Koodooni optimeerimise strateegiad

On olemas 64 geneetilist koodonit, millest 60 kodeerib 20 aminohapetiks. Igaorganism, mida kasutatakse proteiini väljendamiseks või tootmiseks ( sealhulgas Escherichia coli, kümned, loomlikud rakud, Pichia, taimirakud ja kuningikaraked) näitab kodonite kasutamisel mingit erinevust või eelistust. Kodoneid, mis on kõige sagedamini kasutatud hostis, nimetatakse optimaalseteks kodoniteks, samas kui harva kasutatud kodoneid nimetatakse harva või madala kasutusega kodoniteks.

Kodonite optimeerimine

Kodonite optimeerimine hõlmab gene sekvensi muutmist eelistatud kodonite kasutamise abil ning madala kasutusega või harva esinevate kodonite vältimist ning seejärel saadetakse modifitseeritud gene gene sünteesiga. Seda gene ümberprojekteerimist nimetatakse kodonite optimeerimiseks.

Optimeeritud gene sekvens võib suurendada mRNA sekundaarstruktuuri stabiilsust, vältides tõlgemise viivitust, varajast tõlgemise lõppu, tõlgemise raamide nihkedest ja aminohapete mittesobivatest vastavustest puuduvate tRNA poolide tõttu.

Optimiseerimine on oluline, kuna see võimaldab protsesside, nagu geenisüntees, vektori loomine, transkriptsioon ja tõlkmine, tõhusalt edeneda.

Optimiseerimise tegurid

GC-sisalduse tasakaalustamine: See mõjutab sidumise stabiilsust, annealing temperatuuri ja proteiini tootlust.

Korduvate jadade vähendamine: See vähendab geenisünteesi raskusi.

MRNA sekundaarstruktuuri kohandamine: Et vältida haardepõlevaid struktuure, mis mõjutavad tõlkinemist.

Piirangute enzyme lõikamispunktide eemaldamine : Et säilitada gene integriteet.

Koodoni eelistus: Vabandatud geeni optimeerimine vastavalt kandjale, et maksimeerida proteiini ekspressiooni.

Yaohai toetus

Geeni disaini ja sünteesi puhul ei ole piisav ainult proteiini ekspressioon ja koodoni optimeerimine. Erinevad meetodid ja programmid võivad disainida ja toota erinevaid koodonoptimeeritud mRNA jadasid. Ülaltoodud optimeerimisfaktorite alusel, koos ametliku andmebaasiga ja aastate jooksul kasutatud geenisünteesi kogemuse kokkuvõtmisega, on Yaohai Bio-Pharma arendanud oma unikaalse koodoni optimeerimise andmebaasi. See võib pakkuda teile tasuta koodoni optimeerimist ja geenisünteesi plaani disainimist, et maksimeerida teie geenijada koodoni optimeerimist.

Yaohai Bio-Pharma on loonud täieliku lineaarse ja ringse mRNA sünteesitehnoloogia, et pakuda kvaliteetset RNA, sealhulgas jada disainimine ja optimeerimine, geenisüntees, IVT, ringlustamine, RNA puhasustamine ja LNP enkapsuleerimine.

Oleme samuti aktiivselt otsimas institutsioonilisi või isiklike globaalseid partnereid. Pakume tööstuses kõige konkurentsivõimsamat kompensatsiooni. Kui teil on mingeid küsimusi, palun ei esitage kontaktimist: [email protected]

Rohkem detaili Yaohai Bio-Pharma kohta leiate meie veebisaidilt: www.yaohaibio-pharma.com