Yaohai Bio-Pharma valmistaa sircRNA:ta, joka perustuu PIE-järjestelmään (eksonien ja intronien kohdistus), joka perustuu tyypin I intronien itsesilmukointitoimintoon RNA:n syklisoinnin saavuttamiseksi. PIE-rakenne on suunniteltu käyttämällä T4 td -geeniä tai fishy tRNA -prekursorigeeniä, ja järjestely on seuraava:
RNA:n intronin ja sitä tukevan eksonin fragmentti on jaettu kahteen osaan (5'-pääte ja 3'-pääte), joissa 5'-pään sekvenssi siirretään kohdesekvenssin häntään, 3'-pään sekvenssi insertoidaan sekvenssin etuosaan. kohdesekvenssi ja kohdegeenisekvenssi insertoidaan keskelle.
GTP:n katalyysin alaisena PIE-rakenne johtaa muiden sekvenssien kuin intronien syklisoitumiseen. Yhdistettynä kohtuulliseen syklisointinopeuden tehostamisstrategiaan Yaohai Bio-Pharma voi saavuttaa jopa 4 kb:n sekvenssien syklisoinnin yli 80 %:n syklisaationopeudella.
Kuva 1. PIE-järjestelmään perustuva sircRNA:n in vitro -kierto
Palvelujen tiedot
| Käsitellä asiaa |
Valinnainen palvelu |
Palvelun yksityiskohdat |
Toimitusaika (työpäivä) |
| circRNA-sekvenssin suunnittelu ja optimointi |
Koodaussekvenssien suunnittelu ja optimointi |
CDS-sekvenssin kohdistus
CDS-kodonin optimointi
|
1 |
| Ei-koodaavien sekvenssien suunnittelu ja optimointi |
Introni- ja eksonisekvenssien suunnittelu ja optimointi
Homologisen varren sekvenssin suunnittelu ja optimointi
Välikappalesarjan suunnittelu ja optimointi
|
1-2 |
Yhteiset strategiat mRNA-sekvenssisuunnittelulle
| CircRNA-komponentit |
Biologiset toiminnot |
Optimointistrategiat |
| Kaksiterminaaliset introni- ja eksonisekvenssit |
GTP-katalysoima intronin itsesilmukointi intronin ulkopuolella olevien sekvenssien syklisointiin. |
Suunniteltu T4 td -geenin tai kalaöljyn tRNA-prekursorigeenin mukaan. |
| Koodaus |
IRES |
Sisäinen ribosomin tunnistuskohta, joka säätelee sircRNA:n translaatiota. |
Eri viruslähteistä, esim. EMCV-, CVB3-lähteistä, peräisin olevien sisäisten ribosomien sisääntulokohtien (IRES) sekvenssien seulonta. |
| CDS |
Proteiinia koodaavat alueet, sekvenssit, jotka koodaavat antigeenejä, vasta-aineita tai muita toiminnallisia proteiineja. |
Kodonin optimointi lisää translaation tasoa; tietyillä ei-optimaalisilla kodoneilla voi olla rooli proteiinin laskostumisessa. |
| Koodaamaton |
Ei-koodaavat sekvenssit |
Kohdista miRNA:t tai proteiinit geenin tai proteiinin säätelyyn. |
MiRNA:iden tai proteiinien spesifisten sitoutumiskohtien kohdistaminen voi toistaa sitoutumiskohdan sekvenssit. |
Ominaisuuksemme
- Optimoitu PIE-syklisointijärjestelmä Yhdistelmä kohtuullisilla optimointistrategioilla yli 80 %:n syklisointiasteen saavuttamiseksi;
- Huippuluokan CDS-optimointitiimi Yhteistyö ammattimaisen AI-algoritmiryhmän kanssa CDS-alueen kodonien optimoinnin loppuunsaattamiseksi;
- Mature and Perfect Process circRNA voidaan saavuttaa korkealla syklisointitehokkuudella, korkealla stabiilisuudella ja korkealla translaatiotehokkuudella.
Tapaustutkimus
Yaohai Bio-Pharma toi markkinoille kontrollituotteen, tehostetun vihreän fluoresoivan proteiinin (eGFP) sircRNA:n, joka perustuu PIE-järjestelmään RNA:n syklisoinnin saavuttamiseksi.
Perinteisellä transfektioreagenssilla eGFP sircRNA transfektoidaan 293T-soluihin ja eGFP (vihreä) fluoresoiva signaali voidaan havaita 24 tunnin kuluttua, mikä vahvistuu 48 tunnin kuluttua. Fluoresoiva signaali voidaan havaita vielä 7. päivänä ja 14. päivänä sen jälkeen. transfektio.
eGFP-circRNA:n in vitro -ekspression validointi
FI
EN
AR
HR
CS
DA
NL
FR
DE
EL
IT
JA
KO
EI
PL
PT
RO
RU
ES
SV
IW
ID
LV
LT
SR
SK
SL
UK
VI
ET
HU
TH
TR
FA
AF
MS
BE
MK
UR
BN
