Conform dogmei centrale, ARN-ul mesager (ARNm) este puntea pentru transmiterea materialului genetic de la ADN la proteine.
ARNm joacă un rol biologic prin codificarea proteinelor in vivo, iar ARNm matur în organismele eucariote constă din cinci componente: 5' Cap (structura capacului), 5' UTR (regiune necodifică), ORF (cadru de citire deschis), 3ʹ UTR și 3' coadă poliA (coadă poliadenilat).
Proces | Service optional | Detalii despre servicii | Perioada de livrare (zi) |
Proiectarea și optimizarea secvenței ARNm | Proiectarea si optimizarea secventelor de codare |
Alinierea secvenței CDS Optimizarea codonului CDS |
1 |
Proiectarea si optimizarea secventelor necodante |
Proiectarea și optimizarea secvenței UTR de 5' Proiectarea și optimizarea secvenței UTR de 3' proiectarea și optimizarea secvenței polyA |
1-2 |
5' UTR/3' UTR |
|
3' Coada PolyA |
|
Componente ARNm | Funcții biologice | Strategii de optimizare |
5' Cap | Protejează ARNm de degradarea de către exonucleaze și acționează împreună cu coada poliA de la capătul 3’, proteina de legare a poliA și proteina factorului de inițiere a translației pentru a iniția translația proteinei. | Structura naturală Cap1 evită receptorii de recunoaștere a modelelor și, astfel, reduce răspunsul imun natural, care poate fi obținut printr-o limitare co-transcripțională într-un singur pas sau plafonare enzimatică în două etape [vezi plafonarea enzimatică ARNm și plafonarea co-transcripțională pentru detalii]. |
5' UTR | UTR-ul 5' poate fi recunoscut de ribozomi, poate regla translația ARNm și poate afecta stabilitatea ARNm. | Conțin secvențe Kozak fără o structură secundară foarte stabilă. UTR-urile naturale ale genelor înalt exprimate sunt preferate pentru ARNm de transcripție in vitro (IVT) cum ar fi a-globină și p-globină. |
CDS | Regiuni care codifică proteine și secvențe de codificare pentru antigeni, anticorpi sau alte proteine funcționale. | Optimizarea codonilor crește nivelul de traducere, observând că anumiți codoni non-optimi pot juca un rol în plierea proteinelor. |
3' UTR | Reglează translația și stabilitatea ARNm. | UTR-urile naturale ale genelor înalt exprimate sunt preferate pentru ARNm IVT, cum ar fi a-globina și p-globina. |
3' polyA coada | Reglează expresia proteinelor și protejează structura capacului de degradare. | Este necesară o lungime adecvată (100-150 bp); codificarea cozii poliA pe plasmida șablon de transcripție asigură o lungime a cozii poliA mai definită. |
Surse multiple de biblioteci UTR naturale și modificate înalt exprimate; strategie matură de modificare a UTR;
Cooperați cu o echipă profesionistă de algoritmi AI pentru a finaliza optimizarea codonilor.
Adăugați secvențe poliA conform șablonelor ADN pentru a controla lungimea ARNm mai precis.
Obține o expresie eficientă a ARNm cu imunogenitate scăzută.
Proiectarea secvenței unui ARNm cu raportor dublu: ARNm mCherry-eGFP
Serviciul ARNm de la Yaohai Bio-Pharma continuă să fie modernizat cu proiectarea și optimizarea unei secvențe tandem de gene reporter duble, care realizează co-exprimarea genelor duale.
Folosind un reactiv de transfecție convențional, secvența dublă de gene tandem mCherry-eGFP mRNA este transfectată în celule 293T și două semnale fluorescente de mCherry (roșu) și proteină fluorescentă verde îmbunătățită (eGFP) sunt detectate cu expresie simultană după 48 de ore și stivuitul graficul este evidențiat cu galben.
Exprimarea mARN-ului mCherry-eGFP în celula 293T