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mRNA 서열 설계

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IVT RNA

mRNA 서열 설계

중앙 가설에 따르면, 메신저 RNA(mRNA)는 DNA에서 단백질로의 유전 물질 전달을 연결하는 다리입니다.

mRNA는 생체 내에서 단백질을 인코딩하여 생물학적 역할을 하며, 진핵생물의 성숙한 mRNA는 5' Cap(캡 구조), 5' UTR(비번역 영역), ORF(개방 읽기 프레임), 3' UTR, 그리고 3' polyA 꼬리(polyadenylate tail)라는 다섯 가지 구성 요소로 이루어져 있습니다.

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서비스 세부사항
공정 선택적 서비스 서비스 상세 납기(일)
mRNA 서열 설계 및 최적화 코딩 서열의 설계 및 최적화

CDS 서열 정렬

CDS 코돈 최적화

1
비코딩 시퀀스의 설계 및 최적화

5' UTR 시퀀스 설계 및 최적화

3' UTR 시퀀스 설계 및 최적화

polyA 시퀀스 설계 및 최적화

1-2
사용자 정의 가능한 옵션
5' UTR\/3' UTR
  • 자연적인 UTR 시퀀스
  • 변이/설계된 UTR 시퀀스
3' PolyA 꼬리
  • 100A ~120A 테일 (권장)
  • 분할된 polyA 테일
  • 기타 맞춤형 테일
MRNA 서열 설계를 위한 일반적인 전략
mRNA 구성 요소 생물학적 기능 최적화 전략
5' 캡 MRNA가 엑소뉴클레아제에 의한 분해로부터 보호되며, 3' 끝의 폴리A 꼬리, 폴리A 결합 단백질 및 번역 초기화 인자 단백질과 협력하여 단백질 번역을 시작합니다. 자연적인 Cap1 구조는 패턴 인식 수용체를 피하므로 자연 면역 반응을 줄일 수 있으며, 이는 한 단계 공전사 캡핑 또는 두 단계 효소적 캡핑을 통해 달성될 수 있습니다 [세부 사항은 mRNA 효소적 캡핑 및 공전사 캡핑 참조].
5' UTR 5' UTR은 리보좀에 의해 인식될 수 있으며, mRNA의 번역을 조절하고 mRNA의 안정성을 영향을 미칠 수 있습니다. 매우 안정적인 2차 구조 없이 Kozak 시퀀스를 포함합니다. 체외 전사(IVT) mRNA에 대해 높게 발현되는 유전자들의 자연적인 UTRs, 예를 들어 α-글로빈 및 β-글로빈이 선호됩니다.
CDS 단백질을 인코딩하는 영역과 항원, 항체 또는 기타 기능적 단백질의 코딩 시퀀스. 코돈 최적화는 번역 수준을 증가시키며, 특정 비최적 코돈이 단백질 접힘에 역할을 할 수 있음에 유의.
3' UTR MRNA 번역과 안정성을 조절함. Α-글로빈 및 β-글로빈과 같은 높게 발현된 유전자들의 자연적인 UTRs가 IVT mRNA에 선호됨.
3' polyA 테일 단백질 발현을 조절하고 캡 구조를 분해로부터 보호함. 적절한 길이(100-150 bp)가 필요하며, 전사 템플릿 플라스미드 상에서 polyA 꼬리를 인코딩하면 더 정의된 polyA 꼬리 길이를 보장함.
우리의 특징
  • 다양한 UTR 출처 선택

높게 발현된 자연 및 수정된 UTR 라이브러리의 다수 출처; 성숙한 UTR 수정 전략;

  • 최신 CDS 최적화 팀

전문적인 AI 알고리즘 팀과 협력하여 코돈 최적화를 완성합니다.

  • 균일한 polyA 꼬리 분포

DNA 템플릿에 따라 polyA 시퀀스를 추가하여 mRNA 길이를 더욱 정확히 제어합니다.

  • 다양한 최적화 조합

저 면역원성을 가진 mRNA의 효율적인 발현을 달성합니다.

사례 연구

듀얼 리포터 mRNA의 시퀀스 설계: mCherry-eGFP mRNA

야오하이 바이오-파마의 mRNA 서비스는 두 개의 리포터 유전자 탠덤 시퀀스의 설계 및 최적화를 통해 업그레이드되며, 이는 두 유전자의 공동 발현을 가능하게 합니다.

기존 전달 재제를 사용하여 293T 세포에 mCherry-eGFP mRNA를 전달하면, 48시간 후 mCherry(빨강)와 강화된 녹색 형광 단백질(eGFP)의 두 가지 형광 신호가 동시에 검출되며, 중첩 그래프는 노란색으로 강조됩니다.

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293T 세포에서의 mCherry-eGFP mRNA 발현

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