استراتژی های بهینه سازی کدون

64 کدون ژنتیکی وجود دارد که 60 کدون 20 اسید آمینه را رمزگذاری می کنند. هر موجود زنده ای که برای بیان یا تولید پروتئین استفاده می شود (از جمله اشریشیا کلی، مخمر، سلول های پستانداران، پیچیا، سلول های گیاهی و سلول های حشرات) درجاتی از تفاوت یا ترجیح در استفاده از کدون را نشان می دهد. کدون هایی که بیشتر در یک میزبان مورد استفاده قرار می گیرند، کدون های بهینه نامیده می شوند، در حالی که آن هایی که اغلب استفاده نمی شوند، کدون های کمیاب یا کم مصرف نامیده می شوند.

بهینه سازی کدون

بهینه‌سازی کدون شامل اصلاح یک توالی ژن با استفاده از کدون‌های ترجیحی و اجتناب از کدون‌های کم مصرف یا کمیاب و سپس به‌دست آوردن ژن اصلاح‌شده از طریق سنتز ژن است. به این طراحی مجدد ژن ها بهینه سازی کدون گفته می شود.

یک توالی ژنی بهینه می‌تواند پایداری ساختار ثانویه mRNA را افزایش دهد، از تأخیر ترجمه، پایان زودرس ترجمه، تغییر چارچوب ترجمه و عدم تطابق اسیدهای آمینه به دلیل وجود مخزن‌های ناکافی tRNA جلوگیری کند.

بهینه‌سازی بسیار مهم است زیرا پیشرفت کارآمد فرآیندهایی مانند سنتز ژن، ساخت وکتور، رونویسی و ترجمه را تسهیل می‌کند.

عوامل بهینه سازی

متعادل کردن محتوای GC: این بر ثبات اتصال، دمای بازپخت و عملکرد پروتئین تأثیر می گذارد.

کاهش توالی های تکراری: این امر دشواری سنتز ژن را کاهش می دهد.

تنظیم ساختار ثانویه mRNA: برای جلوگیری از ساختارهای سنجاق سر که بر ترجمه تأثیر می گذارد.

از بین بردن محل های برش آنزیم محدود: برای محافظت از یکپارچگی ژن.

ترجیح کدون: بهینه سازی ژن اهداکننده با توجه به میزبان برای به حداکثر رساندن بیان پروتئین.

حمایت یائوهای

برای طراحی و سنتز ژن، بیان پروتئین صرف و بهینه سازی کدون کافی نیست. روش‌ها و برنامه‌های مختلف می‌توانند توالی‌های mRNA بهینه‌شده با کدون را طراحی و تولید کنند. Yaohai Bio-Pharma بر اساس عوامل بهینه سازی فوق، همراه با پایگاه داده رسمی خود، و خلاصه سال ها تجربه سنتز ژن، پایگاه داده بهینه سازی کدون منحصر به فرد خود را توسعه داده است. این می تواند بهینه سازی کدون رایگان و طراحی طرح سنتز ژن را برای به حداکثر رساندن بهینه سازی کدون توالی ژن شما ارائه دهد.

Yaohai Bio-Pharma مجموعه کاملی از فن‌آوری‌های سنتز mRNA خطی و mRNA دایره‌ای را برای ارائه RNA با کیفیت بالا، مانند طراحی و بهینه‌سازی توالی، سنتز ژن، IVT، دایره‌سازی، خالص‌سازی RNA و کپسوله‌سازی LNP ایجاد کرده است.

ما همچنین به طور فعال به دنبال شرکای جهانی نهادی یا فردی هستیم. ما رقابتی ترین پاداش را در صنعت ارائه می دهیم. اگر سوالی دارید، لطفا با ما تماس بگیرید: [email protected]

برای اطلاعات بیشتر در مورد Yaohai Bio-Pharma، لطفاً به وب سایت ما مراجعه کنید: www.yaohaibio-pharma.com