استراتژی‌های بهینه‌سازی کدون

تعداد 64 کدون ژنتیک وجود دارد، که از آن‌ها 60 به 20 اسید آمینه کد می‌زنند. هر سازگاری زیستی که برای بیان یا تولید پروتئین استفاده می‌شود (از جمله اشخیریشیا کلی، قارچ‌ها، سلول‌های فقاردار، پیشیا، سلول‌های گیاهی و سلول‌های حشرات) در استفاده از کدون‌ها به اندازه‌ای اختلاف یا ترجیح نشان می‌دهد. کدون‌هایی که بیشترین استفاده را در یک میزبان دارند، کدون‌های بهینه نامیده می‌شوند، در حالی که کدون‌های کم‌استفاده یا کم‌ترقیب نامیده می‌شوند.

بهینه‌سازی کدون

بهینه‌سازی کدون شامل تغییر در دنباله یک ژن با استفاده از کدون‌های مورد ترجیح و اجتناب از کدون‌های کم‌ترقیب یا کم‌استفاده است و سپس ژن تغییر‌یافته را از طریق سنتز ژن به دست می‌آورند. این طراحی مجدد ژن‌ها به بهینه‌سازی کدون معروف است.

یک دنباله ژن بهینه‌سازی‌شده می‌تواند پایداری ساختار ثانویه mRNA را افزایش دهد و از تاخیر در ترجمه، پایان زودرس ترجمه، شیفت فریم ترجمه و ناسازگاری اسید آمینه ناشی از عدم کافی بودن گروه tRNA جلوگیری کند.

بهینه‌سازی اهمیت دارد زیرا به پیشرفت کارآمد فرآیندهایی مانند سنتز ژن، ساخت وکتور، نوشتاری و ترجمه کمک می‌کند.

عوامل بهینه‌سازی

تعادل دادن محتوای GC: این موضوع بر پایداری بندش، دماهای آنالینگ و عملکرد پروتئین تأثیر می‌گذارد.

کاهش دنباله‌های تکراری: این موضوع دشواری‌های سنتز ژن را کاهش می‌دهد.

تنظیم ساختار ثانویه mRNA: برای جلوگیری از ساختارهای موشکی که بر ترجمه تأثیر می‌گذارند.

حذف نقاط برش انزیم محدودکننده : برای حفظ بیانداز ژن

ترجیح کدون: بهینه‌سازی ژن مانده به حسب میزبان برای حداکثر کردن بیان پروتئین.

پشتیبانی یائوهای

برای طراحی و سنتز ژن، تنها بیان پروتئین و بهینه‌سازی کدون کافی نیست. روش‌ها و برنامه‌های مختلف می‌توانند توالی‌های mRNA با کدون بهینه‌شده طراحی و تولید کنند. بر اساس عوامل بهینه‌سازی فوق، همراه با پایگاه داده رسمی خود و با خلاصه کردن سال‌ها تجربه در سنتز ژن، شرکت یائوهای بیو-فارما پایگاه داده بهینه‌سازی کدون منحصر به فرد خود را توسعه داده است. این پایگاه می‌تواند طرح طراحی سنتز ژن و بهینه‌سازی کدون رایگان برای شما ارائه دهد تا حداکثر بهینه‌سازی توالی ژن شما را تضمین کند.

شرکت یائوهای بیو-فارما فناوری کاملی برای سنتز mRNA خطی و دایره‌ای ایجاد کرده است تا RNA با کیفیت بالا را ارائه دهد، شامل طراحی و بهینه‌سازی توالی، سنتز ژن، IVT، دایره‌ای‌سازی، تصفیه RNA و بسته‌بندی LNP.

ما همچنین به طور فعال در دنبال شرکای جهانی موسساتی یا افراد انفرادی هستیم. ما کمترین پاداش رقابتی را در صنعت ارائه می‌دهیم. اگر سوالی دارید، لطفاً حتماً با ما تماس بگیرید: [email protected]

برای جزئیات بیشتر درباره Yaohai Bio-Pharma، لطفاً به وبسایت ما مراجعه کنید: www.yaohaibio-pharma.com