Podľa centrálneho dogmatu je pośliace RNA (mRNA) mostom pre prenos genetického materiálu z DNA do białok.
mRNA vykonáva biologickú funkciu kódovaním białok in vivo, a zrelá mRNA v eukaryotických organizmomach sa skladá z piatich komponentov: 5' Cap (kapová štruktúra), 5' UTR (nekódovacia oblasť), ORF (otvorená čítacia ramena), 3' UTR a 3' polyA chvost (polyadenylátový chvost).
Proces | Voliteľná služba | Podrobnosti služby | Dobový obdobie doručenia (Deň) |
návrh a optimalizácia sekvencie mRNA | Návrh a optimalizácia kódovacích sekvencií |
Zarovnanie CDS sekvencie Optimalizácia CDS kodónov |
1 |
Návrh a optimalizácia nekódovacích postupností |
návrh a optimalizácia sekvencie 5' UTR návrh a optimalizácia sekvencie 3' UTR návrh a optimalizácia polyA sekvencie |
1-2 |
5’ UTR/3’ UTR |
|
3' PolyA chvost |
|
komponenty mRNA | Biológicke funkcie | Strategie optimalizácie |
5’ Cap | Chráni mRNA pred degradáciou exonukleázami a spolupracuje s polyA chvostom na 3' konci, polyA vázovacím proteínom a proteínom iniciácie prekladu na zahajanie prekladu proteínu. | Prirodzená Cap1 štruktúra vyhýja detekcii receptorami pre vzory a tak zníži prirodzenú imunológicku odpoveď, ktorú je možné dosiahnuť jednopriestupným kotovaním po transkripcii alebo dvojpriestupným enzymatickým kotovaním [viď podrobnosti v časti mRNA enzymatické kotovanie a kotovanie počas transkripcie]. |
5' UTR | 5' UTR môže byť uznaný ribosómami, regulovať preklad mRNA a ovplyvňovať stabilitu mRNA. | Obsahujú Kozakovu sekvenciu bez veľmi stabilnej sekundárnej štruktúry. Prirodzené UTR vysoce exprimovaných génov sú preferované pre in vitro transkripciu (IVT) mRNA, ako napríklad α-globin a β-globin. |
CDS | Oblasť kódujúca pre proteíny a kódovacie postupnosti pre antigeny, antitela alebo iné funkčné proteíny. | Optimalizácia kodónov zvyšuje úroveň prekladu, pričom sa poznamenáva, že niektoré neoptimálne kodóny môžu hráť rolu v ohybe bielek. |
3' UTR | Regulujú preklad mRNA a stabilitu mRNA. | Pre IVT mRNA sa preferujú prirodzené UTR vysoce exprimovaných génov, ako sú α-globin a β-globin. |
3' polyA chvost | Regulujú expresiu bílkovín a chránia kapovú štruktúru pred degradáciou. | Vyžaduje sa dostatočná dĺžka (100-150 bp); kódovanie polyA chvosta na plazmidovej transkripčnej šablóne zabezpečí presnejšiu dĺžku polyA chvosta. |
Viaceré zdroje prirodzených a modifikovaných knižníc UTR vysoce exprimovaných génov; zrelá stratégia modifikácie UTR;
Spolupracujte s profesionálnym tímom algoritmov umelej inteligencie na dokončenie optimalizácie kodónov.
Pridajte polyA postupnosti podľa DNA šablón, aby ste presnejšie ovládali dĺžku mRNA.
Dosiahnite účinné vyjadrenie mRNA s nízkou imunogennosťou.
Návrh sekvencie dvojitého reportérského mRNA: mCherry-eGFP mRNA
Služba mRNA od Yaohai Bio-Pharma sa neustále vylepšuje pomocou návrhu a optimalizácie tandemovej sekvencie dvojitých reportérskych génov, čo umožňuje spoločné vyjadrenie dvoch génov.
Pomocou konvenčného transférového liečidla sa tandemová sekvencia dvojitých génov mCherry-eGFP mRNA transfekuje do buniek 293T a po 48 hodinách sa detekujú dve fluorescenčné signály mCherry (červená) a zväčšená zelená fluorescenčná bielecina (eGFP) s simultánne vyjadrením, pričom zásobníkový graf je zdôraznený žltou farbou.
Vyjadrenie mRNA mCherry-eGFP v bunkách 293T