Volgens het centrale dogma is messenger RNA (mRNA) de brug voor de overdracht van genetisch materiaal van DNA naar eiwitten.
mRNA speelt een biologische rol door eiwitten te coderen in levende organismen, en volwassen mRNA bij eukaryoten bestaat uit vijf componenten: 5' Cap (kapstructuur), 5' UTR (niet-coderende regio), de ORF (open reading frame), 3' UTR en 3' polyA staart (polyadenylaatstaart).
Proces | Optionele Diensten | Service Details | Leveringstermijn (dagen) |
ontwerp en optimalisatie van mRNA-sequentie | Ontwerp en optimalisatie van coderende sequenties |
CDS sequentieuitlijning CDS Codon Optimalisatie |
1 |
Ontwerp en optimalisatie van niet-coderende volgordes |
ontwerp en optimalisatie van 5' UTR-sequentie ontwerp en optimalisatie van 3' UTR-sequentie ontwerp en optimalisatie van polyA-sequentie |
1-2 |
5’ UTR/3’ UTR |
|
3' PolyA Staart |
|
mRNA-Componenten | Biologische functies | Optimalisatiestrategieën |
5’ Kap | Bescherm mRNA tegen afbraak door exonucleasen en werk samen met de polyA-staart aan het 3' einde, polyA-bindend eiwit en vertaalinitiërfactor om eiwitranslatie te initiëren. | De natuurlijke Cap1-structuur vermijdt patroonherkenningsreceptoren en vermindert zo het natuurlijke immuunantwoord, wat kan worden bereikt door eenetraps co-transcriptioneel capping of tweetraps enzymatisch capping [zie mRNA enzymatisch capping en co-transcriptioneel capping voor details]. |
5’ UTR | De 5' UTR kan worden herkend door ribosomen, de vertaling van mRNA reguleren en de stabiliteit van mRNA beïnvloeden. | Bevatten Kozak-sequenties zonder een zeer stabiele secondaire structuur. Natuurlijke UTRs van sterk uitgedrukte genen zijn voor te korten voor in vitro transcripcie (IVT) mRNA, zoals α-globine en β-globine. |
CDS | Regio's die eiwitten coderen en coderende volgordes voor antigenen, antilichamen of andere functionele eiwitten. | Codonoptimalisatie verhoogt het vertaalsniveau, waarbij opgemerkt wordt dat bepaalde niet-optimale codons een rol kunnen spelen in de eiwitvouwing. |
3' UTR | Reguleren mRNA-translatie en stabiliteit. | Natuurlijke UTRs van sterk uitgedrukte genen zijn voor te korten voor IVT mRNA, zoals α-globine en β-globine. |
3' polyA staart | Reguleren eiwitexpressie en beschermen de capstructuur tegen afbraak. | Een voldoende lengte (100-150 bp) is vereist; codering van de polyA-staart op het transcriptietemplaatplasmid zorgt ervoor dat er een beter gedefinieerde polyA-staartlengte is. |
Meerdere bronnen van sterk uitgedrukte natuurlijke & gewijzigde UTR-bibliotheken; volwassen UTR-wijzigingsstrategie;
Samenwerken met een professioneel AI-algoritmeteam om de optimalisatie van codons af te ronden.
Voeg polyA-sequenties toe op basis van DNA-sjablonen om de lengte van mRNA nauwkeuriger te beheersen.
Realiseer efficiënte expressie van mRNA met lage immunogeniteit.
Sequentieontwerp van een Dual-reporter mRNA: mCherry-eGFP mRNA
Yaohai Bio-Pharma’s mRNA-service blijft worden bijgewerkt met het ontwerp en optimaliseren van een dubbele reportergeen-tandemsequentie, wat de co-expressie van twee genen mogelijk maakt.
Met behulp van een conventioneel transfectiereagens wordt de dubbele gen-tandemvolgorde mCherry-eGFP mRNA getransfereerd in 293T-cellen, en twee fluorescerende signalen van mCherry (rood) en versterkte groene fluorescente eiwit (eGFP) worden na 48 uur met gelijktijdige expressie gedetecteerd, en de gestapelde grafiek wordt in geel gemarkeerd.
Expressie van mCherry-eGFP mRNA in 293T-cel