Alle Kategorieë
circRNA-Sekwensontwerp

circRNA-Sekwensontwerp

Yaohai Bio-Pharma berei circRNA voor op grond van die PIE-stelsel (uitlijning van eksone en introne), wat afhanklik is van die self-splicing funksie van tipe I introne om RNA-sirkulasie te bereik. Die PIE-struktuur word ontwerp deur gebruik te maak van die T4 td gen of vis tRNA voorganger gen, en die rangskikking is as volg:

Die RNA-intron en ondersteunende eksonfragment word in twee dele verdeel (5' terminal en 3' terminal), waar die 5' terminalseksie oorgedra word na die einde van die doelvolgorde, die 3' terminalseksie inset word voor die doelvolgorde, en die doelgenvolgorde word ingesluit in die middel.

undefined

Onder die katalise van GTP lei die PIE-struktuur tot die sikliserings van sekweense anders as introns. Verenig met 'n redelike verbeteringsstrategie van die sikliseringskoers, kan Yaohai Bio-Pharma sikliserings van sekweense van tot 4 kb met 'n sikliseringskoers van meer as 80% bereik.

undefined

Figuur 1. In vitro sirkulasie van circRNA gebaseer op die PIE-stelsel

Dienste Details
Proses Opsionele Diens Diensbesonderhede Leveringstydperk (werkdaag)
circRNA volgordontwerp en -optimering Ontwerp en optimering van koderingssekwenses

Uitlijning van CDS-rye

CDS-kodonoptimalisering

1
Ontwerp en optimalisering van nie-koderende volgordes

Ontwerp en optimering van intron- en exonvolgorde

Ontwerp en optimering van homoloog armvolgorde

Ontwerp en optimering van spacer-volgorde

1-2
Gewone Strategieë vir mRNA Volgordontwerp
CircRNA-Komponente Biologiese Funksies Optimeringsstrategieë
Twee-terminal intron- en exonvolgordes GTP-gekataliseerde intron self-splicing vir sikliserings van volgordes buite die intron. Ontwerp volgens die T4 td gen of visolie tRNA voorganger gen.
Kodering IRES Interne ribosoomherkeningsplek wat die vertaling van circRNA beheer. Skerming van interne ribosoomtoegangspunt (IRES)-volgorde uit verskillende virale bronne, bv. EMCV, CVB3-bronne.
CDS Proteïen-koderende streke, volgorde koderend vir antigene, antileweë of ander funksionele proteïene. Kodonoptimering verhoog die vlak van vertaling; sekere nie-optimale kodone kan 'n rol speel in proteïenvouing.
Nie-koderend Nie-koderende volgorde Doelwit miRNAs of proteïene om gengeregulering of proteïenregulering te uitoefen. Doelwit spesifieke bindingstelle vir miRNAs of proteïene kan die volgorde van die bindingsplek herhaal.
Ons kenmerke
  • Gekoesterde PIE Sikliseringsstelsel kombinasie met redelike optimeringsstrategieë om 'n sikliseringskoers van meer as 80% te bereik;
  • Snydend rand CDS Optimeringsspan saamwerking met 'n professionele AI-algoritme-span om die optimering van CDS-streekkodon te voltooi;
  • Volwasse en Volmaakte Proses circRNA kan met hoë sikliseringsdoeltreffendheid, hoë stabiliteit en hoë vertalingsdoeltreffendheid bereik word.
Gevallestudie

Yaohai Bio-Pharma het die beheerprodukt versterkte groen fluoreserende eiwit (eGFP) circRNA gelans, wat op die PIE-stelsel berus om die siklisering van RNA te bereik.

Deur 'n konvensionele transaksie-agtig te gebruik, word eGFP circRNA in 293T-selle getransfereer, en na 24 ure kan eGFP (groen) fluoreserende sein gedetecteer word, wat na 48 ure versterk sal word. Die fluoreserende sein kan steeds op die sewende dag en veertiende dag na transaksie gedetecteer word.

图片

In vitro uitdrukkingsvalidasie van eGFP circRNA

Kry 'n Gratis Offerte

Get in touch