Kodonoptimalizálási stratégiák

64 genetikai kodon létezik, ebből 60 20 aminosavat kódol. Minden fehérjeexpresszióra vagy -termelésre használt organizmus (beleértve az Escherichia colit, az élesztőt, az emlőssejteket, a pichiát, a növényi sejteket és a rovarsejteket) bizonyos fokú eltérést vagy preferenciát mutat a kodonhasználatban. A gazdaszervezetben leggyakrabban használt kodonokat optimális kodonoknak, míg a nem gyakran használt kodonokat ritka vagy alacsony használatú kodonoknak nevezzük.

Kodon optimalizálás

A kodonoptimalizálás magában foglalja a génszekvencia módosítását előnyben részesített kodonok felhasználásával és az alacsony felhasználású vagy ritka kodonok elkerülésével, majd a módosított gén génszintézissel történő kinyerését. A gének ezen újratervezését kodonoptimalizálásnak nevezik.

Az optimalizált génszekvencia növelheti az mRNS másodlagos szerkezetének stabilitását, megakadályozva a transzlációs késéseket, a transzlációs idő előtti terminációt, a transzlációs kereteltolódást és az elégtelen tRNS-készletek miatti aminosav-hibákat.

Az optimalizálás azért jelentős, mert elősegíti az olyan folyamatok hatékony előrehaladását, mint a génszintézis, a vektorépítés, a transzkripció és a transzláció.

Optimalizálási tényezők

GC tartalom kiegyensúlyozása: Ez befolyásolja a kötési stabilitást, a lágyítási hőmérsékletet és a fehérjehozamot.

Az ismétlődő sorozatok csökkentése: Ez csökkenti a génszintézis nehézségét.

Az mRNS másodlagos szerkezetének beállítása: A fordítást befolyásoló hajtűszerkezetek elkerülése érdekében.

A restrikciós enzim hasítási helyek kiküszöbölése: A gén integritásának védelme érdekében.

Kodonpreferencia: A donor gén optimalizálása a gazdaszervezet szerint a fehérje expresszió maximalizálása érdekében.

Yaohai támogatása

A géntervezéshez és -szintézishez a puszta fehérjeexpresszió és a kodonoptimalizálás nem elegendő. Különböző módszerek és programok különböző kodonoptimalizált mRNS-szekvenciákat tervezhetnek és állíthatnak elő. A fenti optimalizálási tényezőkre alapozva, hivatalos adatbázisával kombinálva, és a több éves génszintézis tapasztalatait összegezve a Yaohai Bio-Pharma kifejlesztette egyedülálló kodonoptimalizáló adatbázisát. Ingyenes kodonoptimalizálást és génszintézisséma-tervezést biztosíthat a génszekvencia kodonoptimalizálásának maximalizálása érdekében.

A Yaohai Bio-Pharma lineáris mRNS- és cirkuláris mRNS-szintézis-technológiák teljes készletét hozta létre, hogy kiváló minőségű RNS-t biztosítson, például szekvenciatervezést és -optimalizálást, génszintézist, IVT-t, cirkularizációt, RNS-tisztítást és LNP-kapszulázást.

Aktívan keresünk intézményi vagy egyéni globális partnereket is. Az iparág legversenyképesebb javadalmazását kínáljuk. Ha kérdése van, forduljon hozzánk bizalommal: [email protected]

A Yaohai Bio-Pharma további részleteiért kérjük, látogasson el weboldalunkra: www.yaohaibio-pharma.com