Koodoni optimeerimise strateegiad

Seal on 64 geneetilist koodonit, millest 60 kodeerivad 20 aminohapet. Iga valgu ekspressiooniks või tootmiseks kasutatav organism (sealhulgas Escherichia coli, pärm, imetajarakud, Pichia, taimerakud ja putukarakud) omab koodonikasutuses teatud erinevusi või eelistusi. Peremeesorganismis kõige sagedamini kasutatavaid koodoneid nimetatakse optimaalseteks koodoniteks, kuid harva kasutatavaid koodoneid nimetatakse haruldasteks või vähekasutavateks koodoniteks.

Koodoni optimeerimine

Koodoni optimeerimine hõlmab geenijärjestuse muutmist, kasutades eelistatud koodoneid ja vältides vähekasutatud või haruldasi koodoneid, ning seejärel modifitseeritud geeni saamist geenisünteesi teel. Seda geenide ümberkujundamist nimetatakse koodoni optimeerimiseks.

Optimeeritud geenijärjestus võib suurendada mRNA sekundaarstruktuuri stabiilsust, vältides translatsiooni viivitusi, enneaegset translatsiooni lõpetamist, translatsiooni raami nihet ja ebapiisavate tRNA kogumite tõttu aminohapete mittevastavust.

Optimeerimine on oluline, kuna see hõlbustab selliste protsesside nagu geenisüntees, vektori konstrueerimine, transkriptsioon ja translatsioon tõhusat kulgemist.

Optimeerimistegurid

GC sisu tasakaalustamine: See mõjutab seondumise stabiilsust, anniilimistemperatuuri ja valgu saagist.

Korduvate jadade vähendamine: See vähendab geenisünteesi raskusi.

mRNA sekundaarse struktuuri reguleerimine: Vältimaks tõlkimist mõjutavaid juuksenõelastruktuure.

Restriktsiooniensüümi lõikekohtade kõrvaldamine: geeni terviklikkuse kaitsmiseks.

Koodoni eelistus: Doonorgeeni optimeerimine vastavalt peremeesorganismile, et maksimeerida valgu ekspressiooni.

Yaohai toetus

Geeni kujundamiseks ja sünteesiks ei piisa pelgalt valgu ekspressioonist ja koodoni optimeerimisest. Erinevad meetodid ja programmid võivad kavandada ja toota erinevaid koodonile optimeeritud mRNA järjestusi. Tuginedes ülaltoodud optimeerimisteguritele, kombineerituna ametliku andmebaasiga ja võttes kokku aastatepikkuse geenisünteesi kogemuse, on Yaohai Bio-Pharma välja töötanud ainulaadse koodonite optimeerimise andmebaasi. See võib pakkuda teile tasuta koodonite optimeerimist ja geenisünteesi skeemi disaini, et maksimeerida teie geenijärjestuse koodonite optimeerimist.

Yaohai Bio-Pharma on loonud täieliku lineaarse mRNA ja tsirkulaarse mRNA sünteesi tehnoloogiate komplekti, et pakkuda kvaliteetset RNA-d, nagu järjestuste kujundamine ja optimeerimine, geenide süntees, IVT, tsirkulariseerimine, RNA puhastamine ja LNP kapseldamine.

Otsime aktiivselt ka institutsionaalseid või individuaalseid globaalseid partnereid. Pakume valdkonna kõige konkurentsivõimelisemat tasu. Kui teil on küsimusi, võtke meiega julgelt ühendust: [email protected]

Yaohai Bio-Pharma kohta lisateabe saamiseks vaadake palun meie veebisaiti: www.yaohaibio-pharma.com