Yaohai Bio-Pharma lager circRNA basert på PIE-systemet (justering av eksoner og introner), som avhenger av den selvsplicing-funksjonen til type I-introner for å oppnå RNA-sirkulering. PIE-strukturen er designet ved hjelp av T4 td-genen eller fiskets tRNA-forløpergen, og ordningen er som følger:
RNA-intronen og støtteseksongfragmentet deles inn i to deler (5' terminal og 3' terminal), der 5' terminalsekvensen overføres til haleenden av målsekvensen, 3' terminalsekvensen settes foran målsekvensen, og målgenesssekvensen settes inn midt i.
Under katalyse av GTP fører PIE-strukturen til sirkulisering av sekvenser andre enn introner. Kombinert med en rimelig forbedringsstrategi for sirkuliseringshastigheten kan Yaohai Bio-Pharma oppnå sirkulisering av sekvenser på inntil 4 kb med en sirkuliseringshastighet på mer enn 80%.
Figur 1. In vitro-sirkulering av circRNA basert på PIE-systemet
Tjenester detaljer
| Prosess |
Valgfritt tjeneste |
Tjenestedytninger |
Leveringsperiode (arbeidsdag) |
| design og optimalisering av circRNA-sekvenser |
Design og optimering av kodesekvenser |
CDS sekvensjustering
CDS codon-optimering
|
1 |
| Design og optimering av ikke-kodende sekvenser |
Design og optimalisering av intron- og exon-sekvenser
Design og optimisering av homolog arm-sekvens
Design og optimisering av spacer-sekvens
|
1-2 |
Vanlige strategier for mRNA-sekvensdesign
| CircRNA-komponenter |
Biologiske funksjoner |
Optimeringsstrategier |
| To-terminal intron- og exon-sekvenser |
GTP-katalysert intron selv-splicing for sirkulering av sekvenser utenfor intronet. |
Designet etter T4 td-genen eller fiskolje tRNA-forløpergenen. |
| Koding |
IRES |
Intern ribosomgjenkningsside som regulerer oversettelsen av circRNA. |
Skjerming av intern ribosominntrangssider (IRES)-sekvenser fra forskjellige viruskilder, f.eks. EMCV, CVB3-kilder. |
| CDS |
Proteinkodende regioner, sekvenser som koder for antigenner, antistoffer eller andre funksjonelle proteiner. |
Kodonoptimalisering øker oversettelsesnivået; visse ikke-optimale kodoner kan spille en rolle i proteinfolding. |
| Ikke-kodende |
Ikke-kodende sekvenser |
Mål miRNAs eller proteiner for å utøve gen- eller proteinkontroll. |
Målspesifikke bindingssteder for miRNAs eller proteiner kan gjenta sekvensene til bindingsstedet. |
Våre funksjoner
- Optimert PIE-sykliseringsystem kombinert med rimelige optimaliseringsstrategier for å oppnå en sykliseringsrate på mer enn 80%;
- Framtidsteknologisk CDS Optimeringslag Samarbeid med et profesjonelt AI-algoritmelag for å fullføre optimeringen av CDS-regionens kodoner;
- Moden og Perfekt Prosess circRNA kan oppnås med høy sirkulerings-effektivitet, høy stabilitet og høy oversettelseseffektivitet.
Casestudie
Yaohai Bio-Pharma lanserte kontrollproduktet forsterket grønn fluoreserende protein (eGFP) circRNA, som bygger på PIE-systemet for å oppnå sirkulering av RNA.
Ved bruk av et konvensjonelt transfeksjonsmiddel, transfekteres eGFP circRNA i 293T-celler, og eGFP (grønn) fluoreserende signal kan detekteres etter 24 timer, og vil forsterkes etter 48 timer. Fluoreserende signalet kan fortsatt detekteres den 7. og 14. dagen etter transfeksjon.
In vitro uttrykk validering av eGFP circRNA
NO
EN
AR
HR
CS
DA
NL
FI
FR
DE
EL
IT
JA
KO
PL
PT
RO
RU
ES
SV
IW
ID
LV
LT
SR
SK
SL
UK
VI
ET
HU
TH
TR
FA
AF
MS
BE
MK
UR
BN
