Mitä tulee mRNA:n massatuotantoon, in vitro -transkriptio (IVT) on tehokkaampi ja kypsempi menetelmä. IVT-reaktiossa käytetään linearisoitua plasmidi-DNA:ta, joka sisältää T7-promoottorin templaattina, ja mRNA syntetisoidaan substraateina nukleosiditrifosfaatilla (NTP:t) T7-RNA-polymeraasin läsnä ollessa.
Nukleotidimuunnos on läpimurto mRNA:n tutkimisessa, jossa solunsisäiset RNA-anturit tunnistavat modifioimattomat mRNA-molekyylit aktivoimaan synnynnäistä immuniteettia. MRNA:n in vivo -immunogeenisyyden ja translaation tehokkuuden kannalta IVT-prosessissa käytetään yleensä tietyn tyyppisiä modifioituja NTP:itä, ja yleisiä modifioituja nukleotideja ovat pseudouridiini (Ψ), N1-metyylipseudouridiini (N1Ψ) ja 5-metyylisytosiini (5 mC).
In vitro -transkription (IVT) reaktiokaavio
Valinnainen palvelu | Palvelun yksityiskohdat | Toimitusaika (työpäivä) |
In vitro -transkriptio (IVT) | IVT, In vitro -transkriptio | 1 |
Nukleotidimuunnokset (Ψ/N1Ψ/5mC jne.) | ||
DNA-templaatin poisto (DNaasi I) | ||
IVT-kunnon optimointi - valinnainen | IVT:n reaktiokomponenttien suunnittelu ja optimointi | 2-5 |
Paranna mRNA:n stabiilisuutta ja proteiinien ilmentymistä in vivo.
mRNA-fragmentin valmistus voidaan saavuttaa jopa 10 kb.
Optimoimalla IVT-reaktio-olosuhteet transkriptionopeus on jopa 1:200.
RNaasin tiukka kontrollointi kokeellisen ympäristön ja kulutustarvikkeiden avulla voi tehokkaasti estää mRNA:n hajoamisen.
Nykyinen IVT-reaktiojärjestelmä on karkeasti optimoitu synteettisille systeemeille, joiden pituus on noin 100 nt, ei mielivaltaisen pituisille mRNA:ille. Mitä pidempi mRNA-sekvenssi, sitä vaikeampi transkriptio on ja sitä alttiimpi se on hajoamaan.
Valmistaakseen räätälöityjä noin 10 kb:n pituisia mRNA-sekvenssejä Yaohai Bio-Pharma on onnistuneesti valmistanut korkealaatuisia näytteitä korkealla transkriptiosuhteella 1:135 ja saanut 135 μg alun perin puhdistettuja mRNA-tuotteita 1 μg:n linearisoitua plasmidia jälkeen. transkriptoitiin in vitro tiukan kokeellisen suunnittelun, reaktio-olosuhteiden jatkuvan optimoinnin ja RNaasin tiukan valvonnan avulla.
mRNA:n tunnistaminen (agaroosigeelielektroforeesi)