Strategie optymalizacji kodonów

Istnieje 64 kodony genetyczne, z których 60 koduje 20 aminokwasów. Każdy organizm używany do wyrażania lub produkcji białek (w tym Escherichia coli, drożdże, komórki ssaków, Pichia, komórki roślin i komórki owadów) wykazuje pewien stopień różnicy lub preferencji w stosunku do użycia kodonów. Najczęściej używane kodony w danym gospodarzu nazywane są optymalnymi kodonami, podczas gdy te rzadziej używane nazywane są kodonami rzadkimi lub mało wykorzystywanymi.

Optymalizacja kodonów

Optymalizacja kodonów obejmuje modyfikację sekwencji genu za pomocą preferowanych kodonów oraz unikanie kodonów mało wykorzystywanych lub rzadkich, a następnie uzyskanie zmodyfikowanego genu poprzez syntezę genu. Ten proces przekształcania genów nazywa się optymalizacją kodonów.

Zoptymalizowana sekwencja genu może zwiększyć stabilność struktury drugorzędowej mRNA, zapobiegając opóźnieniom w translacji, przedwczesnemu zakończeniu translacji, przesunięciu ramki translacji oraz niezgodnościom aminokwasów spowodowanym niedostatkiem pól tRNA.

Optymalizacja jest istotna, ponieważ ułatwia efektywny postęp procesów takich jak synteza genu, konstrukcja wektora, transkrypcja i translacja.

Czynniki optymalizacji

Wyważanie zawartości GC: To wpływa na stabilność wiązania, temperaturę annealingu oraz wydajność białka.

Redukowanie powtarzających się sekwencji: To zmniejsza trudność w syntezie genu.

Dostosowywanie struktury sekundarnej mRNA: Aby uniknąć struktur hairpin, które wpływają na translację.

Eliminowanie miejsc cięcia enzymami restrykcyjnymi : Aby chronić integralność genu.

Preferencja kodonów: Optymalizacja genu dawczego zgodnie z gospodarzem w celu maksymalizacji wyrażania białek.

Wsparcie Yaohai

W przypadku projektowania i syntezy genów, sam wyraz białkowy i optymalizacja kodonów nie są wystarczające. Różne metody i programy mogą zaprojektować i wyprodukować różne sekwoencje mRNA optymalizowane pod kątem kodonów. Na podstawie powyższych czynników optymalizacyjnych, połączonych z oficjalną bazą danych oraz podsumowując lata doświadczeń w zakresie syntezy genów, firma Yaohai Bio-Pharma opracowała swoją unikalną bazę danych optymalizacji kodonów. Może ona dostarczyć Ci bezpłatnej optymalizacji kodonów i projektu syntezy genu w celu maksymalizacji optymalizacji Twojej sekwencji genowej.

Firma Yaohai Bio-Pharma stworzyła kompletny zestaw technologii syntezy mRNA liniowego i kołowego, aby dostarczać wysokiej jakości RNA, takie jak projektowanie i optymalizacja sekwencji, synteza genu, IVT, koecalizacja, czyścienie RNA oraz otulanie LNP.

Szukamy również globalnych partnerów instytucjonalnych lub indywidualnych. Ofiarowujemy najbardziej konkurencyjne wynagrodzenie w branży. Jeśli masz jakiekolwiek pytania, prosimy o kontakt: [email protected]

Aby uzyskać więcej szczegółów o Yaohai Bio-Pharma, prosimy odwiedzić naszą stronę internetową: www.yaohaibio-pharma.com