Стратегії оптимізації кодонів

Існує 64 генетичних кодони, з яких 60 кодують 20 амінокислот. Кожна організмена система, використовувана для експресії або виробництва білків (включаючи Escherichia coli, дріжджі, сицеві клітини, Pichia, рослинні клітини та насекомотільні клітини), виявляє певну ступінь відмінності або переваги у використанні кодонів. Найчастіше використовувані кодони в господарському організмі називаються оптимальними кодонами, тоді як ті, що використовуються рідше, - рідкими або маловикористовуваними кодонами.

Оптимізація кодонів

Оптимізація кодонів включає модифікацію генетичної послідовності шляхом використання переважних кодонів та уникнення маловикористовуваних або рідких кодонів, а потім отримання модифікованого гена через синтез гену. Цей перепроект генів називається оптимізацією кодонів.

Оптимізована генна послідовність може покращити стабільність вторинної структури мРНК, запобігаючи затримкам трансляції, преждчасному завершенню трансляції, зсуваю транслатаційного рамки та несумісностям амінокислот через недостатньої кількості tRNA.

Оптимізація є значущою, оскільки вона сприяє ефективному прогресу процесів, таких як синтез генів, побудова вектора, транскрипція і трансляція.

Фактори оптимізації

Вирівнювання GC-змісту: Це впливає на стабільність зв'язування, температуру анеліювання та виробництво белка.

Зменшення повторюваних послідовностей: Це зменшує складність синтезу генів.

Коригування вторинної структури mRNA: Щоб уникнути структур хвостиків, які впливають на трансляцію.

Вилучення місць розрізання обмежуючими ензимами : Щоб захистити цілісність гену.

Перевага кодонів: Оптимізація донорського гена відповідно до господаря для максимального вираження білка.

Підтримка Yaohai

Для дизайну та синтезу генів, просте вираження білка та оптимізація кодонів недостатні. Різні методи та програми можуть проектувати та виробляти різні mRNA-секвенції з оптимізованими кодонами. На основі наведених факторів оптимізації, поєднано з офіційною базою даних, та підсумовуючи роки досвіду у синтезі генів, компанія Yaohai Bio-Pharma розробила свою унікальну базу даних для оптимізації кодонів. Вона може надати вам безкоштовну оптимізацію кодонів та проектування схеми синтезу генів для максимальної оптимізації вашої генетичної секвенції.

Yaohai Bio-Pharma створила повний набір технологій синтезу лінійного mRNA та циркулярного mRNA для забезпечення високоякісним RNA, такими як дизайн та оптимізація секвенцій, синтез генів, IVT, циркуляризація, очищення RNA та енкапсуляція LNP.

Ми також активно шукаємо глобальних партнерів серед установ або окремих осіб. Ми пропонуємо найбільш конкурентоспроможну компенсацію в галузі. Якщо в вас є будь-які питання, будь ласка, не соромтеся звертатися до нас: [email protected]

Для отримання більш детальної інформації про Yaohai Bio-Pharma, будь ласка, подивіться на нашому сайті: www.yaohaibio-pharma.com