Strategije optimizacije kodona

Postoji 64 genetska kodona, od kojih 60 kodiraju 20 aminokiselina. Svaki organizam koji se koristi za izraz ili proizvodnju proteina (uključujući Escherichia coli, kvasce, sisavčeve stanice, Pichia, biljne stanice i kukcih stanica) pokazuje određeni stupanj razlike ili preferencije u upotrebi kodona. Kodoni koji se najčešće koriste u domaćinu nazivaju se optimalnim kodonima, dok su oni koji se rijetko koriste nazivani redkim ili kodonima s niskom uporabom.

Optimizacija kodona

Optimizacija kodona uključuje modificiranje nizke gene tako da se koriste preferirani kodoni i izbjegavaju kodoni s niskom uporabom ili redki kodoni, a zatim se dobiva modifikovani gene putem sintize gene. Ovaj preuređivanje gena naziva se optimizacija kodona.

Optimizirana nizka gene može poboljšati stabilnost sekundarne strukture mRNA, sprečavajući zakasnjenja prijevođenja, prematureno završetak prijevođenja, promjenu okvira prijevođenja i nepravilnosti u aminokiselinskom sastavu zbog nedostatka tRNA bazena.

Optimizacija je važna jer omogućuje učinkovit tijek procesa poput sinteze gena, konstrukcije vektora, transkripcije i translacije.

Faktori optimizacije

Ravnoteženje GC sadržaja: To utječe na stabilnost vezivanja, temperaturu spajanja i iznos proteina.

Smanjivanje ponavljajućih nizova: To smanjuje težinu sinteze gena.

Prilagođavanje sekundarne strukture mRNA: Da se izbjegnu češljevi koji utječu na translaciju.

Uklanjanje mjesta za rezanje restrikcijskim enzimima : Zaštiti cjelovitost gene.

Prednost kodona: Optimiziranje davačkog gene prema domaćinu kako bi se maksimizirao izraz proteina.

Podrška Yaohai

Za dizajn i sintezu gene, samo izraz proteina i optimizacija kodona nije dovoljan. Različiti metodi i programa mogu dizajnirati i proizvoditi različite optimizirane mRNA nizove s obzirom na kodone. Na osnovi gornjih faktora optimizacije, kombinirano sa njihovom službenom bazom podataka, te sažetkom godina iskustva u sintezi gena, Yaohai Bio-Pharma je razvila svoju jedinstvenu bazu podataka za optimizaciju kodona. Može vam pružiti besplatan servis za optimizaciju kodona i dizajn sheme za sintezu gene kako bi se maksimizirala optimizacija kodona vašeg genetskog niza.

Yaohai Bio-Pharma je uspostavila kompletni skup tehnologija za sintezu linearnog i cirkularnog mRNA-a kako bi pružila visokokvalitetnu RNA, kao što su dizajn i optimizacija nizova, sinteza gene, IVT, cirkularizacija, čišćenje RNA-a i LNP enkapsulacija.

Također aktivno tražimo globalne partnerе iz institucija ili pojedince. Ponuditi ćemo najbolju kompenzaciju u industriji. Ako imate bilo kakva pitanja, slobodno nas kontaktirajte: [email protected]

Za više detalja o Yaohai Bio-Pharma, pogledajte našu web stranicu: www.yaohaibio-pharma.com