Strategie optimalizace kodonů

Existuje 64 genetických kodonů, z nichž 60 kóduje 20 aminokyselin. Každý organismus použitý pro expresi nebo produkci proteinu (včetně Escherichia coli, kvasinek, savčích buněk, Pichia, rostlinných buněk a hmyzích buněk) vykazuje určitý stupeň rozdílu nebo preference v použití kodonů. Kodony nejčastěji používané v hostiteli se nazývají optimální kodony, zatímco ty, které se často nepoužívají, se nazývají vzácné nebo málo používané kodony.

Optimalizace kodonů

Optimalizace kodonů zahrnuje modifikaci genové sekvence využitím preferovaných kodonů a vyhýbání se málo používaným nebo vzácným kodonům a pak získání modifikovaného genu prostřednictvím genové syntézy. Toto přepracování genů se nazývá optimalizace kodonů.

Optimalizovaná genová sekvence může zvýšit stabilitu sekundární struktury mRNA, zabránit zpoždění translace, předčasnému ukončení translace, posunu translačního rámce a neshodám aminokyselin kvůli nedostatečným zásobám tRNA.

Optimalizace je významná, protože usnadňuje efektivní postup procesů, jako je syntéza genů, konstrukce vektorů, transkripce a translace.

Optimalizační faktory

Vyrovnávání obsahu GC: To ovlivňuje stabilitu vazby, teplotu nasedání a výtěžek proteinu.

Omezení opakujících se sekvencí: To snižuje obtížnost syntézy genů.

Úprava sekundární struktury mRNA: Aby se zabránilo vlásenkovým strukturám, které ovlivňují překlad.

Eliminace míst štěpení restrikčními enzymy: K ochraně integrity genu.

Preference kodonů: Optimalizace donorového genu podle hostitele pro maximalizaci exprese proteinu.

Yaohaiova podpora

Pro genový design a syntézu nestačí pouhá proteinová exprese a optimalizace kodonů. Různé metody a programy mohou navrhnout a produkovat různé kodonově optimalizované sekvence mRNA. Na základě výše uvedených optimalizačních faktorů v kombinaci s oficiální databází a shrnutím let zkušeností se syntézou genů vyvinula společnost Yaohai Bio-Pharma svou jedinečnou databázi optimalizace kodonů. Může vám poskytnout bezplatnou optimalizaci kodonů a návrh schématu syntézy genů pro maximalizaci optimalizace kodonů vaší genové sekvence.

Společnost Yaohai Bio-Pharma vytvořila kompletní sadu technologií lineární mRNA a cirkulární syntézy mRNA, které poskytují vysoce kvalitní RNA, jako je sekvenční návrh a optimalizace, genová syntéza, IVT, cirkularizace, purifikace RNA a zapouzdření LNP.

Aktivně také hledáme institucionální nebo individuální globální partnery. Nabízíme nejkonkurenceschopnější kompenzaci v oboru. Máte-li jakékoli dotazy, neváhejte nás kontaktovat: [email protected]

Pro více podrobností o Yaohai Bio-Pharma prosím navštivte naše webové stránky: www.yaohaibio-pharma.com