Стратегії оптимізації кодонів

Існує 64 генетичних кодону, з яких 60 кодують 20 амінокислот. Кожен організм, який використовується для експресії або виробництва білка (включаючи Escherichia coli, дріжджі, клітини ссавців, Pichia, рослинні клітини та клітини комах), демонструє певну різницю або перевагу у використанні кодонів. Кодони, які найчастіше використовуються в хазяїні, називаються оптимальними кодонами, тоді як ті, що не використовуються часто, називаються рідкісними або маловживаними кодонами.

Оптимізація кодону

Оптимізація кодонів передбачає модифікацію генної послідовності шляхом використання переважних кодонів і уникнення маловикористовуваних або рідкісних кодонів, а потім отримання модифікованого гена за допомогою генного синтезу. Ця перебудова генів називається оптимізацією кодонів.

Оптимізована генна послідовність може підвищити стабільність вторинної структури мРНК, запобігаючи затримкам трансляції, передчасному припиненню трансляції, трансляційному зсуву кадрів і невідповідності амінокислот через недостатні пули тРНК.

Оптимізація є важливою, оскільки вона сприяє ефективному прогресуванню таких процесів, як синтез генів, побудова вектора, транскрипція та трансляція.

Фактори оптимізації

Балансування вмісту GC: Це впливає на стабільність зв'язування, температуру відпалу та вихід білка.

Зменшення повторюваних послідовностей: Це зменшує труднощі синтезу генів.

Коригування вторинної структури мРНК: Щоб уникнути шпильок, які впливають на переклад.

Усунення місць розрізу ферментів рестрикції: Для захисту цілісності гена.

Перевага кодону: Оптимізація гена донора відповідно до хазяїна для максимізації експресії білка.

Підтримка Yaohai

Для дизайну та синтезу генів простої експресії білка та оптимізації кодонів недостатньо. Різні методи та програми можуть проектувати та виробляти різні послідовності мРНК, оптимізовані за кодонами. Базуючись на наведених вище факторах оптимізації в поєднанні з офіційною базою даних і підсумовуючи багаторічний досвід синтезу генів, Yaohai Bio-Pharma розробила свою унікальну базу даних оптимізації кодонів. Він може надати вам безкоштовну оптимізацію кодонів і схему синтезу генів для максимальної оптимізації кодонів вашої генної послідовності.

Компанія Yaohai Bio-Pharma розробила повний набір технологій лінійного синтезу мРНК і кільцевої мРНК для забезпечення високоякісної РНК, наприклад, проектування та оптимізація послідовності, синтез генів, IVT, циркуляризація, очищення РНК та інкапсуляція LNP.

Ми також активно шукаємо інституційних або індивідуальних глобальних партнерів. Ми пропонуємо найконкурентнішу компенсацію в галузі. Якщо у вас виникли запитання, зв’яжіться з нами: [email protected]

Для отримання додаткової інформації про Yaohai Bio-Pharma, будь ласка, перейдіть на наш веб-сайт: www.yaohaibio-pharma.com