Strategie di ottimizzazione dei codoni

Ci sono 64 codoni genetici, di cui 60 codificano 20 amminoacidi. Ogni organismo utilizzato per l'espressione o la produzione di proteine ​​(inclusi Escherichia coli, lievito, cellule di mammifero, Pichia, cellule vegetali e cellule di insetto) mostra un certo grado di differenza o preferenza nell'uso dei codoni. I codoni più frequentemente utilizzati in un ospite sono chiamati codoni ottimali, mentre quelli non frequentemente utilizzati sono chiamati codoni rari o a basso utilizzo.

Ottimizzazione del codone

L'ottimizzazione dei codoni comporta la modifica di una sequenza genica utilizzando i codoni preferiti ed evitando i codoni rari o poco utilizzati, e quindi ottenendo il gene modificato tramite sintesi genica. Questa riprogettazione dei geni è definita ottimizzazione dei codoni.

Una sequenza genica ottimizzata può migliorare la stabilità della struttura secondaria dell'mRNA, prevenendo ritardi nella traduzione, interruzioni premature della traduzione, spostamenti del frame di traduzione e incongruenze degli amminoacidi dovute a pool di tRNA insufficienti.

L'ottimizzazione è importante perché facilita l'efficiente progressione di processi quali la sintesi genica, la costruzione di vettori, la trascrizione e la traduzione.

Fattori di ottimizzazione

Bilanciamento del contenuto GC: Ciò influisce sulla stabilità del legame, sulla temperatura di ricottura e sulla resa proteica.

Riduzione delle sequenze ripetitive: Ciò riduce la difficoltà della sintesi genetica.

Regolazione della struttura secondaria dell'mRNA: Per evitare strutture a forcina che influiscono sulla traduzione.

Eliminazione dei siti di taglio degli enzimi di restrizione: Per proteggere l'integrità del gene.

Preferenza del codone: Ottimizzazione del gene donatore in base all'ospite per massimizzare l'espressione proteica.

Il supporto di Yaohai

Per la progettazione e la sintesi genica, la semplice espressione proteica e l'ottimizzazione dei codoni non sono sufficienti. Metodi e programmi diversi possono progettare e produrre diverse sequenze di mRNA ottimizzate per codoni. Sulla base dei fattori di ottimizzazione di cui sopra, combinati con il suo database ufficiale e riassumendo anni di esperienza nella sintesi genica, Yaohai Bio-Pharma ha sviluppato il suo esclusivo database di ottimizzazione dei codoni. Può fornirti gratuitamente l'ottimizzazione dei codoni e la progettazione di schemi di sintesi genica per massimizzare l'ottimizzazione dei codoni della tua sequenza genica.

Yaohai Bio-Pharma ha sviluppato un set completo di tecnologie di sintesi di mRNA lineare e mRNA circolare per fornire RNA di alta qualità, tra cui progettazione e ottimizzazione della sequenza, sintesi genica, IVT, circolarizzazione, purificazione dell'RNA e incapsulamento LNP.

Stiamo anche cercando attivamente partner globali istituzionali o individuali. Offriamo il compenso più competitivo del settore. Se avete domande, non esitate a contattarci: [email protected]

Per maggiori dettagli su Yaohai Bio-Pharma, si prega di fare riferimento al nostro sito web: www.yaohaibio-pharma.com