Alle Kategorier
ENEN
circRNA sekvensdesign

circRNA sekvensdesign

Hjem >  IVT RNA  >  Tilpasset RNA-syntese  >  Tilpasset circRNA-syntese  >  circRNA sekvensdesign

IVT RNA

circRNA sekvensdesign

Yaohai Bio-Pharma tilbereder circRNA basert på PIE-systemet (justering av eksoner og introner), som er avhengig av selvspleisingsfunksjonen til type I-introner for å oppnå RNA-syklisering. PIE-strukturen er designet ved å bruke T4 td-genet eller fishy tRNA-forløpergenet, og arrangementet er som følger:

RNA-intronet og det støttende eksonfragmentet er delt inn i to deler (5'-terminal og 3'-terminal), hvor den 5'-terminale sekvensen overføres til halen av målsekvensen, den 3'-terminale sekvensen settes inn i fronten av målsekvens, og målgensekvensen settes inn i midten.

undefined

Under katalyse av GTP fører PIE-strukturen til cyklisering av andre sekvenser enn introner. Kombinert med en rimelig forbedringsstrategi for cyclization rate, kan Yaohai Bio-Pharma oppnå cyclization av sekvenser opp til 4 kb med en cyclization rate på mer enn 80%.

undefined

Figur 1. In vitro sirkulasjon av circRNA basert på PIE-systemet

Tjenestedetaljer
Prosess Valgfri tjeneste Tjenestedetaljer Leveringsperiode (arbeidsdag)
circRNA sekvensdesign og optimalisering Design og optimalisering av kodesekvenser

CDS-sekvensjustering

CDS kodonoptimalisering

 1
Design og optimalisering av ikke-kodende sekvenser

Intron og exon sekvensdesign og optimalisering

Homolog armsekvensdesign og optimalisering

Spacer sekvens design og optimalisering

 1-2
Vanlige strategier for mRNA-sekvensdesign
CircRNA-komponenter Biologiske funksjoner Optimaliseringsstrategier
To-terminale intron- og eksonsekvenser GTP-katalysert intron-selvspleising for cyklisering av sekvenser utenfor intronet. Designet i henhold til T4 td-genet eller fiskeolje-tRNA-forløpergenet.
Koding IRES Internt ribosomgjenkjenningssted som regulerer oversettelsen av circRNA. Screening av interne ribosomentry site (IRES) sekvenser fra forskjellige virale kilder, f.eks EMCV, CVB3 kilder.
CDS Proteinkodende regioner, sekvenser som koder for antigener, antistoffer eller andre funksjonelle proteiner. Kodonoptimalisering øker oversettelsesnivået; visse ikke-optimale kodoner kan spille en rolle i proteinfolding.
Ikke-koding Ikke-kodende sekvenser Målrett miRNA eller proteiner for å utøve gen- eller proteinregulering. Målretting av spesifikke bindingssteder for miRNA eller proteiner kan gjenta sekvensene til bindingsstedet.
Våre funksjoner
  • Optimalisert PIE Cyclization System Kombinasjon med rimelige optimaliseringsstrategier for å oppnå en cyclization rate på mer enn 80 %;
  • Nyskapende CDS-optimaliseringsteam Samarbeid med profesjonelt AI-algoritmeteam for å fullføre optimaliseringen av CDS-regionkodoner;
  • Moden og perfekt prosess circRNA kan oppnås med høy cykliseringseffektivitet, høy stabilitet og høy translasjonseffektivitet.
Case study

Yaohai Bio-Pharma lanserte kontrollproduktet enhanced green fluorescent protein (eGFP) circRNA, som er basert på PIE-systemet for å oppnå cyclization av RNA.

Ved å bruke et konvensjonelt transfeksjonsreagens transfekteres eGFP circRNA inn i 293T-celler, og eGFP (grønt) fluorescerende signal kan detekteres etter 24 timer, som vil bli forsterket etter 48 timer. Fluorescenssignalet kan fortsatt detekteres på den 7. dagen og den 14. dagen etter transfeksjon.

图片

In vitro ekspresjonsvalidering av eGFP circRNA

Få et gratis tilbud

Kontakt oss