Yaohai Bio-Pharma подготвува circRNA врз основа на системот PIE (порамнување на егзони и интрони), кој се потпира на функцијата на самоспојување на интроните од тип I за да се постигне цикализација на РНК. Структурата PIE е дизајнирана со користење на генот T4 td или генот прекурсор на рибина tRNA, а распоредот е како што следува:
Интронот на РНК и фрагментот на потпорниот егзон се поделени на два дела (5' терминал и 3' терминал), каде што 5' терминалната секвенца се пренесува на опашката на целната низа, а 3' терминалната секвенца е вметната во предниот дел на целната секвенца, а целната генска секвенца е вметната во средината.
Под катализа на GTP, структурата на PIE води до циклизација на секвенци различни од интроните. Во комбинација со разумна стратегија за подобрување на стапката на циклизација, Yaohai Bio-Pharma може да постигне циклизација на секвенци до 4 kb со стапка на циклизација од повеќе од 80%.
Слика 1. Ин витро циркулација на circRNA врз основа на PIE системот
Детали за услуги
| Процесот на | Факултативна услуга | Детали за услугата | Период на испорака (работен ден) |
| Дизајн и оптимизација на секвенца на circRNA | Дизајн и оптимизација на секвенци за кодирање | Порамнување на секвенцата на ЦДС Оптимизација на CDS кодони | 1 |
| Дизајн и оптимизација на некодирачки секвенци | Дизајн и оптимизација на секвенци на интрони и егзони Дизајн и оптимизација на секвенца на хомологни краци Дизајн и оптимизација на секвенца на Spacer | 1-2 |
Заеднички стратегии за дизајн на секвенца на mRNA
| Компоненти на CircRNA | Биолошки функции | Стратегии за оптимизација |
| Дво-терминални интрони и егзони секвенци | GTP-катализирано само-спојување на интрони за циклизирање на секвенците надвор од интронот. | Дизајниран според T4 td генот или генот прекурсор на рибино масло tRNA. |
| Кодирање | ИРЕС | Внатрешна локација за препознавање на рибозомот што го регулира транслацијата на circRNA. | Скрининг на секвенци на внатрешно влезно место на рибозом (IRES) од различни вирусни извори, на пр. EMCV, CVB3 извори. |
| ЦДС | Региони за кодирање на протеини, секвенци кои кодираат антигени, антитела или други функционални протеини. | Кодонската оптимизација го зголемува нивото на превод; одредени неоптимални кодони може да играат улога во склопувањето на протеините. |
| Некодирање | Секвенци кои не се кодираат | Целни миРНК или протеини за да вршат регулација на гените или протеините. | Насочувањето на специфичните места за врзување за miRNAs или протеините може да ги повтори секвенците на местото за врзување. |
Нашите карактеристики
- Оптимизиран систем за циклизација на PIE Комбинација со разумни стратегии за оптимизација за да се постигне стапка на циклизација од повеќе од 80%;
- Најсовремен тим за оптимизација на CDS Соработка со професионален тим за алгоритам за вештачка интелигенција за да се заврши оптимизацијата на кодоните на регионот CDS;
- Зрел и совршен процес circRNA може да се постигне со висока ефикасност на цикализација, висока стабилност и висока ефикасност на транслација.
студија на случај
Yaohai Bio-Pharma го лансираше контролниот производ зајакнат зелен флуоресцентен протеин (eGFP) circRNA, кој се базира на системот PIE за да се постигне цикализација на РНК.
Со користење на конвенционален реагенс за трансфекција, eGFP circRNA се трансфицира во 293T клетки, а eGFP (зелениот) флуоресцентен сигнал може да се открие по 24 часа, кој ќе се подобри по 48 часа. трансфекција.
Ин витро валидација на експресија на eGFP circRNA
EN
AR
HR
CS
DA
NL
FI
FR
DE
EL
IT
JA
KO
НЕ
PL
PT
RO
RU
ES
SV
IW
ID
LV
LT
SR
SK
SL
UK
VI
ET
HU
TH
TR
FA
AF
MS
BE
MK
UR
BN
