturale, che può essere ottenuta mediante capping co-trascrizionale in una fase o capping enzimatico in due fasi [vedere capping enzimatico dell'mRNA e capping co-trascrizionale per i dettagli]. |
5' UT | Il 5'UTR può essere riconosciuto dai ribosomi, regolare la traduzione dell'mRNA e influenzare la stabilità dell'mRNA. | Contengono sequenze Kozak senza una struttura secondaria molto stabile. Gli UTR naturali di geni altamente espressi sono preferiti per gli mRNA di trascrizione in vitro (IVT) come α-globina e β-globina. |
CDS | Regioni codificanti proteine e sequenze codificanti per antigeni, anticorpi o altre proteine funzionali. | L'ottimizzazione dei codoni aumenta il livello di traduzione, notando che alcuni codoni non ottimali possono svolgere un ruolo nel ripiegamento delle proteine. |
3' UT | Regolare la traduzione e la stabilità dell'mRNA. | Gli UTR naturali di geni altamente espressi sono preferiti per gli mRNA dell'IVT come l'α-globina e la β-globina. |
Coda poliA da 3' | Regolano l'espressione proteica e proteggono la struttura del cappuccio dalla degradazione. | È richiesta una lunghezza adeguata (100-150 bp); la codifica della coda polyA sul plasmide modello di trascrizione garantisce una lunghezza della coda polyA più definita. |
Fonti multiple di librerie UTR naturali e modificate altamente espresse; strategia matura di modifica dell'UTR;
Collabora con un team di algoritmi AI professionale per completare l'ottimizzazione dei codoni.
Aggiungere sequenze di poliA secondo i modelli di DNA per controllare la lunghezza dell'mRNA in modo più preciso.
Ottenere un'espressione efficiente dell'mRNA con bassa immunogenicità.
Progettazione della sequenza di un mRNA a doppio reporter: mRNA mCherry-eGFP
Il servizio mRNA di Yaohai Bio-Pharma continua a essere aggiornato con la progettazione e l'ottimizzazione di una sequenza tandem di geni reporter doppi, che raggiunge la coespressione di geni doppi.
Utilizzando un reagente di trasfezione convenzionale, l'mRNA della sequenza tandem del doppio gene mCherry-eGFP viene trasfettato in cellule 293T e due segnali fluorescenti di mCherry (rosso) e della proteina fluorescente verde potenziata (eGFP) vengono rilevati con espressione simultanea dopo 48 ore e l'mRNA impilato il grafico è evidenziato in giallo.
Espressione dell'mRNA di mCherry-eGFP nella cellula 293T