alla kategorier
ENEN
circRNA sekvensdesign

circRNA sekvensdesign Sverige

Hem >  IVT RNA  >  Anpassad RNA-syntes  >  Anpassad circRNA-syntes  >  circRNA sekvensdesign

IVT RNA

circRNA sekvensdesign

Yaohai Bio-Pharma förbereder circRNA baserat på PIE-systemet (anpassning av exoner och introner), som förlitar sig på den självsplitsande funktionen hos typ I-introner för att uppnå RNA-cyklisering. PIE-strukturen är designad med hjälp av T4 td-genen eller fishy tRNA-prekursorgenen, och arrangemanget är som följer:

RNA-intronet och det stödjande exonfragmentet är uppdelade i två delar (5'-terminal och 3'-terminal), där den 5'-terminala sekvensen överförs till målsekvensens svans, den 3'-terminala sekvensen infogas i fronten av målsekvens, och målgensekvensen infogas i mitten.

odefinierad

Under katalys av GTP leder PIE-strukturen till cyklisering av andra sekvenser än introner. I kombination med en rimlig förbättringsstrategi för cykliseringshastighet, kan Yaohai Bio-Pharma uppnå cyklisering av sekvenser upp till 4 kb med en cykliseringshastighet på mer än 80 %.

odefinierad

Figur 1. In vitro-cirkulation av circRNA baserat på PIE-systemet

Tjänster detaljer
Behandla Valfri tjänst Service detaljer Leveransperiod (arbetsdag)
circRNA-sekvensdesign och optimering Design och optimering av kodningssekvenser

CDS-sekvensinriktning

CDS kodonoptimering

 1
Design och optimering av icke-kodande sekvenser

Intron och exon sekvensdesign och optimering

Homolog armsekvensdesign och optimering

Spacer sekvens design och optimering

 1-2
Gemensamma strategier för mRNA-sekvensdesign
CircRNA-komponenter Biologiska funktioner Optimeringsstrategier
Tvåterminala intron- och exonsekvenser GTP-katalyserad intronsjälvsplitsning för cyklisering av sekvenser utanför intronen. Designad enligt T4 td-genen eller fiskolja tRNA-prekursorgenen.
Kodning IRES Intern ribosomigenkänningsplats som reglerar translationen av circRNA. Screening av IRES-sekvenser (intern ribosom entry site) från olika virala källor, t.ex. EMCV, CVB3-källor.
CDS Proteinkodande regioner, sekvenser som kodar för antigener, antikroppar eller andra funktionella proteiner. Kodonoptimering ökar översättningsnivån; vissa icke-optimala kodon kan spela en roll vid proteinveckning.
Icke-kodning Icke-kodande sekvenser Mål miRNA eller proteiner för att utöva gen- eller proteinreglering. Inriktning på specifika bindningsställen för miRNA eller proteiner kan upprepa sekvenserna för bindningsstället.
Våra funktioner
  • Optimerat PIE-cykliseringssystem Kombination med rimliga optimeringsstrategier för att uppnå en cykliseringshastighet på mer än 80 %;
  • Banbrytande CDS-optimeringsteam Samarbete med professionellt AI-algoritmteam för att slutföra optimeringen av CDS-regionkodon;
  • Mogen och perfekt process circRNA kan uppnås med hög cykliseringseffektivitet, hög stabilitet och hög translationseffektivitet.
Fallstudie

Yaohai Bio-Pharma lanserade kontrollprodukten förstärkt grönt fluorescerande protein (eGFP) circRNA, som är baserat på PIE-systemet för att uppnå cyklisering av RNA.

Med ett konventionellt transfektionsreagens transfekteras eGFP circRNA in i 293T-celler och eGFP (grön) fluorescerande signal kan detekteras efter 24 timmar, vilket kommer att förstärkas efter 48 timmar. Den fluorescerande signalen kan fortfarande detekteras på den 7:e dagen och den 14:e dagen efter transfektion.

图片

In vitro expressionsvalidering av eGFP circRNA

Få en gratis offert

Kontakta oss