Yaohai Bio-Pharma, PIE sistemi (eksontan ve intron hizalama) üzerine dayalı circRNA hazırlar, bu da birinci tür intronların kendi kendine splicing işlevine bağlı olarak RNA siklizasyonunu gerçekleştirmesini sağlar. PIE yapısı T4 td geni veya balık tRNA öncü geni kullanılarak tasarlanır ve dizilim şu şekildedir:
RNA intronu ve destekleyici eksan parçası iki bölüme ayrılır (5' uç ve 3' uç), burada 5' uç dizisi hedef dizinin kuyruğuna aktarılır, 3' uç dizisi hedef dizinin önüne eklenir ve hedef gen dizisi ortaya yerleştirilir.
GTP'nin kataliti altında, PIE yapısı intronlar dışında olan dizilerin siklizasyonuna neden olur. Uygun bir siklizasyon oranını artırmaya yönelik strateji ile birlikte, Yaohai Bio-Pharma, siklizasyon oranı %80'den fazla olan 4 kb'ye kadar olan dizilerin siklizasyonunu gerçekleştirebilir.
Şekil 1. PIE sistemi temelinde circRNA'nın in vitro döngüsü
Hizmetler Detayları
| Süreç |
İsteğe Bağlı Hizmet |
Hizmet Ayrıntıları |
Teslimat Süresi (iş günü) |
| circRNA sekans tasarımı ve optimizasyonu |
Kodlayan dizilerin tasarımı ve optimizasyonu |
CDS dizi hizalaması
CDS kodon optimizasyonu
|
1 |
| Kodlamayan dizilerin tasarımı ve optimizasyonu |
Intron ve eksontun dizaynı ve optimizasyonu
Homolog kollardaki sekans tasarımı ve optimizasyonu
Boşluk dizisi tasarımı ve optimizasyonu
|
1-2 |
mRNA Dizisi Tasarımı için Ortak Stratejiler
| CircRNA Bileşenleri |
Biyo-lojik Fonksiyonlar |
Optimize stratejileri |
| İki-ucak intron ve eksontan diziler |
GTP-katalize edilen intron kendini splicing'i, intron dışı dizilerin sikliklenmesi için kullanılır. |
T4 td genine veya balık yağı tRNA öncü genine göre tasarlanmıştır. |
| kodlama |
IRES |
CircRNA'nın çevirisini düzenleyen iç ribozom tanıyıcı sitesi. |
Farklı virüs kaynaklarından (örneğin EMCV, CVB3 kaynakları) iç ribozom giriş sitesi (IRES) dizilerinin ekranlanması. |
| CDS |
Protein kodlayan bölgeler, antijenler, antikorlar veya diğer fonksiyonel proteinler için kodlayan diziler. |
Kodon optimizasyonu çeviri seviyesini artırır; belirli non-optimal kodonlar protein katlanmasında rol oynamaya da ön görülebilir. |
| Kodlayıcı olmayan |
Kodlayıcı olmayan diziler |
miRNAlara veya proteinlere hedeflenerek gen veya protein düzenlemesi sağlanır. |
miRNA veya proteinler için özel bağlama siteleri hedeflendiğinde, bağlama sitesinin dizisi tekrar edilebilir. |
Özelliklerimiz
- Optimize Edilmiş PIE Siklik Sistemi, mantıklı optimizasyon stratejileriyle birlikte %80'den fazla siklik oranına ulaşmak amacıyla tasarlanmıştır;
- En son CDS Optimizasyon Takımı, profesyonel AI algoritma takımıyla işbirliği yaparak CDS bölgesi kodonlarının optimizasyonunu tamamlar;
- Olgun ve Müşkümsüz Süreç ile circRNA, yüksek siklik verimliliği, yüksek stabilite ve yüksek çeviri verimliliği ile elde edilebilir.
Durum İncelemesi
Yaohai Bio-Pharma, RNA'nın döngülenmesini gerçekleştirmek için PIE sistemi üzerine kurulmuş kontrol ürünü olan artırılmış yeşil fluoresan protein (eGFP) circRNA'yı piyasaya sürdü.
Bir geleneksel transeksiyon rejanını kullanarak eGFP circRNA, 293T hücrelerine transfeksiyon edilir ve 24 saat sonra eGFP (yeşil) fluoresan sinyal tespit edilebilir; bu sinyal 48 saat sonra güçlenecektir. Transfeksiyonun yedinci ve ondördüncü gününde de fluoresan sinyal hala tespit edilebilir.
eGFP circRNA'nın in vitro ifade doğrulaması
EN
AR
HR
CS
DA
NL
FI
FR
DE
EL
IT
JA
KO
NO
PL
PT
RO
RU
ES
SV
IW
ID
LV
LT
SR
SK
SL
UK
VI
ET
HU
TH
TR
FA
AF
MS
BE
MK
UR
BN
