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コドン最適化戦略

Feb 05, 2025

64の遺伝子コドンがあり、そのうち60が20のアミノ酸をコードします。タンパク質の発現または生産に使用されるすべての生物(エシェリヒア・コリ、酵母、哺乳類細胞、ピチア、植物細胞、昆虫細胞を含む)は、コドン使用において某种程度の違いや優先度を持っています。ホストで最も頻繁に使用されるコドンは最適コドンと呼ばれ、あまり使用されないものは希少コドンまたは低使用コドンと呼ばれます。

コドン最適化

コドン最適化とは、好まれるコドンを使用し、低使用または希少コドンを避けるために遺伝子配列を変更し、その後合成遺伝子によって変更された遺伝子を得ることです。この遺伝子の再設計をコドン最適化と呼びます。

最適化された遺伝子配列は、mRNAの二次構造の安定性を高め、tRNAプールの不足による翻訳遅延、早期翻訳終了、転位シフト、およびアミノ酸の不一致を防ぎます。

最適化は、遺伝子合成、ベクター構築、転写、翻訳などのプロセスの効率的な進行を促進するため、非常に重要です。

最適化要因

GC含量のバランス: これは結合の安定性、アニーリング温度、タンパク質の収量に影響します。

反復配列の削減: これにより、遺伝子合成の難易度が低下します。

MRNA二次構造の調整: 翻訳に影響を与えるヘアピン構造を避けるためです。

制限酵素切断部位の除去 : 遺伝子の完全性を保護するために。

コドンの優先順位: 寄与遺伝子をホストに応じて最適化し、タンパク質の発現を最大化する。

要海(Yaohai)のサポート

遺伝子設計と合成において、単なるタンパク質の発現やコドン最適化だけでは十分ではありません。異なる方法やプログラムは、異なるコドン最適化されたmRNA配列を設計・生成できます。上記の最適化要因に基づき、公式データベースと長年の遺伝子合成経験を総合的に活用して、要海バイオファーマは独自のコドン最適化データベースを開発しました。これにより、あなたの遺伝子配列のコドン最適化を最大限に高めるための無料のコドン最適化および遺伝子合成方案設計を提供することができます。

要海バイオファーマは、高品質なRNAを提供するために、線状mRNAおよび環状mRNAの合成技術を確立しました。これには、配列設計と最適化、遺伝子合成、IVT(in vitro transcription)、環状化、RNA精製、そしてLNPカプセル化が含まれます。

また、グローバルな機関や個人のパートナーを求めています。私たちは業界で最も競争力のある報酬を提供しています。質問がある場合は、お気軽にお問い合わせください: [email protected]

Yaohai Bio-Pharma の詳細については、ウェブサイトをご覧ください: www.yaohaibio-pharma.com