Порівняно з двоетапним ферментативним кепуванням одноетапний метод котранскрипційного кепування може значно зменшити перебіг процесу. Метод орієнтований на результат і передбачає додавання кеп-аналогів до реакції транскрипції in vitro (IVT). Кеп-аналоги можна вводити на початку транскрипції, а мРНК з кеп-структурою можна отримати після завершення транскрипції. Сучасні аналоги кепа третього покоління можуть уникнути зворотного кепінгу та безпосередньо додати структуру Cap 1 до продукту транскрипції.
З міркувань імуногенності та ефективності трансляції мРНК in vivo процес IVT часто використовує певні типи модифікованих NTP, а поширеними модифікованими нуклеотидами є псевдоуридин (Ψ), N1-метил-псевдоурі-дин (N1Ψ) і 5-метилцитозин (5mC) .
Малюнок: Діаграма реакції котранскрипції та кепування мРНК
Обслуговування | Сервісні деталі | Період доставки (робочий день) |
Котранскрипційне кепування | Відповідь на транскрипцію in vitro (аналог Clean Cap) | 1-2 |
Модифікації нуклеотидів (Ψ/N1Ψ/5mC) | ||
Видалення шаблону ДНК (DNase I) | ||
Оптимізація стану IVT - опціонально | Проектування та оптимізація компонентів реакції | 3-7 |
Кілька додаткових стратегій модифікації нуклеотидів можуть покращити експресію білка.
Досягніть високого коефіцієнта транскрипції та високої ефективності обмеження.
Досягніть рівня обмеження понад 95%.
Ефективно запобігайте деградації мРНК шляхом суворого контролю РНКази в експериментальному середовищі та витратних матеріалах.
Компанія Yaohai Bio-Pharma розробила зрілу платформу процесу котранскрипційного кепування, використовуючи чисті кеп-аналоги для безпосереднього додавання структури Cap1, уникаючи зворотного кеппування. Після стандартизованої попередньої обробки зразка та виявлення капілярним електрофорезом (CE) швидкість блокування мРНК посиленого зеленого флуоресцентного білка (eGFP) може досягати понад 95%.
Ефективність блокування мРНК eGFP понад 95%
МРНК eGFP і мРНК mCherry, отримані за допомогою котранскрипційного кепування, трансфікуються в клітини 293T відповідно, і через 48 годин спостерігається сильний флуоресцентний сигнал, що свідчить про те, що мРНК ефективно експресується в клітинах 293T.
Експресія мРНК eGFP і мРНК mCherry в клітині 293T