Kodonu optimizācijas stratēģijas

Ir 64 ģenētiskie kodoni, no kuriem 60 kodē 20 aminoskābes. Katrs organisms, ko izmanto olbaltumvielu ekspresijai vai ražošanai (tostarp Escherichia coli, raugs, zīdītāju šūnas, Pichia, augu šūnas un kukaiņu šūnas), uzrāda zināmas atšķirības vai priekšrocības kodonu lietošanā. Kodonus, ko saimniekā visbiežāk izmanto, sauc par optimālajiem kodoniem, savukārt tos, kas netiek bieži lietoti, sauc par retajiem vai zema lietojuma kodoniem.

Kodona optimizācija

Kodonu optimizācija ietver gēnu sekvences modificēšanu, izmantojot vēlamos kodonus un izvairoties no zema lietojuma vai retiem kodoniem, un pēc tam modificētā gēna iegūšanu gēnu sintēzes ceļā. Šo gēnu pārprojektēšanu sauc par kodona optimizāciju.

Optimizēta gēnu secība var uzlabot mRNS sekundārās struktūras stabilitāti, novēršot translācijas aizkavēšanos, priekšlaicīgu translācijas pārtraukšanu, translācijas kadru maiņu un aminoskābju neatbilstības nepietiekamu tRNS kopu dēļ.

Optimizācija ir nozīmīga, jo tā veicina tādu procesu efektīvu progresēšanu kā gēnu sintēze, vektoru konstruēšana, transkripcija un translācija.

Optimizācijas faktori

GC satura līdzsvarošana: Tas ietekmē saistīšanās stabilitāti, atkausēšanas temperatūru un proteīna iznākumu.

Atkārtotu secību samazināšana: Tas samazina gēnu sintēzes grūtības.

MRNS sekundārās struktūras pielāgošana: Lai izvairītos no matadata struktūrām, kas ietekmē tulkošanu.

Restrikcijas enzīmu griezuma vietu likvidēšana: lai aizsargātu gēna integritāti.

Kodona izvēle: Donora gēna optimizēšana atbilstoši saimniekam, lai maksimāli palielinātu proteīna ekspresiju.

Yaohai atbalsts

Gēnu projektēšanai un sintēzei ar proteīnu ekspresiju un kodona optimizāciju nepietiek. Dažādas metodes un programmas var izstrādāt un ražot dažādas kodoniem optimizētas mRNS sekvences. Pamatojoties uz iepriekš minētajiem optimizācijas faktoriem, apvienojumā ar oficiālo datubāzi un apkopojot gēnu sintēzes gadu pieredzi, Yaohai Bio-Pharma ir izstrādājusi savu unikālo kodonu optimizācijas datubāzi. Tas var nodrošināt jūs ar bezmaksas kodonu optimizāciju un gēnu sintēzes shēmas izstrādi, lai maksimāli palielinātu jūsu gēnu sekvences kodonu optimizāciju.

Yaohai Bio-Pharma ir izveidojis pilnu lineāro mRNS un cirkulārās mRNS sintēzes tehnoloģiju komplektu, lai nodrošinātu augstas kvalitātes RNS, piemēram, sekvences izstrādi un optimizāciju, gēnu sintēzi, IVT, cirkularizāciju, RNS attīrīšanu un LNP iekapsulēšanu.

Mēs arī aktīvi meklējam institucionālus vai individuālus globālus partnerus. Mēs piedāvājam konkurētspējīgāko atalgojumu nozarē. Ja jums ir kādi jautājumi, lūdzu, sazinieties ar mums: [email protected]

Lai iegūtu papildinformāciju par Yaohai Bio-Pharma, lūdzu, skatiet mūsu vietni: www.yaohaibio-pharma.com