Merkezi dogma'ya göre, messenger RNA (mRNA) genetik malzemenin DNA'dan proteinlere aktarımında köprü görevi görür.
mRNA, canlı organizmalar içindeki proteinleri kodlayarak biyolojik bir rol oynar ve eukaryotik organizmalardaki olgun mRNA beş bileşenden oluşur: 5' Kap (kap yapısı), 5' UTR (kodlamayan bölge), ORF (açık okuma çatısı), 3ʹ UTR ve 3' polyA kuyruğu (poliadenylik kuyruğu).
Süreç | İsteğe Bağlı Hizmet | Hizmet Ayrıntıları | Teslimat Süresi (Gün) |
mRNA dizi tasarımı ve optimizasyonu | Kodlayan dizilerin tasarımı ve optimizasyonu |
CDS dizi hizalaması CDS kodon optimizasyonu |
1 |
Kodlamayan dizilerin tasarımı ve optimizasyonu |
5' UTR dizisi tasarımı ve optimizasyonu 3' UTR dizisi tasarımı ve optimizasyonu polyA dizisi tasarımı ve optimizasyonu |
1-2 |
5’ UTR\/3’ UTR |
|
3' PolyA Kuyruğu |
|
mRNA Bileşenleri | Biyo-lojik Fonksiyonlar | Optimize stratejileri |
5’ Kap | MRNA'yı exonükleazlar tarafından bozunmadan korur ve 3' ucu polyA kuyruğu, polyA bağlayıcı protein ve çeviri başlangıç faktörü proteinle birlikte çalışarak protein çevirisini başlatır. | Doğal Cap1 yapısı, şablon tanıma reseptörlerini engeller ve böylece doğal immün yanıtını azaltır, bu da tek adımlı eş zamanlı transkripsiyonlu kaplama veya iki adımlı enzimatik kaplama ile yapılabilir [ayrıntılar için mRNA enzimatik kaplama ve eş zamanlı transkripsiyonlu kaplama bakın]. |
5’ UTR | 5' UTR, ribozomlar tarafından tanınabilir, mRNA'nın çevirisini düzenleyebilir ve mRNA'nın kararlılığını etkileyebilir. | Kozak dizilerini içermekle birlikte, çok kararlı bir ikincil yapıya sahip olmamalıdır. In vitro transkripsiyon (IVT) için mRNA'lar olarak yüksek ifade edilen genlerin doğal UTR'ları tercih edilir, örneğin α-globin ve β-globin. |
CDS | Antijenler, antikorlar veya diğer fonksiyonel proteinler için kodlayan protein-kodlayan bölgeler ve diziler. | Kodon optimizasyonu çeviri seviyesini artırır; belirli non-optimal kodonların protein katlama süreçlerinde rol oynayabileceği unutulmamalıdır. |
3’ UTR | MRNA çevirisini ve istikrarını düzenler. | Yüksek ifade edilen genlerin doğal UTR'ları, örneğin α-globin ve β-globin, IVT mRNA'ları için tercih edilir. |
3’ polyA kuyruğu | Protein ifadesini düzenler ve kap yapısının bozulmasını engeller. | Yeterli uzunluk (100-150 bp) gerekli; transkripsiyon şablonu plazidinde polyA kuyruğunu kodlamak daha belirlilikli bir polyA kuyruk uzunluğu sağlar. |
Yüksek ifade düzeyinde doğal ve değiştirilmiş UTR kütüphane kaynakları; olgun UTR değiştirme stratejisi;
Kodon optimizasyonunu tamamlamak için profesyonel bir yapay zeka algoritma ekibiyle işbirliği yapın.
MRNA uzunluğunu daha hassas şekilde kontrol etmek için DNA şablonlarına göre polyA dizileri ekleyin.
Düşük immünijenlikle mRNA'nin verimli ifadesini sağlayın.
Dual-reporter mRNA'nın Dizi Tasarımı: mCherry-eGFP mRNA
Yaohai Bio-Pharma’nın mRNA hizmeti, çift raporör geni tandem dizisini tasarlamaya ve optimize etmeye devam ederek iki genin eşzamanlı ifadesini gerçekleştiriyor.
Geleneksel bir transfeksiyon reagensini kullanarak, mCherry-eGFP mRNA çift gen tandem dizisi 293T hücrelerine transfeksiyon edilir ve 48 saat sonra mCherry (kırmızı) ve yenilenmiş yeşil fluoresan protein (eGFP)ın iki fluoresan sinyali eş zamanlı ifade ile tespit edilir ve yığın grafiği sarı renk ile vurgulanır.
MCherry-eGFP mRNA'nın 293T hücrede ifadesi