Strategie optimalizace kodonů

Existuje 64 genetických kodonů, z nichž 60 kódují 20 aminokyselinami. Každý organismus používaný pro expresi nebo produkci proteinů (včetně Escherichia coli, kvasinek, savcích buněk, Pichie, rostlinných buněk a hmyzích buněk) vykazuje určitou míru rozdílu nebo preferencí v používání kodonů. Kodony nejčastěji používané v hostiteli se nazývají optimální kodony, zatímco ty málo používané se nazývají vzácné nebo málo používané kodony.

Optimalizace kodonů

Optimalizace kodonů spočívá v úpravě genomové sekvence pomocí preferovaných kodonů a vyhnutí se málo používaným nebo vzácným kodonům, přičemž modifikovaný gen je pak získán prostřednictvím syntézy genu. Tento redesign genů se označuje jako optimalizace kodonů.

Optimalizovaná genomová sekvence může zlepšit stabilitu sekundární struktury mRNA, což zabrání prodlevám při transkripci, předčasnému ukončení transkripce, posunutí čtecího rámečku při transkripci a nesouladům v aminokyselinách kvůli nedostatečným zásobám tRNA.

Optimalizace je důležitá, protože usnadňuje efektivní průběh procesů, jako je syntéza genu, konstrukce vektoru, transkripcí a překlad.

Faktory optimalizace

Vyvážení obsahu GC: To ovlivňuje stabilitu vazeb, teplotu anealingu a výnos bílkoviny.

Snížení opakujících se sekvencí: To snižuje obtížnost syntézy genu.

Upravení sekundární struktury mRNA: Aby se zabránilo tvorbě vlásničkovitých struktur, které ovlivňují překlad.

Zrušení střihacích míst pro restrikční enzymy : Aby se zachovala integrity genu.

Předvolba kodonů: Optimalizace dárcovského genu podle hostitele pro maximalizaci expresního proteinky.

Podpora Yaohai

Pro návrh a syntézu genu nestačí pouze expresní produkce proteinu a optimalizace kodonů. Různé metody a programy mohou navrhnout a vyrobit různé kodonově optimalizované mRNA sekvence. Na základě uvedených faktorů optimalizace, kombinovaných s jejich oficiální databází a shrnutím let zkušeností v syntéze genů, společnost Yaohai Bio-Pharma vyvinula svůj jedinečný systém pro optimalizaci kodonů. Může Vám poskytnout zdarma optimalizaci kodonů a návrh syntézy genu pro maximalizaci optimalizace kodonů ve vaší genomické sekvenci.

Společnost Yaohai Bio-Pharma vybudovala kompletní sadu technologií pro syntézu lineární a kruhové mRNA, která poskytuje kvalitní RNA, jako je návrh a optimalizace sekvencí, syntéza genu, IVT, circularizace, čištění RNA a encapsulace LNP.

Hledáme také aktivně globální partnery, jak institucionální, tak jednotlivce. Nabízíme nejvyšší odškodnění v odvětví. Pokud máte jakékoli otázky, neváhejte nás kontaktovat: [email protected]

Pro více podrobností o Yaohai Bio-Pharma se prosím podívejte na naši stránku: www.yaohaibio-pharma.com