Pagal centrinį dogmą, pranešimo RNA (mRNA) yra tiltas genetiniam medžiagai perduoti iš DNA į baltymus.
mRNA atlieka biologinį vaidmenį koduojant baltymus organizme, o eukariotinių organizmų suvirsčioji mRNA sudaryta iš penkių dalių: 5' Kapas (kapo struktūra), 5' UTR (nekoduojamas regionas), ORF (atvirasis skaitymo langas), 3' UTR ir 3' polyA uodega (poliadeno uodega).
Procesas | Neprivalomas Paslauga | Paslaugų detalės | Pristatymo laikotarpis (diena) |
mRNA Sekos Dizainas ir Optimalizavimas | Kodujančių seku dizainas ir optimalizavimas |
CDS sekansų lyginimas CDS kodono optimizavimas |
1 |
Nenuklizinio sekų projektavimas ir optimizavimas |
5' UTR sekos dizainas ir optimizavimas 3' UTR sekos dizainas ir optimizavimas polyA sekos dizainas ir optimizavimas |
1-2 |
5’ UTR\/3’ UTR |
|
3' PolyA uodega |
|
mRNA komponentai | Biologinės funkcijos | Optimizavimo strategijos |
5' kapas | Apsaugoti mRNA nuo degradacijos dėl exonukleazų ir dirbti kartu su polyA uodega 3' galą, polyA jungties baltymu ir vertimo pradžios faktoriaus baltymu, kad pradėtų baltymo vertimą. | Natūralus Cap1 struktūra vengia modelio atpažinimo receptorius ir taip sumažina natūralią imuninę atsakomybę, kuri gali būti pasiekiama vienu etapu bendro transkripcinio apdorojimo arba dviejų etapų enzymatiniu apdorojimu [žr. mRNA enzymatinį apdorojimą ir bendro transkripcinio apdorojimo išsamiau]. |
5' UTR | 5' UTR gali būti atpažintas ribosomomis, reguliuoti mRNA vertimą ir paveikti mRNA stabilumą. | Turėti Kozak sekcijas be labai stabilios antrosios sandaros. Gamtinių UTR regionų iš aukštais lygiais išreikštų genų, pavyzdžiui, α-globino ir β-globino, rekomenduojama naudoti in vitro transkripcijai (IVT) mRNA. |
CDS | Regionai koduojantys baltymus ir kodavimo sekos antigenums, antikūnams ar kitoms funkcionalioms baltymų formoms. | Kodonų optimizavimas padidina vertimą, atsižvelgiant į tai, kad kai kurie neoptimalūs kodonai gali turėti vaidmenį baltymo suklaidymo procese. |
3' UTR | Reguliuoja mRNA vertimą ir stabilumą. | Gamtinių UTR regionų iš aukštais lygiais išreikštų genų, pavyzdžiui, α-globino ir β-globino, rekomenduojama naudoti IVT mRNA. |
3' polyA uostas | Reguliuoja baltymo išreikšmę ir apsaugo kapo struktūrą nuo degeneracijos. | Reikalingas tinkamas ilgis (100-150 bp); poliA uosto kodavimas transkripcijos šabloninėje plazmidoje užtikrina tikslesnį poliA uosto ilgį. |
Kelišališki aukštai išreikšti natūralūs ir modifikuoti UTR bibliotekos; sužinojusi UTR modifikavimo strategija;
Suderinama su profesionaliai AI algoritmo komanda, kad baigtų kodonų optimizavimą.
Pridedamos polyA sekos pagal DNA šablonus, kad tiksliau kontroliuotų bRNA ilgį.
Pasiekti efektyvų bRNA išreikšimą su žemas imunogenybe.
Dviramučio bRNA seka dizainas: mCherry-eGFP bRNA
Yaohai Bio-Pharma bRNA paslaugos toliau yra atnaujinamos, sukurdamos ir optimizuojamos dviejų ramsčių geno seką, kurios siekia dviejų genų bendro išreikšimo.
Naudojant konvencinį transfekcijos reagentą, dvigubas geno tandemu seka mCherry-eGFP mRNA transfekuojama į 293T ląstelę, ir po 48 valandų yra aptikti du fluorescencinio signalo mCherry (raudona) ir stiprintoji žali fluorescencinė baltymas (eGFP) kartu su tuo pačiu momentiniu išraiškos metu, o sudėtinis grafikas yra pažymimas geltonai.
MCherry-eGFP mRNA išraiška 293T ląseles