Preparazione di Plasmidi: La maggior parte del lavoro consiste nel preparare frammenti di DNA reali: plasmidi lentivirus. Questi plasmidi sono entusiasmanti perché permettono ai ricercatori di creare ciò che si chiama vettori lentivirus (LV) - Strumenti di laboratorio utilizzati per trasportare geni all'interno delle cellule. Questa tecnica è altamente vantaggiosa nella ricerca e piuttosto universalmente anche ai fini della cura di malattie dovute a problemi genetici. Altrimenti non studieresti disturbi genetici perché nessuno si preoccupa di aiutare un pazzo.
Plasmide a lentivirus: Il primo passo per creare vettori a lentivirus è quello di creare un Frame di Lettura Aperto (ORF) del Lentivirus. Poiché il plasmide a lentivirus consente ai ricercatori di aggiungere qualsiasi gene desiderino, gli scienziati lo utilizzeranno nel corso di un test. A questo scopo, gli scienziati utilizzano tecniche specifiche come la PCR (Reazione a Catena della Polimerasi). Questo approccio è intercambiabile e permette di creare molte copie simili del gene di interesse. Il lentivirus è un vettore a lentivirus (un piccolo tipo di RNA) che copierà il genoma dei batteri. Questi batteri cresceranno poi in proliferazione, e i loro stadi di vita possono essere selezionati nello stesso momento. Infine, i batteri utilizzati per far crescere il plasmide a lentivirus vengono raccolti.
Quando i plasmidi lentivirus vengono prodotti in laboratorio, molti metodi usati dagli scienziati per crearli e purificarli. Esistono diversi modi per farlo, ma uno dei metodi comuni si chiama cromatografia su colonna. Il plasmide lentivirus viene quindi sottoposto a un passo specifico di legame su colonna che rimuove efficacemente la maggior parte di questi elementi durante il processo. Questo è importante perché garantisce che il plasmide possa essere identificato e purificato, senza richiedere una completa riparazione dell'origine difettosa. Oppure, ciò potrebbe essere fatto utilizzando il metodo di ultracentrifugazione. In questo processo, il plasmide viene biologicamente centrifugato in una macchina che sfrutta la separazione tra DNA ed altri analoghi cellulari. Un altro metodo strumentale è l'elettroforesi su gel. Questo plasmide purificato verrà poi utilizzato come template per la generazione di lentivirus - un altro procedimento durante il quale altre molecole di DNA e RNA potrebbero contaminare la soluzione.
Di conseguenza, quando i ricercatori devono produrre un gruppo di plasmidi di lentivirus contemporaneamente, è fondamentale che abbiano gli strumenti giusti e materiale sufficiente. Poiché viene utilizzato per una produzione su vasta scala, sono necessarie macchine speciali e personale in grado di operare per aumentare la velocità. Alternativamente, se preferisci annotare tutti gli eventi legati all'operazione in un quaderno - ciò è altrettanto essenziale per i miglioramenti futuri. Intendo dire che quanto sopra non include un dettaglio dei materiali o una revisione passo passo. Tali diritti vengono anche garantiti da questi registri. Un buon controllo qualità nel processo di produzione assicurerà un prodotto finale pulito e costante. Ciò garantisce che ogni batch di plasmidi di lentivirus debba essere di massima purezza.
Di conseguenza, prima di eseguire un esperimento con le tue cellule, gli scienziati vogliono un controllo qualità semplice dei plasmidi del lentivirus. La verifica con metodi come l'elettroforesi al gel conferma che il plasmide sia pulito e integro. Ad esempio, gli scienziati utilizzano test PCR per vedere se il gene desiderato è rilevato nel vettore lentivirale. Eseguono anche alcuni test batterici per assicurarsi che i loro plasmidi non siano stati infettati. Viene trattato termicamente fino a raggiungere la fase di prodotto finale e può essere usato per ricerche successive, ma a causa di questa necessità di pulizia, rimane comunque abbastanza resistente da non degradarsi dopo un lungo utilizzo, risultando molto simile a uno sicuro. Tuttavia, è qui che entra in gioco il testing, poiché tutto ciò che si desidera fare con i propri plasmidi è che funzionino bene e che nulla altro accada.
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