I følge det sentrale dogmet er messenger RNA (mRNA) broen for overføring av genetisk materiale fra DNA til proteiner.
mRNA spiller en biologisk rolle ved å kode proteiner in vivo, og modent mRNA i eukaryote organismer består av fem komponenter: 5' Cap (cap struktur), 5' UTR (ikke-kodende region), ORF (åpen leseramme), 3' UTR , og 3' polyA hale (polyadenylat hale).
Prosess | Valgfri tjeneste | Tjenestedetaljer | Leveringsperiode (dag) |
mRNA-sekvensdesign og -optimalisering | Design og optimalisering av kodesekvenser | CDS-sekvensjustering CDS kodonoptimalisering | 1 |
Design og optimalisering av ikke-kodende sekvenser | 5' UTR-sekvensdesign og optimalisering 3' UTR-sekvensdesign og optimalisering polyA sekvensdesign og optimalisering | 1-2 |
5' UTR/3' UTR |
|
3' PolyA hale |
|
mRNA-komponenter | Biologiske funksjoner | Optimaliseringsstrategier |
5' Cap | Beskytt mRNA fra nedbrytning av eksonukleaser og opptre i samspill med polyA-halen i 3'-enden, polyA-bindende protein og translasjonsinitieringsfaktorprotein for å initiere proteintranslasjon. | Den naturlige Cap1-strukturen unngår mønstergjenkjenningsreseptorer og reduserer dermed den naturlige immunresponsen, som kan oppnås ved ett-trinns co-transkripsjonell kapping eller totrinns enzymatisk kapping [se mRNA-enzymatisk kapping og co-transkripsjonell kapping for detaljer]. |
5' UTR | 5' UTR kan gjenkjennes av ribosomer, regulere translasjonen av mRNA og påvirke stabiliteten til mRNA. | Inneholder Kozak-sekvenser uten en veldig stabil sekundærstruktur. Naturlige UTR-er av høyt uttrykte gener er foretrukket for in vitro-transkripsjon (IVT) mRNA som α-globin og β-globin. |
CDS | Proteinkodende regioner og kodende sekvenser for antigener, antistoffer eller andre funksjonelle proteiner. | Kodonoptimalisering øker translasjonsnivået, og bemerker at visse ikke-optimale kodoner kan spille en rolle i proteinfolding. |
3' UTR | Reguler mRNA-translasjon og stabilitet. | Naturlige UTR-er av høyt uttrykte gener er foretrukket for IVT-mRNA som α-globin og β-globin. |
3' polyA hale | Regulerer proteinekspresjon og beskytter kapselstrukturen mot nedbrytning. | Tilstrekkelig lengde (100-150 bp) kreves; koder for polyA-hale på transkripsjonsmalplasmidet sikrer en mer definert polyA-halelengde. |
Flere kilder til høyt uttrykte naturlige og modifiserte UTR-biblioteker; moden UTR modifikasjonsstrategi;
Samarbeid med et profesjonelt AI-algoritmeteam for å fullføre optimaliseringen av kodoner.
Legg til polyA-sekvenser i henhold til DNA-maler for å kontrollere mRNA-lengden mer presist.
Oppnå effektiv ekspresjon av mRNA med lav immunogenisitet.
Sekvensdesign av et mRNA med dobbel reporter: mCherry-eGFP mRNA
Yaohai Bio-Pharmas mRNA-tjeneste fortsetter å bli oppgradert med design og optimalisering av en dobbel reportergen-tandemsekvens, som oppnår samuttrykk av doble gener.
Ved å bruke et konvensjonelt transfeksjonsreagens blir den doble gen-tandemsekvensen mCherry-eGFP mRNA transfektert inn i 293T-celler, og to fluorescerende signaler av mCherry (rødt) og forsterket grønt fluorescerende protein (eGFP) detekteres med samtidig ekspresjon etter 48 timer, og stablet grafen er uthevet i gult.
Ekspresjon av mCherry-eGFP mRNA i 293T-celle