Yaohai Bio-Pharma förbereder circRNA baserat på PIE-systemet (justering av exoner och introner), vilket bygger på den själva-splicingsfunktionen hos typ I introner för att uppnå RNA-cyklisering. PIE-strukturen designas med hjälp av T4 td-genen eller fiskets tRNA-prekursorgen, och ordningen är följande:
RNA-intronen och stödjande exonfragment delas in i två delar (5' terminal och 3' terminal), där 5' terminalsekvensen överförs till slutet av målsekvensen, 3' terminalsekvensen infogas framför målsekvensen och målgensekvensen infogas i mitten.
Under katalys av GTP leder PIE-strukturen till cykling av sekvenser andra än introner. Tillsammans med en rimlig förstärkningsstrategi för cyklingshastigheten kan Yaohai Bio-Pharma uppnå cykling av sekvenser upp till 4 kb med en cyklingshastighet på mer än 80%.
Figur 1. In vitro-cirkulation av circRNA baserat på PIE-systemet
Process | Valfritt tjänstetillbud | Tjänstdetaljer | Leveranstid (arbetsdag) |
circRNA-sekvensdesign och optimering | Design och optimering av kodningssekvenser |
Justering av CDS-sekvenser Optimering av CDS-kodon |
1 |
Design och optimering av icke-kodande sekvenser |
Design och optimering av intron- och exonsekvenser Design och optimering av homolog armsekvens Design och optimering av spacersekvens |
1-2 |
CircRNA-komponenter | Biologiska funktioner | Optimeringsstrategier | |
Två-terminala intron- och exONSEKVENSER | GTP-katalysert intronselfsplicing för cyklisering av sekvenser utanför intronet. | Utformad enligt T4 td-genen eller fiskoljans tRNA-precursorgen. | |
Kodning | IRES | Intern ribosomidentifieringssite som reglerar översättningen av circRNA. | Skärning av interna ribosominträdessekvenser (IRES) från olika viruskällor, t.ex. EMCV, CVB3-källor. |
CDS | Proteinkodande regioner, sekvenser som kodar för antigener, antikroppar eller andra funktionsproteiner. | Kodonoptimering ökar översättningnivån; vissa icke-optimala kodoner kan spela en roll i proteinfaldning. | |
Icke-kodande | Icke-kodande sekvenser | Rikta miRNA eller proteiner för att utöva gen- eller proteinkontroll. | Riktning mot specifika bindningsplatser för miRNA eller proteiner kan upprepa sekvenserna av bindningsplatsen. |
Yaohai Bio-Pharma lanserade kontrollprodukten förstärkt grön fluorescerande protein (eGFP) circRNA, som baseras på PIE-systemet för att uppnå cyklering av RNA.
Med hjälp av ett konventionellt transfectionsmedel transfekteras eGFP circRNA till 293T-cellerna, och efter 24 timmar kan eGFP (grön) fluorescerande signal upptäckas, vilket förstärks efter 48 timmar. Den fluorescerande signalen kan fortfarande upptäckas på sjunde dagen och fjortonde dagen efter transfectionen.
In vitro uttrycksverifiering av eGFP circRNA