Keskeisen dogman mukaan lähetti-RNA (mRNA) on silta geneettisen materiaalin siirtymiselle DNA:sta proteiineihin.
mRNA:lla on biologinen rooli koodaamalla proteiineja in vivo, ja kypsä mRNA eukaryoottisissa organismeissa koostuu viidestä komponentista: 5' Cap (cap-rakenne), 5' UTR (ei-koodaava alue), ORF (avoin lukukehys), 3ʹ UTR. ja 3' polyA-häntä (polyadenylaattihäntä).
Käsitellä asiaa | Valinnainen palvelu | Palvelun yksityiskohdat | Toimitusaika (päivä) |
mRNA-sekvenssin suunnittelu ja optimointi | Koodaussekvenssien suunnittelu ja optimointi | CDS-sekvenssin kohdistus CDS-kodonin optimointi | 1 |
Ei-koodaavien sekvenssien suunnittelu ja optimointi | 5' UTR-sekvenssin suunnittelu ja optimointi 3' UTR-sekvenssin suunnittelu ja optimointi polyA-sekvenssin suunnittelu ja optimointi | 1-2 |
5' UTR/3' UTR |
|
3' PolyA Tail |
|
mRNA-komponentit | Biologiset toiminnot | Optimointistrategiat |
5' Cap | Suojaa mRNA:ta eksonukleaasien aiheuttamalta hajoamiselta ja toimi yhdessä polyA-hännän 3'-päässä, polyA:ta sitovan proteiinin ja translaation aloitustekijäproteiinin kanssa proteiinin translaation aloittamiseksi. | Luonnollinen Cap1-rakenne välttää muodontunnistusreseptoreita ja vähentää siten luonnollista immuunivastetta, joka voidaan saavuttaa yksivaiheisella transkriptionaalisella rajoituksella tai kaksivaiheisella entsymaattisella rajoituksella [katso mRNA:n entsymaattinen rajoitus ja yhteistranskription kappaus]. |
5' UTR | Ribosomit voivat tunnistaa 5' UTR:n, säädellä mRNA:n translaatiota ja vaikuttaa mRNA:n stabiilisuuteen. | Sisältää Kozak-sekvenssejä ilman erittäin vakaata toissijaista rakennetta. Voimakkaasti ilmentyneiden geenien luonnolliset UTR:t ovat edullisia in vitro -transkription (IVT) mRNA:ille, kuten a-globiinille ja p-globiinille. |
CDS | Proteiinia koodaavat alueet ja koodaavat sekvenssit antigeeneille, vasta-aineille tai muille toiminnallisille proteiineille. | Kodonin optimointi lisää translaation tasoa, mikä huomauttaa, että tietyillä ei-optimaalisilla kodoneilla voi olla rooli proteiinin laskostumisessa. |
3' UTR | Säädä mRNA:n translaatiota ja stabiilisuutta. | Korkeasti ilmentyneiden geenien luonnolliset UTR:t ovat edullisia IVT-mRNA:ille, kuten a-globiinille ja p-globiinille. |
3' polyA häntä | Säätele proteiinin ilmentymistä ja suojaa korkin rakennetta hajoamiselta. | Riittävä pituus (100-150 bp) vaaditaan; polyA-häntä koodaava transkriptiotemplaattiplasmidissa varmistaa tarkemmin määritellyn polyA-hännän pituuden. |
Useita erittäin ilmentyneiden luonnollisten ja modifioitujen UTR-kirjastojen lähteitä; kypsä UTR-muokkausstrategia;
Tee yhteistyötä ammattimaisen AI-algoritmitiimin kanssa kodonien optimoinnin loppuunsaattamiseksi.
Lisää polyA-sekvenssejä DNA-templaattien mukaisesti kontrolloidaksesi tarkemmin mRNA:n pituutta.
Saavuta mRNA:n tehokas ekspressio alhaisella immunogeenisyydellä.
Kaksoisreportteri-mRNA:n sekvenssisuunnittelu: mCherry-eGFP mRNA
Yaohai Bio-Pharman mRNA-palvelua kehitetään edelleen suunnittelemalla ja optimoimalla kaksoisreportterigeenin tandemsekvenssi, joka mahdollistaa kaksoisgeenien yhteisilmentymisen.
Käyttämällä tavanomaista transfektioreagenssia kaksoisgeenin tandemsekvenssi mCherry-eGFP mRNA transfektoidaan 293T-soluihin, ja kaksi fluoresoivaa signaalia mCherrystä (punainen) ja tehostetun vihreän fluoresoivan proteiinin (eGFP) havaitaan samanaikaisesti ilmentymisen kanssa 48 tunnin kuluttua, ja pinottu. kaavio on korostettu keltaisella.
mCherry-eGFP mRNA:n ilmentyminen 293T-solussa