コドン最適化戦略

遺伝コドンは 64 種類あり、そのうち 60 種類は 20 種類のアミノ酸をコードしています。タンパク質の発現や生産に使用されるすべての生物 (大腸菌、酵母、哺乳類細胞、ピキア、植物細胞、昆虫細胞など) は、コドンの使用に関してある程度の違いや好みを示します。宿主で最も頻繁に使用されるコドンは最適コドンと呼ばれ、あまり使用されないコドンは希少コドンまたは低使用コドンと呼ばれます。

コドン最適化

コドン最適化では、優先コドンを利用し、使用頻度の低いコドンや稀なコドンを回避することで遺伝子配列を変更し、遺伝子合成によって変更された遺伝子を取得します。この遺伝子の再設計は、コドン最適化と呼ばれます。

最適化された遺伝子配列は、mRNA の二次構造の安定性を高め、翻訳の遅延、早期の翻訳終了、翻訳フレームシフト、および tRNA プールの不足によるアミノ酸の不一致を防ぐことができます。

最適化は、遺伝子合成、ベクター構築、転写、翻訳などのプロセスの効率的な進行を促進するため重要です。

最適化要因

GC含有量のバランスをとる: これは結合安定性、アニーリング温度、およびタンパク質収量に影響します。

繰り返しシーケンスの削減: これにより、遺伝子合成の難易度が低下します。

mRNAの二次構造の調整: 翻訳に影響するヘアピン構造を回避するため。

制限酵素切断部位の除去: 遺伝子の完全性を保護するため。

コドンの優先順位: 宿主に応じてドナー遺伝子を最適化し、タンパク質発現を最大化します。

ヤオハイのサポート

遺伝子の設計と合成には、たんぱく質の発現とコドンの最適化だけでは不十分です。さまざまな方法とプログラムで、さまざまなコドン最適化 mRNA 配列を設計および生成できます。上記の最適化要因に基づき、公式データベースと組み合わせ、長年の遺伝子合成経験をまとめ、Yaohai Bio-Pharma は独自のコドン最適化データベースを開発しました。このデータベースは、遺伝子配列のコドン最適化を最大限に高めるための無料のコドン最適化と遺伝子合成スキーム設計を提供します。

Yaohai Bio-Pharma は、配列設計と最適化、遺伝子合成、IVT、環状化、RNA 精製、LNP カプセル化など、高品質の RNA を提供するための完全な線形 mRNA および環状 mRNA 合成技術セットを確立しました。

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