Що стосується масового виробництва мРНК, транскрипція in vitro (IVT) є більш ефективним і зрілим методом. Реакція IVT приймає лінеаризовану плазмідну ДНК, що містить промотор Т7, як матрицю, і мРНК синтезується з нуклеозидтрифосфатами (NTP) як субстратами в присутності РНК-полімерази Т7.
Модифікація нуклеотидів є проривом у дослідженні мРНК, коли немодифіковані молекули мРНК розпізнаються внутрішньоклітинними РНК-сенсорами для активації вродженого імунітету. З огляду на імуногенність мРНК in vivo та ефективність трансляції, процес IVT зазвичай використовує певні типи модифікованих NTP, а поширеними модифікованими нуклеотидами є псевдоуридин (Ψ), N1-метил-псевдоуридин (N1Ψ) і 5-метилцитозин (5mC).
Діаграма реакції транскрипції in vitro (IVT).
Додаткова послуга | Сервісні деталі | Період доставки (робочий день) |
Транскрипція in vitro (IVT) | IVT, транскрипція in vitro | 1 |
Модифікації нуклеотидів (Ψ/N1Ψ/5mC тощо) | ||
Видалення шаблону ДНК (DNase I) | ||
Оптимізація стану IVT - опціонально | Проектування та оптимізація компонентів реакції IVT | 2-5 |
Покращує стабільність мРНК і експресію білка in vivo.
Можна отримати фрагмент мРНК розміром до 10 кб.
Завдяки оптимізації умов реакції IVT швидкість транскрипції досягає 1:200.
Суворий контроль РНКази за допомогою експериментального середовища та витратних матеріалів може ефективно запобігти деградації мРНК.
Сучасна реакційна система IVT приблизно оптимізована для синтетичних систем довжиною близько 100 нт, а не для мРНК довільної довжини. Чим довша послідовність мРНК, тим складніше її транскрибувати і тим більше вона схильна до деградації.
Щоб підготувати індивідуальні послідовності мРНК довжиною близько 10 кб, Yaohai Bio-Pharma успішно підготувала високоякісні зразки з високим співвідношенням транскрипції 1:135 і отримала 135 мкг початково очищених продуктів мРНК після 1 мкг лінеаризованої плазміди. був транскрибований in vitro шляхом ретельного експериментального дизайну, постійної оптимізації умов реакції та суворого контролю РНКази.
Ідентифікація мРНК (електрофорез у агарозному гелі)