Strategie optymalizacji kodonów

Istnieją 64 kodony genetyczne, z których 60 koduje 20 aminokwasów. Każdy organizm używany do ekspresji lub produkcji białka (w tym Escherichia coli, drożdże, komórki ssaków, Pichia, komórki roślinne i komórki owadów) wykazuje pewien stopień różnicy lub preferencji w wykorzystaniu kodonów. Kodony najczęściej wykorzystywane w żywicielu nazywane są optymalnymi kodonami, podczas gdy te rzadziej używane nazywane są rzadkimi lub mało wykorzystywanymi kodonami.

Optymalizacja kodonów

Optymalizacja kodonów obejmuje modyfikację sekwencji genu poprzez wykorzystanie preferowanych kodonów i unikanie kodonów o niskim wykorzystaniu lub rzadkich, a następnie uzyskanie zmodyfikowanego genu poprzez syntezę genów. To przeprojektowanie genów nazywa się optymalizacją kodonów.

Zoptymalizowana sekwencja genu może zwiększyć stabilność struktury drugorzędowej mRNA, zapobiegając opóźnieniom translacji, przedwczesnemu zakończeniu translacji, przesunięciom ramki translacji i niezgodnościom aminokwasów wynikającym z niewystarczającej liczby tRNA.

Optymalizacja jest istotna, ponieważ ułatwia efektywny przebieg procesów, takich jak synteza genów, konstrukcja wektorów, transkrypcja i translacja.

Czynniki optymalizacji

Wyważanie zawartości GC: Ma to wpływ na stabilność wiązania, temperaturę wyżarzania i wydajność białka.

Zmniejszanie liczby powtarzających się sekwencji: Zmniejsza to trudność syntezy genów.

Dostosowywanie struktury drugorzędowej mRNA: Aby uniknąć struktur spinaczy, które wpływają na tłumaczenie.

Eliminacja miejsc cięcia enzymami restrykcyjnymi:Aby chronić integralność genu.

Preferencje kodonów: Optymalizacja genu dawcy w zależności od gospodarza w celu maksymalizacji ekspresji białka.

Wsparcie Yaohai

Do projektowania i syntezy genów sama ekspresja białka i optymalizacja kodonów nie są wystarczające. Różne metody i programy mogą projektować i produkować różne sekwencje mRNA zoptymalizowane pod kątem kodonów. Na podstawie powyższych czynników optymalizacji, w połączeniu z oficjalną bazą danych i podsumowując lata doświadczenia w syntezie genów, Yaohai Bio-Pharma opracowała swoją unikalną bazę danych optymalizacji kodonów. Może ona zapewnić Ci bezpłatną optymalizację kodonów i projektowanie schematów syntezy genów w celu zmaksymalizowania optymalizacji kodonów w Twojej sekwencji genów.

Yaohai Bio-Pharma opracowała kompletny zestaw technologii syntezy liniowego i cyrkularnego mRNA w celu zapewnienia wysokiej jakości RNA, takich jak projektowanie i optymalizacja sekwencji, synteza genów, IVT, cyrkularizacja, oczyszczanie RNA i enkapsulacja LNP.

Aktywnie poszukujemy także partnerów instytucjonalnych lub indywidualnych na całym świecie. Oferujemy najbardziej konkurencyjne wynagrodzenie w branży. Jeśli masz jakiekolwiek pytania, skontaktuj się z nami: [email protected]

Więcej szczegółów na temat Yaohai Bio-Pharma znajdziesz na naszej stronie internetowej: www.yaohaibio-pharma.com