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circRNA 서열 설계

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IVT RNA

circRNA 서열 설계

야오하이 바이오파마는 PIE 시스템(엑손 및 인트론 정렬)을 기반으로 circRNA를 준비하며, 이는 1형 인트론의 자기 스플라이싱 기능에 의존하여 RNA 순환화를 달성합니다. PIE 구조는 T4 td 유전자 또는 어류 tRNA 전구체 유전자를 사용하여 설계되며, 배열은 다음과 같습니다:

RNA 인트론과 지원 엑손 조각은 두 부분(5' 말단과 3' 말단)으로 나뉘며, 여기서 5' 말단 서열은 대상 서열의 꼬리로 전달되고, 3' 말단 서열은 대상 서열 앞에 삽입되며, 대상 유전자 서열은 중간에 삽입됩니다.

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GTP의 촉매 작용 아래, PIE 구조는 인트론 외의 서열들의 순환화를 유도합니다. 적절한 순환율 강화 전략과 결합하여 야오하이 바이오파마는 순환율 80% 이상으로 최대 4 kb의 서열 순환화를 달성할 수 있습니다.

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그림 1. PIE 시스템 기반의 circRNA 체외 순환 과정

서비스 세부사항
공정 선택적 서비스 서비스 상세 납기(작업일)
circRNA 시퀀스 설계 및 최적화 코딩 서열의 설계 및 최적화

CDS 서열 정렬

CDS 코돈 최적화

1
비코딩 시퀀스의 설계 및 최적화

인트론 및 엑손 시퀀스 설계 및 최적화

동源성 암 시퀀스 설계 및 최적화

스페이서 서열 설계 및 최적화

1-2
MRNA 서열 설계를 위한 일반적인 전략
순환 RNA 구성 요소 생물학적 기능 최적화 전략
양단 인트론 및 엑손 서열 GTP 촉매에 의한 인트론 자기 스플라이싱으로 인트론 외부의 서열을 순환화함. T4 td 유전자 또는 어류 오일 tRNA 전구체 유전자에 따라 설계됨.
코딩 IRES CircRNA 번역을 조절하는 내부 리보솜 인식 부위. 다양한 바이러스 출처에서 내부 리보솜 진입 부위 (IRES) 서열 선별, 예: EMCV, CVB3 출처.
CDS 단백질 코딩 영역, 항원, 항체 또는 기타 기능적 단백질을 코딩하는 서열. 코돈 최적화는 번역 수준을 증가시킵니다; 일부 비최적 코돈은 단백질 접힘에 역할을 할 수 있습니다.
비코딩 비코딩 서열 MiRNA나 단백질을 대상으로 유전자 또는 단백질 조절을 수행합니다. MiRNA나 단백질의 특정 결합 부위를 대상으로 결합 부위의 서열을 반복할 수 있습니다.
우리의 특징
  • 최적화된 PIE 순환 시스템 조합으로 합리적인 최적화 전략을 통해 80% 이상의 순환율을 달성;
  • 최첨단 CDS 최적화 팀이 전문 AI 알고리즘 팀과 협력하여 CDS 영역 코돈의 최적화를 완료;
  • 성숙하고 완벽한 공정 circRNA는 높은 순환 효율, 높은 안정성 및 높은 번역 효율로 달성될 수 있습니다.
사례 연구

야오하이 바이오-파마는 PIE 시스템을 기반으로 RNA 순환화를 달성하는 제어 제품인 강화된 녹색 형광 단백질 (eGFP) circRNA를 출시했습니다.

일반적인 전달제를 사용하여 eGFP circRNA를 293T 세포에 전달하면, 24시간 후에 eGFP (녹색) 형광 신호를 검출할 수 있으며, 48시간 후에는 더욱 강화됩니다. 형광 신호는 전달 후 7일째와 14일째에도 여전히 검출될 수 있습니다.

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EGFP circRNA의 체외 발현 검증

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