Strategije optimizacije kodona

Postoje 64 genetska kodona, od kojih 60 kodira 20 aminokiselina. Svaki organizam koji se koristi za ekspresiju ili proizvodnju proteina (uključujući Escherichiu coli, kvasac, stanice sisavaca, Pichia, biljne stanice i stanice kukaca) pokazuje određeni stupanj razlike ili prednosti u korištenju kodona. Kodoni koji se najčešće koriste u domaćinu nazivaju se optimalni kodoni, dok se oni koji se ne koriste često nazivaju rijetkim kodonima ili kodonima niske upotrebe.

Optimizacija kodona

Optimizacija kodona uključuje modificiranje sekvence gena korištenjem poželjnih kodona i izbjegavanjem slabo korištenih ili rijetkih kodona, a zatim dobivanje modificiranog gena putem sinteze gena. Ovaj redizajn gena naziva se optimizacija kodona.

Optimizirana sekvenca gena može poboljšati stabilnost sekundarne strukture mRNA, sprječavajući odgode translacije, preuranjeni završetak translacije, translacijsku promjenu okvira i nepodudaranja aminokiselina zbog nedovoljnih skupova tRNA.

Optimizacija je značajna jer olakšava učinkovito napredovanje procesa kao što su sinteza gena, konstrukcija vektora, transkripcija i translacija.

Čimbenici optimizacije

Balansiranje GC sadržaja: To utječe na stabilnost vezanja, temperaturu žarenja i prinos proteina.

Smanjenje nizova koji se ponavljaju: To smanjuje poteškoće u sintezi gena.

Podešavanje sekundarne strukture mRNA: Kako bi se izbjegle ukosnice koje utječu na prijevod.

Uklanjanje mjesta rezanja restrikcijskih enzima: Za zaštitu integriteta gena.

Preferencija kodona: Optimiziranje gena donora prema domaćinu kako bi se maksimizirala ekspresija proteina.

Yaohaieva podrška

Za dizajn i sintezu gena, puka ekspresija proteina i optimizacija kodona nisu dovoljni. Različite metode i programi mogu dizajnirati i proizvesti različite sekvence mRNA optimizirane za kodon. Na temelju gore navedenih čimbenika optimizacije, u kombinaciji sa svojom službenom bazom podataka i sažimanjem godina iskustva u sintezi gena, Yaohai Bio-Pharma je razvila svoju jedinstvenu bazu podataka optimizacije kodona. Može vam pružiti besplatnu optimizaciju kodona i dizajn sheme sinteze gena kako biste maksimalno povećali optimizaciju kodona sekvence vašeg gena.

Yaohai Bio-Pharma uspostavila je kompletan skup tehnologija sinteze linearne mRNA i cirkularne mRNA za pružanje visokokvalitetne RNA, kao što je dizajn sekvence i optimizacija, sinteza gena, IVT, cirkularizacija, pročišćavanje RNA i inkapsulacija LNP-a.

Također aktivno tražimo institucionalne ili pojedinačne globalne partnere. Nudimo najkonkurentnije naknade u industriji. Ukoliko imate pitanja, slobodno nas kontaktirajte: [email protected]

Za više detalja o tvrtki Yaohai Bio-Pharma, molimo pogledajte našu web stranicu: www.yaohaibio-pharma.com