Volgens die sentrale dogma is boodskapper-RNA (mRNA) die brug vir die oordrag van genetiese materiaal van DNA na proteïene.
mRNA speel 'n biologiese rol deur proteïene in vivo te kodeer, en volwasse mRNA in eukariotiese organismes bestaan uit vyf komponente: 5' Cap (kapstruktuur), 5' UTR (nie-koderende streek), die ORF (oop leesraam), 3ʹ UTR , en 3' polyA stert (poliadenylaat stert).
proses | Opsionele diens | Diensbesonderhede | Afleweringstydperk (dag) |
mRNA volgorde ontwerp en optimalisering | Ontwerp en optimalisering van koderingsreekse | CDS volgorde belyning CDS kodon optimalisering | 1 |
Ontwerp en optimalisering van nie-koderende rye | 5' UTR volgorde ontwerp en optimalisering 3' UTR volgorde ontwerp en optimalisering polyA volgorde ontwerp en optimalisering | 1-2 |
5' UTR/3' UTR |
|
3' PolyA-stert |
|
mRNA-komponente | Biologiese funksies | Optimaliseringstrategieë |
5' Cap | Beskerm mRNA teen degradasie deur eksonukleases en tree saam met die polyA-stert aan die 3'-kant, polyA-bindende proteïen en translasie-inisiasiefaktorproteïen om proteïentranslasie te inisieer. | Die natuurlike Cap1-struktuur vermy patroonherkenningsreseptore en verminder dus die natuurlike immuunrespons, wat bereik kan word deur een-stap ko-transkripsie-bedekking of twee-stap-ensiematiese kapping [sien mRNA-ensiematiese kapping en ko-transkripsie-beperking vir besonderhede]. |
5' UTR | Die 5' UTR kan deur ribosome herken word, reguleer die translasie van mRNA en beïnvloed die stabiliteit van mRNA. | Bevat Kozak-reekse sonder 'n baie stabiele sekondêre struktuur. Natuurlike UTR's van hoogs uitgedrukte gene word verkies vir in vitro transkripsie (IVT) mRNA's soos α-globien en β-globien. |
CDS | Proteïenkoderende streke en koderingsvolgordes vir antigene, teenliggaampies of ander funksionele proteïene. | Kodonoptimalisering verhoog die vlak van translasie, en let daarop dat sekere nie-optimale kodons 'n rol kan speel in proteïenvouing. |
3' UTR | Reguleer mRNA-translasie en stabiliteit. | Natuurlike UTR's van hoogs uitgedrukte gene word verkies vir IVT-mRNA's soos α-globien en β-globien. |
3' polyA stert | Reguleer proteïenuitdrukking en beskerm kapstruktuur teen degradasie. | Voldoende lengte (100-150 bp) word vereis; kodering van polyA stert op die transkripsie templaat plasmied verseker 'n meer gedefinieerde polyA stert lengte. |
Veelvuldige bronne van hoogs uitgedrukte natuurlike en gewysigde UTR-biblioteke; volwasse UTR-wysigingstrategie;
Werk saam met 'n professionele KI-algoritmespan om die optimalisering van kodons te voltooi.
Voeg polyA-volgordes volgens DNA-sjablone by om mRNA-lengte meer presies te beheer.
Bereik doeltreffende uitdrukking van mRNA met lae immunogenisiteit.
Volgorde-ontwerp van 'n dubbel-verslaggewer mRNA: mCherry-eGFP mRNA
Yaohai Bio-Pharma se mRNA-diens word steeds opgegradeer met die ontwerp en optimalisering van 'n dubbelverslaggeen-tandemvolgorde, wat mede-uitdrukking van dubbele gene bewerkstellig.
Met behulp van 'n konvensionele transfekteringsreagens word die dubbelgeen-tandemvolgorde mCherry-eGFP mRNA in 293T-selle getransfekteer, en twee fluoresserende seine van mCherry (rooi) en verbeterde groen fluoresserende proteïen (eGFP) word met gelyktydige uitdrukking na 48 uur opgespoor, en die gestapelde grafiek word in geel uitgelig.
Uitdrukking van mCherry-eGFP mRNA in 293T sel