Kodonu optimizācijas stratēģijas

Ir 64 genetiskie kodoni, no kuriem 60 kodē 20 aminokārtis. Katrs organizms, kas izmests olīgoziņu izteikšanai vai ražošanai (ieskaitot Escherichia coli, griezus, sūklaini klasis, Pichia, augu klasis un insektu klasis), parāda dažādus kodonu lietošanas atšķirīgus līmeņus vai preferenci. Biežāk lietotie kodoni mājas organizma kontekstā sauc par optimāliem kodoniem, savukārt reti lietotie vai zemā frekvencē lietotie sauc par retiem vai zemfrekventiem kodoniem.

Kodonu optimizācija

Kodonu optimizācija ietver gēna secības modifikāciju, izmantojot preferentos kodonus un izvairoties no zemfrekventajiem vai retajiem kodoniem, un pēc tam iegūstot modificēto gēnu caur gēna sintēzi. Šis gēnu pārdesaignēšanas process tiek saukt par kodonu optimizāciju.

Optimizēta gēna secība var uzlabot mRNA sekundāro struktūras stabilitāti, novēršot tulkotāja kavas, agru pabeigumu, translācijas freimshiftu un aminokārtju neatbilstību dēļ trūkstamajām tRNA daudzumā.

Optimizācija ir nozīmīga, jo tā ļauj efektīvi attīstīt procesus, piemēram, gēnu sintēzi, vektoru konstruēšanu, transkripciju un translāciju.

Optimizācijas faktori

Gc satura līdzsvarošana: Šis ietekmē saistības stabilitāti, anelēšanas temperatūru un olbaltumvielu ražojumu.

Atkārtotās sekvenču samazināšana: Šis samazina gēnu sintēzes grūtības.

MRnā otrā struktūras pielāgošana: Lai izvairītos no šķūņu struktūrām, kas ietekmē translāciju.

Ierobežojošo enzīmu griešanas vietu novēršana : Lai aizsargātu gēna integritāti.

Kodonu preferense: Donora gēna optimizācija saskaņā ar saimnieku, lai maksimāli palielinātu proteīna izpašināšanu.

Yaohai atbalsts

Gēnu dizaina un sintezei nav pietiekami vien tikai proteīna izpašināšanas un kodonu optimizācijas aspekti. Dažādas metodes un programmas var izstrādāt un ražot dažādus kodonu optimizētus mRNA sekvences. Balstoties uz iepriekš minētajiem optimizācijas faktoriem, savienojot to oficiālo datubāzi un apkopojot gadu ilgu pieredzi gēnu sintezē, Yaohai Bio-Pharma ir izstrādājusi savu unikālo kodonu optimizācijas datubāzi. Tā var jums piedāvāt bezmaksas kodonu optimizāciju un gēnu sintezes plāna izstrādi, lai maksimāli optimizētu jūsu gēna sekvenci.

Yaohai Bio-Pharma ir izveidojusi pilnīgu lineārā un apļveida mRNA sintezes tehnoloģiju, lai nodrošinātu augstas kvalitātes RNA, piemēram, sekvences dizainu un optimizāciju, gēnu sintēzi, IVT, apļveida veidošanu, RNA tīrīšanu un LNP kapsulēšanu.

Mēs aktīvi meklējam globālus partnerus, gan iestāžu, gan personīgu līmenī. Mēs piedāvājam nozīmē spēcīgāko atalgojumu. Ja jums ir jebkādas jautājumi, lūdzu, nerozdomājiet mūs sazināties: [email protected]

Lai iegūtu vairāk informācijas par Yaohai Bio-Pharma, lūdzu, apmeklējiet mūsu vietni: www.yaohaibio-pharma.com