Pokud jde o hromadnou výrobu mRNA, transkripce in vitro (IVT) je efektivnější a dospělejší metoda. Reakce IVT používá linearizovanou plazmidovou DNA obsahující T7 promotor jako šablonu a mRNA je syntetizována s nukleotidtrifosfáty (NTPs) jako substráty v přítomnosti polymerázy T7 RNA.
Modifikace nukleotidů je průlomem v průzkumu mRNA, kde nezamodifikované mRNA molekuly jsou rozpoznány intracelulárními senzory RNA, které aktivují vrozenou imunitu. Z důvodu imunogenity mRNA in vivo a účinnosti překladu se v procesu IVT obvykle používají určité druhy modifikovaných NTPs a běžné modifikované nukleotidy jsou pseudouridine (Ψ), N1-methyl-pseudouridine (N1Ψ) a 5-methylcytosine (5mC).
Schéma reakce transkripce in vitro (IVT)
Volitelná služba |
Detaily služby |
Doba dodání (pracovní den) |
Transkripcese v vitro (IVT) |
IVT, In vitro transkripcí | 1 |
Modifikace nukleotidů (Ψ/N1Ψ/5mC atd.) | ||
Odstranění DNA šablony (DNase I) | ||
Optimalizace podmínek IVT - volitelné |
Návrh a optimalizace složek reakce IVT | 2-5 |
Zlepšení stability mRNA a expresivity bílkovin in vivo.
příprava fragmentů mRNA až 10kb je možná.
Díky optimalizaci podmínek reakce IVT je rychlost transkripcí až 1:200.
Přísná kontrola RNase prostřednictvím experimentálního prostředí a spotřebičů může účinně zabránit degradaci mRNA.
Současný systém reakce IVT je přibližně optimalizován pro syntetické systémy s délkou asi 100 nt, nikoli pro mRNA libovolné délky. Čím delší je sekvence mRNA, tím obtížnější je její transkripce a tím více je náchylná k degradaci.
Aby bylo možné připravit přizpůsobené mRNA sekvence s délkou asi 10 kb, společnost Yaohai Bio-Pharma úspěšně připravila vysokokvalitní vzorky s vysokým poměrem transkripce 1:135 a získala 135 μg počátečně očištěných mRNA produktů po in vitro transkripci 1 μg linearizovaného plasmidu díky pečlivému experimentálnímu návrhu, nepřetržité optimalizaci podmínek reakce a přísné kontrole RNase.
identifikace mRNA (elektroforeze na agaróse)