За центральною догмою, месенджерна РНК (mRNA) є мостом для передачі генетичного матеріалу від ДНК до білків.
mRNA виконує біологічну роль, кодуючи білки in vivo, і зріла mRNA у еукаріотних організмах складається з п'яти компонентів: 5' Cap (капова структура), 5' UTR (нерозкодована область), ORF (відкритий читальний фрейм), 3' UTR та 3' polyA хвіст (поліаденілатний хвіст).
Процес | Опціональні послуги | Деталі послуги | Термін доставки (днів) |
проектування та оптимізація послідовності mRNA | Проектування та оптимізація кодуючих послідовностей |
Вирівнювання послідовності CDS Оптимізація кодонів CDS |
1 |
Проектування та оптимізація некодуючих послідовностей |
проектування та оптимізація послідовності 5' UTR проектування та оптимізація послідовності 3' UTR проектування та оптимізація послідовності polyA |
1-2 |
5’ UTR/3’ UTR |
|
3' ПоліА хвіст |
|
компоненти mRNA | Біологічні функції | Стратегії оптимізації |
5’ Кап | Захищає mRNA від деградації екзонуклеазами та взаємодіє з поліA хвостом у 3' кінці, білком, що зв'язується з поліA, та фактором ініціації перекладу для початку перекладу білок. | Натуральна структура Cap1 уникне рецепторів розпізнавання патернів, а отже зменшує природну імунну відповідь, яка може бути досягнута за допомогою одноетапного спільного капування або двохетапного ензиматичного капування [див. детально про ензиматичне капування mRNA та спільне капування]. |
5' НТР | 5' НТР може бути впізнано рибосомами, регулювати трансляцію мРНК і впливати на стабільність мРНК. | Містять секвенції Козак без дуже стабільної вторинної структури. Природні НТР генів, які високо експресуються, перевага для транскрипції in vitro (IVT) мРНК, таких як α-глобін і β-глобін. |
КДС | Регіони кодування белка та кодуючі послідовності для антигенів, антитіл або інших функціональних белків. | Оптимізація кодонів збільшує рівень трансляції, зауважуючи, що деякі неоптимальні кодони можуть грати роль у складанні белка. |
3' НТР | Регулюють трансляцію мРНК і її стабільність. | Природні НТР генів, які високо експресуються, перевага для мРНК IVT, таких як α-глобін і β-глобін. |
3' поліА хвіст | Регулювати виразку протеїнів та захищати капову структуру від деградації. | Необхідна достатня довжина (100-150 бп); кодування поліаденінового хвоста на плазмідному шаблоні транскрипції забезпечує більш визначену довжину поліаденінового хвоста. |
Кілька джерел природних та модифікованих бібліотек UTR з високою експресією; стратегія зрілого модифікування UTR;
Співпрацювати із професійною командою алгоритмів ШИ, щоб завершити оптимізацію кодонів.
Додавати поліаденінові послідовності за шаблонами ДНК, щоб точніше контролювати довжину мРНК.
Досягти ефективної експресії мРНК з низькою імуногенністю.
Проектування послідовності двостаткового mRNA: mCherry-eGFP mRNA
Сервіс mRNA від Yaohai Bio-Pharma постійно покращується завдяки проектуванню та оптимізації тандемної послідовності подвійного репортерного гена, яка забезпечує спільне вираження двох генів.
За допомогою традиційного трансфекційного агента тандемна послідовність подвійного гена mCherry-eGFP mRNA трансфікується у клітини 293T, і після 48 годин виявляються два флуоресцентні сигналу: mCherry (червоний) та збільшений зелений флуоресцентний протеїн (eGFP) з одночасним вираженням, а комбінований графік виділений жовтим кольором.
Вираження mRNA mCherry-eGFP у клітинах 293T