Pokiaľ ide o hromadnú výrobu mRNA, transkripcia in vitro (IVT) je efektívnejšou a zrelší metódou. Reakcia IVT používa linearizovaný plazmidový DNA s T7 promotorom ako šablónu a mRNA sa syntetizuje s nukleozidovými trifosfátami (NTPs) ako substrátmi v prítomnosti T7 RNA polymerázy.
Úprava nukleotidov je prelom v štúdiu mRNA, kde neupravené mRNA molekuly sú rozpoznaté intracelulárnymi senzorami RNA na aktiváciu vrodenej imunity. Z dôvodu imunogennosti mRNA in vivo a účinnosti prekladu sa v procese IVT obvykle používajú určité druhy upravených NTP-ov, a bežne používané upravené nukleotidy sú pseudouridín (Ψ), N1-methyl-pseudouridín (N1Ψ) a 5-methylcytosín (5mC).
Schéma reakcie in vitro transkripcie (IVT)
Voliteľná služba |
Podrobnosti služby |
Doba dodania (pracovné dni) |
Transkripcia in vitro (IVT) |
IVT, in vitro transkripcia | 1 |
Úpravy nukleotidov (Ψ/N1Ψ/5mC atď.) | ||
Odstránenie DNA šablóny (DNase I) | ||
Optimalizácia podmienok IVT - voliteľné |
Návrh a optimalizácia komponentov reakcie IVT | 2-5 |
Zlepšenie stability mRNA a expresie proteínov in vivo.
pриprava fragmentov mRNA až do dĺžky 10kb je možná.
Pomocou optimalizácie podmienok reakcie IVT je rýchlosť preklepania až 1:200.
Prísna kontrola RNase cez experimentálne prostredie a spotrebné materiály môže efektívne predchádzať degradácii mRNA.
Aktuálny IVT reakčný systém je približne optimalizovaný pre syntetické systémy s dĺžkou asi 100 nt, nie pre mRNA ľubovoľnej dĺžky. Čím je dlhšia sekvencia mRNA, tým je ťažšie ju transkribovať a tým je citlivejšia na degradáciu.
Aby bolo možné pripraviť vlastné mRNA sekvencie s dĺžkou asi 10 kb, spoločnosť Yaohai Bio-Pharma úspešne pripravila vysokokvalitné vzorky s vysokým pomermom transkripcie 1:135 a získala 135 μg počiatočne očistených mRNA produktov po tom, čo bola in vitro transkribovaná 1 μg linearizovaného plazmidu prostredníctvom prísne navrhnutých experimentov, spojitých optimalizácií podmienok reakcie a prísneho kontrolovania RNase.
identifikácia mRNA (Agarózová gelektroforeza)