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Diseño de secuencia de ARNm

Diseño de secuencia de ARNm

Según el dogma central, el ARN mensajero (ARNm) es el puente para la transmisión del material genético del ADN a las proteínas.

El ARNm desempeña un papel biológico al codificar proteínas in vivo, y el ARNm maduro en organismos eucariotas consta de cinco componentes: 5' Cap (estructura de la tapa), 5' UTR (región no codificante), ORF (marco de lectura abierto), 3ʹ UTR y cola poliA 3' (cola de poliadenilato).

indefinido

Detalles de servicios
ProcesosServicio opcionalDetalle de ServiciosPeriodo de Entrega (Día)
Diseño y optimización de secuencias de ARNm.Diseño y optimización de secuencias de codificación.

Alineación de secuencia CDS

Optimización de codones CDS

1
Diseño y optimización de secuencias no codificantes.

Diseño y optimización de secuencia 5 'UTR.

Diseño y optimización de secuencia 3 'UTR.

Diseño y optimización de secuencias poliA.

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Opciones personalizables
5' UTR/3' UTR
  • Secuencia UTR de la naturaleza
  • Secuencia UTR mutante/diseñada
Cola PolyA de 3'
  • Cola de 100 A ~ 120 A (recomendado)
  • Cola poliA segmentada
  • Otra cola personalizada
Estrategias comunes para el diseño de secuencias de ARNm
Componentes de ARNmFunciones biológicasEstrategias de optimización
Tapa de 5'Protege el ARNm de la degradación por exonucleasas y actúa en conjunto con la cola poliA en el extremo 3', la proteína de unión a poliA y la proteína del factor de iniciación de la traducción para iniciar la traducción de proteínas.La estructura natural de Cap1 evita los receptores de reconocimiento de patrones y, por lo tanto, reduce la respuesta inmune natural, que se puede lograr mediante una limitación cotranscripcional de un paso o una limitación enzimática de dos pasos [consulte la limitación enzimática de ARNm y la limitación cotranscripcional para obtener más detalles].
UTR de 5'La 5'UTR puede ser reconocida por los ribosomas, regular la traducción del ARNm y afectar la estabilidad del ARNm.Contienen secuencias Kozak sin una estructura secundaria muy estable. Se prefieren las UTR naturales de genes altamente expresados ​​para los ARNm de transcripción in vitro (IVT), como la α-globina y la β-globina.
CDSRegiones codificantes de proteínas y secuencias codificantes de antígenos, anticuerpos u otras proteínas funcionales.La optimización de codones aumenta el nivel de traducción, y se observa que ciertos codones no óptimos pueden desempeñar un papel en el plegamiento de proteínas.
UTR de 3'Regular la traducción y la estabilidad del ARNm.Se prefieren las UTR naturales de genes altamente expresados ​​para los ARNm de IVT como la α-globina y la β-globina.
Cola poliA de 3'Regula la expresión de proteínas y protege la estructura de la capa de la degradación.Se requiere una longitud adecuada (100-150 pb); codificar la cola poliA en el plásmido plantilla de transcripción garantiza una longitud de la cola poliA más definida.
Nuestras Características
  • Selección de fuentes UTR diversificadas

Múltiples fuentes de bibliotecas UTR naturales y modificadas altamente expresadas; estrategia madura de modificación de UTR;

  • Equipo de optimización de CDS de vanguardia

Coopere con un equipo profesional de algoritmos de IA para completar la optimización de codones.

  • Distribución uniforme de la cola poliA

Agregue secuencias poliA según las plantillas de ADN para controlar la longitud del ARNm con mayor precisión.

  • Combinaciones de optimización diversificadas

Lograr una expresión eficiente de ARNm con baja inmunogenicidad.

Estudio de caso

Diseño de secuencia de un ARNm de doble indicador: ARNm de mCherry-eGFP

El servicio de ARNm de Yaohai Bio-Pharma continúa actualizándose con el diseño y optimización de una secuencia en tándem de genes informadores dobles, que logra la coexpresión de genes duales.

Usando un reactivo de transfección convencional, la secuencia en tándem de doble gen mRNA mCherry-eGFP se transfecta en células 293T, y dos señales fluorescentes de mCherry (rojo) y proteína fluorescente verde mejorada (eGFP) se detectan con expresión simultánea después de 48 horas, y las señales apiladas El gráfico está resaltado en amarillo.

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Expresión de ARNm de mCherry-eGFP en células 293T

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